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- PDB-2obo: Structure of HEPATITIS C VIRAL NS3 protease domain complexed with... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 2obo
タイトルStructure of HEPATITIS C VIRAL NS3 protease domain complexed with NS4A peptide and ketoamide SCH476776
要素
  • HCV NS3 protease
  • HCV NS4A peptide
キーワードHYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / ketoamide inhibitor / Viral Protein (ウイルスタンパク質) / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex
機能・相同性
機能・相同性情報


self proteolysis / host cell mitochondrial membrane / host cell lipid droplet / symbiont-mediated suppression of host TRAF-mediated signal transduction / transformation of host cell by virus / symbiont-mediated perturbation of host cell cycle G1/S transition checkpoint / host cell membrane / : / symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT1 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity ...self proteolysis / host cell mitochondrial membrane / host cell lipid droplet / symbiont-mediated suppression of host TRAF-mediated signal transduction / transformation of host cell by virus / symbiont-mediated perturbation of host cell cycle G1/S transition checkpoint / host cell membrane / : / symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT1 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / serine-type peptidase activity / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / lipid droplet / virion component / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / viral nucleocapsid / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / RNA helicase activity / host cell perinuclear region of cytoplasm / host cell endoplasmic reticulum membrane / symbiont-mediated suppression of host type I interferon-mediated signaling pathway / symbiont entry into host cell / ribonucleoprotein complex / induction by virus of host autophagy / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / serine-type endopeptidase activity / fusion of virus membrane with host endosome membrane / エンベロープ (ウイルス) / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / structural molecule activity / タンパク質分解 / RNA binding / zinc ion binding / ATP binding / 生体膜 / metal ion binding / 細胞膜 / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Thrombin, subunit H - #120 / Hepatitis C virus core protein, chain A superfamily / Hepatitus C virus, Non-structural 5a protein, C-terminal / Hepatitis C virus NS5A, 1B domain superfamily / Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain / Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain / Hepatitis C virus non-structural protein NS2 / HCV NS5a protein C-terminal region / Hepatitis C virus, Non-structural protein NS4b / Hepatitis C virus, Core protein, N-terminal ...Thrombin, subunit H - #120 / Hepatitis C virus core protein, chain A superfamily / Hepatitus C virus, Non-structural 5a protein, C-terminal / Hepatitis C virus NS5A, 1B domain superfamily / Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain / Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain / Hepatitis C virus non-structural protein NS2 / HCV NS5a protein C-terminal region / Hepatitis C virus, Non-structural protein NS4b / Hepatitis C virus, Core protein, N-terminal / Hepatitis C virus non-structural protein NS4b / Hepatitis C virus capsid protein / Hepatitis C virus, Non-structural protein NS2 / Hepatitis C virus, Non-structural 5a protein / Hepatitis C virus, Non-structural 5a