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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDGY3 |
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試料 | 3'SL from West Nile virus
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生物種 | West Nile virus (西ナイルウイルス) |
引用 | 日付: 2019 Sep 10 タイトル: Long non‐coding subgenomic flavivirus RNAs have extended 3D structures and are flexible in solution 著者: Zhang Y / Zhang Y / Liu Z / Cheng M / Ma J / Wang Y / Qin C |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3602 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (DAMFILT 5.0 (r7883)) / ダミー原子の半径: 3.00 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 0.133 / P-value: 0.129727 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: 3'SL from West Nile virus / 試料濃度: 0.75-3.00 |
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バッファ | 名称: 20mM Tris-HCl, 100mM NaCl, 5mM MgCl2 / pH: 7.5 |
要素 #1835 | 名称: WNV 3'SL / タイプ: RNA / 記述: 3'SL from West Nile virus / 分子量: 31.392 / 分子数: 1 / 由来: West Nile virus 配列: CACCUGGGAU AGACUAGGGG AUCUUCUGCU CUGCACAACC AGCCACACGG CACAGUGCGC CGAUAUAGGU GGCUGGUGGU GCGAGAACAC AGGAUCU |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Shanghai Synchrotron Radiation Facility (SSRF) BL19U2 地域: Shanghai / 国: China / 線源: X-ray synchrotronシンクロトロン / 波長: 0.1033 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.3 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: 3'SL from West Nile virus / 測定日: 2017年4月7日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 25 °C / 照射時間: 2 sec. / フレーム数: 30 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 149 /
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結果 | カーブのタイプ: extrapolated コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio ...コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio dummy atom model represents the averaged spatial disposition of the RNA in solution (DAMFILT model), derived from several aligned individual models (corresponding fit).
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