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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2bxn | ||||||
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タイトル | Human serum albumin complexed with myristate and iodipamide | ||||||
![]() | SERUM ALBUMIN![]() | ||||||
![]() | ![]() ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() cellular response to calcium ion starvation / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ghuman, J. / Zunszain, P.A. / Petitpas, I. / Bhattacharya, A.A. / Curry, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Basis of the Drug-Binding Specificity of Human Serum Albumin. 著者: Ghuman, J. / Zunszain, P.A. / Petitpas, I. / Bhattacharya, A.A. / Otagiri, M. / Curry, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 129.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 100.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2bx8C ![]() 2bxaC ![]() 2bxbC ![]() 2bxcC ![]() 2bxdC ![]() 2bxeC ![]() 2bxfC ![]() 2bxgC ![]() 2bxhC ![]() 2bxiC ![]() 2bxkC ![]() 2bxlC ![]() 2bxmC ![]() 2bxoC ![]() 2bxpC ![]() 2bxqC ![]() 1e7gS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 66571.219 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
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#2: 化合物 | ChemComp-MYR / ![]() #3: 化合物 | ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() 配列の詳細 | SEQUENCE CONTAINS SIGNAL AND PRO-PEPTIDE RESIDUES 1-24 IN DATABASE ENTRY. PROTEIN CRYSTALLISED WAS ...SEQUENCE CONTAINS SIGNAL AND PRO-PEPTIDE RESIDUES 1-24 IN DATABASE ENTRY. PROTEIN CRYSTALLIS | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.53 Å3/Da / 溶媒含有率: 44 % |
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結晶化![]() | pH: 7 / 詳細: pH 7.00 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2001年12月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.65→34.5 Å / Num. obs: 19370 / % possible obs: 97.8 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.7 % / Biso Wilson estimate: 64.7 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 11.4 |
反射 シェル | 解像度: 2.65→2.79 Å / 冗長度: 2.7 % / Rmerge(I) obs: 0.38 / Mean I/σ(I) obs: 3 / % possible all: 99.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1E7G 解像度: 2.65→34.45 Å / Rfactor Rfree error: 0.009 / Data cutoff high absF: 1581835.73 / Isotropic thermal model: GROUP / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: MLF
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: FLAT MODEL / Bsol: 44.4845 Å2 / ksol: 0.291977 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 58.4 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.65→34.45 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.65→2.82 Å / Rfactor Rfree error: 0.033 / Total num. of bins used: 6
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Xplor file |
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