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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zrx | ||||||
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タイトル | solution structure of stomoxyn in H20/TFE 50% | ||||||
![]() | stomoxyn | ||||||
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機能・相同性 | ![]() defense response to fungus / xenobiotic metabolic process / killing of cells of another organism / defense response to bacterium / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Landon, C. / Meudal, H. / Boulanger, N. / Bulet, P. / Vovelle, F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structures of stomoxyn and spinigerin, two insect antimicrobial peptides with an alpha-helical conformation. 著者: Landon, C. / Meudal, H. / Boulanger, N. / Bulet, P. / Vovelle, F. #1: ![]() タイトル: Insect immunity. Constitutive expression of a cysteine-rich antifungal and a linear antibacterial peptide in a termite insect 著者: Lamberty, M. / Zachary, D. / Lanot, R. / Bordereau, C. / Robert, A. / Hoffmann, J.A. / Bulet, P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 130.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 107.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4427.179 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: solid-phase synthesis (Boc). Sequence occurs naturally in Stomoxys calcitrans, Stable fly 参照: UniProt: Q8T9R8 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 | 内容: 2mM stomoxyn / 溶媒系: 50% H2O, 50% TFE |
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試料状態 | pH: 5.3 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル![]() |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ![]() 詳細: the structures are based on a total of 739 distance NOE-derived restraints | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: representative conformer | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy and the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |