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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mdq | |||||||||
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タイトル | REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN | |||||||||
![]() | MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN | |||||||||
![]() | SUGAR TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() detection of maltose stimulus / maltose transport complex / ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Sharff, A.J. / Quiocho, F.A. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined structures of two insertion/deletion mutants probe function of the maltodextrin binding protein. 著者: Sharff, A.J. / Rodseth, L.E. / Szmelcman, S. / Hofnung, M. / Quiocho, F.A. #1: ![]() タイトル: Refined 1.8 Angstroms Structure Reveals the Mode of Binding of Beta-Cyclodextrin to the Maltodextrin Binding Protein 著者: Sharff, A.J. / Rodseth, L.E. / Quiocho, F.A. #2: ![]() タイトル: Crystallographic Evidence of a Large Ligand-Induced Hinge-Twist Motion between the Two Domains of the Maltodextrin Binding Protein Involved in Transport and Chemotaxis 著者: Sharff, A.J. / Rodseth, L.E. / Spurlino, J.C. / Quiocho, F.A. #3: ![]() タイトル: The 2.3 Angstroms Resolution Structure of the Maltose-or Maltodextrin-Binding Protein, a Primary Receptor of Bacterial Active Transport and Chemotaxis 著者: Spurlino, J.C. / Lu, G.-Y. / Quiocho, F.A. #4: ![]() タイトル: Silent and Functional Changes in the Periplasmic Maltose-Binding Protein of Escherichia Coli K12. II. Chemotaxis Towards Maltose 著者: Duplay, P. / Szmelcman, S. #5: ![]() タイトル: Silent and Functional Changes in the Periplasmic Maltose-Binding Protein of Escherichia Coli K12. I. Transport of Maltose 著者: Duplay, P. / Szmelcman, S. / Bedouelle, H. / Hofnung, M. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 86.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 65.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 40826.203 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 多糖 | alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose / alpha-maltose |
#3: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.29 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.27 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 6.2 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: reseeded into drops containing 15% PEG8000, taken from Spurlino, J.C. et al (1991). J. Biol. Chem., 266, 5202-5219. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 42315 / % possible obs: 78 % / Observed criterion σ(F): 2 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / Num. measured all: 72712 / Rmerge(I) obs: 0.0421 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.9→10 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR/PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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