+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1icm | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | ESCHERICHIA COLI-DERIVED RAT INTESTINAL FATTY ACID BINDING PROTEIN WITH BOUND MYRISTATE AT 1.5 A RESOLUTION AND I-FABPARG106-->GLN WITH BOUND OLEATE AT 1.74 A RESOLUTION | ||||||
要素 | INTESTINAL FATTY ACID BINDING PROTEIN | ||||||
キーワード | BINDING PROTEIN(FATTY ACID) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / 微絨毛 / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process ...Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / 微絨毛 / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process / fatty acid binding / 細胞核 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rattus norvegicus (ドブネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.5 Å | ||||||
データ登録者 | Eads, J.C. / Sacchettini, J.C. / Kromminga, A. / Gordon, J.I. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1993 タイトル: Escherichia coli-derived rat intestinal fatty acid binding protein with bound myristate at 1.5 A resolution and I-FABPArg106-->Gln with bound oleate at 1.74 A resolution. 著者: Eads, J. / Sacchettini, J.C. / Kromminga, A. / Gordon, J.I. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1992 タイトル: Refinement of the Structure of Recombinant Rat Intestinal Fatty Acid-Binding Apoprotein at 1.2 Angstroms Resolution 著者: Scapin, G. / Gordon, J.I. / Sacchettini, J.C. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1icm.cif.gz | 40.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1icm.ent.gz | 28.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1icm.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ic/1icm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ic/1icm | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15015.015 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 参照: UniProt: P02693 |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-MYR / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.96 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.13 % | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS 温度: 17 ℃ / pH: 7.1 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å / 最低解像度: 20 Å / Num. obs: 12574 / Num. measured all: 34869 / Rmerge(I) obs: 0.0469 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | Rfactor obs: 0.159 / 最高解像度: 1.5 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.5 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å / 最低解像度: 20 Å / Rfactor obs: 0.159 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
|