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Yorodumi- PDB-5ten: Structure of 4-Hydroxy-tetrahydrodipicolinate Reductase from Vibr... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5ten | ||||||
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Title | Structure of 4-Hydroxy-tetrahydrodipicolinate Reductase from Vibrio vulnificus with 2,5 Furan Dicarboxylic and NADH with Intact Polyhistidine Tag | ||||||
Components | 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / Lysine Biosynthesis | ||||||
Function / homology | Function and homology information 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase / oxidoreductase activity, acting on CH or CH2 groups, NAD or NADP as acceptor / 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase / diaminopimelate biosynthetic process / lysine biosynthetic process via diaminopimelate / NAD binding / NADP binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Vibrio vulnificus (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.45 Å | ||||||
Authors | Mank, N. / Pote, S. / Arnette, K. / Klapper, V. / Chruszcz, M. | ||||||
Citation | Journal: Biochim Biophys Acta Gen Subj / Year: 2021 Title: Comparative structural and mechanistic studies of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductases from Mycobacterium tuberculosis and Vibrio vulnificus. Authors: Pote, S. / Kachhap, S. / Mank, N.J. / Daneshian, L. / Klapper, V. / Pye, S. / Arnette, A.K. / Shimizu, L.S. / Borowski, T. / Chruszcz, M. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5ten.cif.gz | 801.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5ten.ent.gz | 669.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5ten.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/te/5ten ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/te/5ten | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 5tejC 5tekC 5temC 5tjyC 5tjzC 5ugvC 5us6C 1arzS C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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