protein, domain 1a / Hepatitis C virus non-structural 5a, 1B domain / NS5A domain 1a superfamily / Hepatitis C virus non-structural 5a protein membrane anchor / Hepatitis C virus non-structural 5a zinc finger domain / Hepatitis C virus non-structural 5a domain 1b / Hepacivirus nonstructural protein 2 (NS2) protease domain profile. / Hepatitis C virus, Non-structural protein NS4a / Hepatitis C virus non-structural protein NS4a / Hepatitis C virus, Core protein, C-terminal / Hepatitis C virus core protein / Hepatitis C virus, Non-structural protein E2/NS1 / Hepatitis C virus non-structural protein E2/NS1 / Hepatitis C virus, Envelope glycoprotein E1 / Hepatitis C virus envelope glycoprotein E1 / RNA dependent RNA polymerase, hepatitis C virus / Viral RNA dependent RNA polymerase / Hepatitis C virus, NS3 protease, Peptidase S29 / Hepatitis C virus NS3 protease / Hepacivirus/Pegivirus NS3 protease domain profile. / DEAD box, Flavivirus / Flavivirus DEAD domain / Trypsin-like serine proteases / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / Thrombin, subunit H / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / Peptidase S1, PA clan, chymotrypsin-like fold / Peptidase S1, PA clan / DNA/RNA polymerase superfamily / Βバレル / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
TERT-BUTYL [(1S)-1-{[(1R,2S,5S)-2-({[(1S)-3-AMINO-1-(CYCLOPROPYLMETHYL)-2,3-DIOXOPROPYL]AMINO}CARBONYL)-6,6-DIMETHYL-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEX-3-YL]CARBONYL}-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE / 2-メルカプトエタノール / Chem-HUD / NS3 protease / Genome polyprotein
類似検索 - 構成要素
生物種Hepatitis C virus (ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 2.6 Å
データ登録者Prongay, A.J. / Guo, Z. / Yao, N. / Fischmann, T. / Strickland, C. / Myers Jr., J. / Weber, P.C. / Malcolm, B. / Beyer, B.M. / Ingram, R. ...Prongay, A.J. / Guo, Z. / Yao, N. / Fischmann, T. / Strickland, C. / Myers Jr., J. / Weber, P.C. / Malcolm, B. / Beyer, B.M. / Ingram, R. / Pichardo, J. / Hong, Z. / Prosise, W.W. / Ramanathan, L. / Taremi, S.S. / Yarosh-Tomaine, T. / Zhang, R. / Senior, M. / Yang, R. / Arasappan, A. / Bennett, F. / Bogen, S.F. / Chen, K. / Jao, E. / Liu, Y. / Love, R.G. / Saksena, A.K. / Venkatraman, S. / Girijavallabhan, V. / Njoroge, F.G. / Madison, V.
引用
ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2007
タイトル: Discovery of the HCV NS3/4A protease inhibitor (1R,5S)-N-[3-amino-1-(cyclobutylmethyl)-2,3-dioxopropyl]-3- [2(S)-[[[(1,1-dimethylethyl)amino]carbonyl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxobutyl]- ...タイトル: Discovery of the HCV NS3/4A protease inhibitor (1R,5S)-N-[3-amino-1-(cyclobutylmethyl)-2,3-dioxopropyl]-3- [2(S)-[[[(1,1-dimethylethyl)amino]carbonyl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxobutyl]- 6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-2(S)-carboxamide (Sch 503034) II. Key steps in structure-based optimization.
著者: Prongay, A.J. / Guo, Z. / Yao, N. / Pichardo, J. / Fischmann, T. / Strickland, C. / Myers Jr., J. / Weber, P.C. / Beyer, B.M. / Ingram, R. / Hong, Z. / Prosise, W.W. / Ramanathan, L. / ...著者: Prongay, A.J. / Guo, Z. / Yao, N. / Pichardo, J. / Fischmann, T. / Strickland, C. / Myers Jr., J. / Weber, P.C. / Beyer, B.M. / Ingram, R. / Hong, Z. / Prosise, W.W. / Ramanathan, L. / Taremi, S.S. / Yarosh-Tomaine, T. / Zhang, R. / Senior, M. / Yang, R.S. / Malcolm, B. / Arasappan, A. / Bennett, F. / Bogen, S.L. / Chen, K. / Jao, E. / Liu, Y.T. / Lovey, R.G. / Saksena, A.K. / Venkatraman, S. / Girijavallabhan, V. / Njoroge, F.G. / Madison, V.
