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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cpc | ||||||
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タイトル | ISOLATION, CRYSTALLIZATION, CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS AND REFINEMENT OF CONSTITUTIVE C-PHYCOCYANIN FROM THE CHROMATICALLY ADAPTING CYANOBACTERIUM FREMYELLA DIPLOSIPHON AT 1.66 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 |
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キーワード | LIGHT HARVESTING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Fremyella diplosiphon (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.66 Å | ||||||
データ登録者 | Duerring, M. / Schmidt, G.B. / Huber, R. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1991 タイトル: Isolation, crystallization, crystal structure analysis and refinement of constitutive C-phycocyanin from the chromatically adapting cyanobacterium Fremyella diplosiphon at 1.66 A resolution. 著者: Duerring, M. / Schmidt, G.B. / Huber, R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1cpc.cif.gz | 144.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1cpc.ent.gz | 114.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1cpc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cp/1cpc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cp/1cpc | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17243.271 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Fremyella diplosiphon (バクテリア) 属: Microchaete / 参照: UniProt: P07122 #2: タンパク質 | 分子量: 17950.377 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Fremyella diplosiphon (バクテリア) 属: Microchaete / 参照: UniProt: P07119 #3: 化合物 | ChemComp-CYC / #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.72 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.79 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.66 Å / Num. obs: 70981 / Num. measured all: 176017 / Rmerge(I) obs: 0.089 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.66 Å / 最低解像度: 1.75 Å / % possible obs: 29.1 % |
-解析
ソフトウェア | 名称: EREF / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.181 / 最高解像度: 1.66 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.66 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: EREF / 分類: refinement | ||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 8 Å / Rfactor Rwork: 0.181 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: o_angle_d / Dev ideal: 2.33 |