+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1wa8 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution Structure of the CFP-10.ESAT-6 Complex. Major Virulence Determinants of Pathogenic Mycobacteria | ||||||
要素 |
| ||||||
キーワード | TUBERCULOSIS (結核) / CFP-10 / ESAT-6 / HELIX-TURN-HELIX (ヘリックスターンヘリックス) / FOUR HELIX BUNDLE / MYCOBACTERIA (マイコバクテリウム属) / PATHOGENESIS / SOLUTION STRUCTURE / PSI / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / TB STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM / TBSGC | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / symbiont-mediated perturbation of host signal transduction pathway / symbiont-mediated suppression of host T-cell mediated immune response / protein secretion by the type VII secretion system / Manipulation of host energy metabolism / host cell surface binding / host cell endoplasmic reticulum / : / host cell membrane / peptidoglycan-based cell wall ...: / symbiont-mediated perturbation of host signal transduction pathway / symbiont-mediated suppression of host T-cell mediated immune response / protein secretion by the type VII secretion system / Manipulation of host energy metabolism / host cell surface binding / host cell endoplasmic reticulum / : / host cell membrane / peptidoglycan-based cell wall / Modulation by Mtb of host immune system / host cell surface / membrane => GO:0016020 / host cell plasma membrane / protein homodimerization activity / extracellular region / 細胞膜 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | MYCOBACTERIUM BOVIS (結核菌) MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (結核菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / CANDID | ||||||
データ登録者 | Renshaw, P.S. / Lightbody, K.L. / Veverka, V. / Muskett, F.W. / Kelly, G. / Frenkiel, T.A. / Gordon, S.V. / Hewinson, R.G. / Burke, B. / Norman, J. ...Renshaw, P.S. / Lightbody, K.L. / Veverka, V. / Muskett, F.W. / Kelly, G. / Frenkiel, T.A. / Gordon, S.V. / Hewinson, R.G. / Burke, B. / Norman, J. / Williamson, R.A. / Carr, M.D. / TB Structural Genomics Consortium (TBSGC) | ||||||
引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 2005 タイトル: Structure and Function of the Complex Formed by the Tuberculosis Virulence Factors Cfp-10 and Esat-6 著者: Renshaw, P.S. / Lightbody, K.L. / Veverka, V. / Muskett, F.W. / Kelly, G. / Frenkiel, T.A. / Gordon, S.V. / Hewinson, R.G. / Burke, B. / Norman, J. / Williamson, R.A. / Carr, M.D. | ||||||
履歴 |
| ||||||
Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1wa8.cif.gz | 1.5 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1wa8.ent.gz | 1.3 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1wa8.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wa/1wa8 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wa/1wa8 | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
類似構造データ | |
---|---|
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10671.546 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 1-99 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: PRODUCED MINUS THE N-TERMINAL MET / 由来: (組換発現) MYCOBACTERIUM BOVIS (結核菌) / 株: AN5 / プラスミド: PET21A / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: O69739, UniProt: P0A567*PLUS |
---|---|
#2: タンパク質 | 分子量: 9908.800 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 1-95 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (結核菌) 株: H37RV / プラスミド: PET28A / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q57165, UniProt: P9WNK7*PLUS |
配列の詳細 | THE SEQUENCE OF CFP-10 IN THE UNIPROT SEQUENCE DATABASE IS 99 AMINO ACIDS LONG, BUT THE SEQUENCE ...THE SEQUENCE OF CFP-10 IN THE UNIPROT SEQUENCE DATABASE IS 99 AMINO ACIDS LONG, BUT THE SEQUENCE PRESENTED IN THE TUBERCULIS |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON 13C, 15N-LABELED CFP-10 AND ESAT-6. |
-試料調製
詳細 | 内容: 90% WATER/10% D2O |
---|---|
試料状態 | イオン強度: 100 mM / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 308.0 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
|
---|
-解析
NMR software |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: CANDID / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 28 |