#1: ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 1996
タイトル: Crystal structure of the hepatitis C virus NS3 protease domain complexed with a synthetic NS4A cofactor peptide.
著者: Kim, J.L. / Morgenstern, K.A. / Lin, C. / Fox, T. / Dwyer, M.D. / Landro, J.A. / Chambers, S.P. / Markland, W. / Lepre, C.A. / O'Malley, E.T. / Harbeson, S.L. / Rice, C.M. / Murcko, M.A. / ...著者: Kim, J.L. / Morgenstern, K.A. / Lin, C. / Fox, T. / Dwyer, M.D. / Landro, J.A. / Chambers, S.P. / Markland, W. / Lepre, C.A. / O'Malley, E.T. / Harbeson, S.L. / Rice, C.M. / Murcko, M.A. / Caron, P.R. / Thomson, J.A.
#2: ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2005
タイトル: Hepatitis C virus NS3-4A serine protease inhibitors: SAR of P'2 moiety with improved potency.
著者: Arasappan, A. / Njoroge, F.G. / Chan, T.Y. / Bennett, F. / Bogen, S.L. / Chen, K. / Gu, H. / Hong, L. / Jao, E. / Liu, Y.T. / Lovey, R.G. / Parekh, T. / Pike, R.E. / Pinto, P. / Santhanam, B. ...著者: Arasappan, A. / Njoroge, F.G. / Chan, T.Y. / Bennett, F. / Bogen, S.L. / Chen, K. / Gu, H. / Hong, L. / Jao, E. / Liu, Y.T. / Lovey, R.G. / Parekh, T. / Pike, R.E. / Pinto, P. / Santhanam, B. / Venkatraman, S. / Vaccaro, H. / Wang, H. / Yang, X. / Zhu, Z. / Mckittrick, B. / Saksena, A.K. / Girijavallabhan, V. / Pichardo, J. / Butkiewicz, N. / Ingram, R. / Malcolm, B. / Prongay, A. / Yao, N. / Marten, B. / Madison, V. / Kemp, S. / Levy, O. / Lim-Wilby, M. / Tamura, S. / Ganguly, A.K.
#3: ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2005
タイトル: Synthesis and biological activity of macrocyclic inhibitors of hepatitis C virus (HCV) NS3 protease.
著者: Chen, K.X. / Njoroge, F.G. / Prongay, A. / Pichardo, J. / Madison, V. / Girijavallabhan, V.
#4: ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2005
タイトル: Hepatitis C virus NS3-4A serine protease inhibitors: use of a P2-P1 cyclopropyl alanine combination for improved potency.
著者: Bogen, S. / Saksena, A.K. / Arasappan, A. / Gu, H. / Njoroge, F.G. / Girijavallabhan, V. / Pichardo, J. / Butkiewicz, N. / Prongay, A. / Madison, V.
#5: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2006
タイトル: Mutations conferring resistance to SCH6, a novel hepatitis C virus NS3/4A protease inhibitor. Reduced RNA replication fitness and partial rescue by second-site mutations.
著者: Yi, M. / Tong, X. / Skelton, A. / Chase, R. / Chen, T. / Prongay, A. / Bogen, S.L. / Saksena, A.K. / Njoroge, F.G. / Veselenak, R.L. / Pyles, R.B. / Bourne, N. / Malcolm, B.A. / Lemon, S.M.
履歴
登録2006年12月19日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02007年7月31日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年7月13日Group: Derived calculations / Version format compliance
改定 1.22012年2月22日Group: Structure summary
改定 1.32012年12月26日Group: Database references / Non-polymer description ...Database references / Non-polymer description / Source and taxonomy / Structure summary
改定 1.42023年8月30日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: HCV NS3 protease
B: HCV NS4A peptide
C: HCV NS3 protease
D: HCV NS4A peptide
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)47,9728
ポリマ－47,2554
非ポリマー7184
水2,432135
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area7830 Å2
ΔGint-125 kcal/mol
Surface area15660 Å2
手法PISA, PQS
単位格子
Length a, b, c (Å)224.271, 224.271, 75.205
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number155
Space group name H-MH32

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要素

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タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 4分子 ACBD

#1: タンパク質 HCV NS3 protease


分子量: 21233.225 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 1027 1207 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Hepatitis C virus (ウイルス) / 属: Hepacivirusヘパシウイルス属 / 遺伝子: HCV / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q91RS4
#2: タンパク質・ペプチド HCV NS4A peptide


分子量: 2394.039 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 1678 1696 / Mutation: C22S / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Hepatitis C virus (ウイルス) / 参照: UniProt: Q9QP06

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非ポリマー , 4種, 139分子

#3: 化合物 ChemComp-ZN / ZINC ION


分子量: 65.409 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#4: 化合物 ChemComp-BME / BETA-MERCAPTOETHANOL / 2-メルカプトエタノ-ル / 2-メルカプトエタノール


分子量: 78.133 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6OS
#5: 化合物 ChemComp-HUD / tert-butyl {(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-{[(2S,3R)-4-amino-1-cyclopropyl-3-hydroxy-4-oxobutan-2-yl]carbamoyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate / ketoamide inhibitor SCH476776, bound form


タイプ: peptide-likeペプチド, Peptide-likeペプチド
クラス: 阻害剤 / 分子量: 508.651 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C26H44N4O6
参照: TERT-BUTYL [(1S)-1-{[(1R,2S,5S)-2-({[(1S)-3-AMINO-1-(CYCLOPROPYLMETHYL)-2,3-DIOXOPROPYL]AMINO}CARBONYL)-6,6-DIMETHYL-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEX-3-YL]CARBONYL}-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE
#6: 水 ChemComp-HOH / water / 水


分子量: 18.015 Da / 分子数: 135 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

非ポリマーの詳細UPON BINDING TO SER A139 THE ALDEHYDE GROUP OF THE STARTING MOLECULE HUD FORMS A HEMIACETAL BONDING ...UPON BINDING TO SER A139 THE ALDEHYDE GROUP OF THE STARTING MOLECULE HUD FORMS A HEMIACETAL BONDING WITH THE PROTEIN

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 3.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 68.04 %
結晶化温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法
詳細: The protein (NS3 complexed with KK-NS4a(21-39)-KK peptide) was at 12-15 mg/ml in 15 mM MES, pH 6.5 1 M NaCl 20 mM b-mercaptoethanol. Hanging Drops were formed by mixing 4:l protein solution ...詳細: The protein (NS3 complexed with KK-NS4a(21-39)-KK peptide) was at 12-15 mg/ml in 15 mM MES, pH 6.5 1 M NaCl 20 mM b-mercaptoethanol. Hanging Drops were formed by mixing 4:l protein solution with 4:l {0.75-1.0 M NaCl, 0.1M Na/K phosphate 0.1 M Mes, pH 5.8-6.1 20 mM b-mercaptoethanol} The drop was equilibrated the drops over 1 ml {(1.25-1.50 M) NaCl - 0.1M Na/K phosphate 0.1 M Mes, pH 5.6-5.8, 20 mM b-mercaptoethanol} , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K

-
データ収集

回折平均測定温度: 95 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 17-ID / 波長: 1 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.6→50 Å / Num. obs: 22055 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 2.2 % / Biso Wilson estimate: 27.999 Å2 / Rsym value: 0.069
反射 シェル解像度: 2.6→2.66 Å / 冗長度: 2.2 % / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / Num. unique all: 1443 / Rsym value: 0.466 / % possible all: 99.3

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
ADSCQuantumデータ収集
X-PLORモデル構築
X-PLOR98.1精密化
HKL-2000データ削減
SCALEPACKデータスケーリング
X-PLOR位相決定
精密化構造決定の手法: フーリエ合成
開始モデル: PDB Entry 2O8M

2o8m


解像度: 2.6→8 Å /
Rfactor反射数
Rfree0.295 1393
Rwork0.178 -
obs-14291
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.6→8 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数2758 0 42 135 2935
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONx_bond_d0.008
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_deg1.937
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_d1.497
LS精密化 シェル解像度: 2.6→2.71 Å
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2807 104 -
Rwork0.4102 --
obs-1025 78.2 %

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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