- PDB-5e4n: 3-Deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from Mycobac... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5e4n
タイトル
3-Deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from Mycobacterium tuberculosis with D-tyrosine bound in the tyrosine and phenylalanine binding sites
温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.1 M TRIS-HCL, PH 7.5, 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 12% V/V GLYCEROL. CRYSTALS WERE SOAKED IN THE SAME SOLUTION WITH AN ADDITIONAL 10% V/V GLYCEROL AND 5 MM D-TYROSINE FOR 24 HRS
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データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: Australian Synchrotron / ビームライン: MX1 / 波長: 0.9537 Å
検出器
タイプ: ADSC QUANTUM 210r / 検出器: CCD / 日付: 2013年2月7日
放射
モノクロメーター: SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
解像度: 2.05→47.37 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.953 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.938 / WRfactor Rfree: 0.1738 / WRfactor Rwork: 0.1508 / FOM work R set: 0.8883 / SU B: 5.509 / SU ML: 0.077 / SU R Cruickshank DPI: 0.0304 / SU Rfree: 0.0287 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.03 / ESU R Free: 0.029 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2287
5048
5 %
RANDOM
Rwork
0.1989
-
-
-
obs
0.2004
96174
99.98 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK