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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Structure of the human CCAN deltaCT complex | ||||||||||||
![]() | 3D consensus refinement | ||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() positive regulation of protein localization to kinetochore / Mis6-Sim4 complex / centromere complex assembly / kinetochore organization / metaphase chromosome alignment / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||||||||
![]() | Muir KW / Yatskevich S / Bellini D / Barford D | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of the human inner kinetochore bound to a centromeric CENP-A nucleosome. 著者: Stanislau Yatskevich / Kyle W Muir / Dom Bellini / Ziguo Zhang / Jing Yang / Thomas Tischer / Masa Predin / Tom Dendooven / Stephen H McLaughlin / David Barford / ![]() 要旨: Kinetochores assemble onto specialized centromeric CENP-A (centromere protein A) nucleosomes (CENP-A) to mediate attachments between chromosomes and the mitotic spindle. We describe cryo-electron ...Kinetochores assemble onto specialized centromeric CENP-A (centromere protein A) nucleosomes (CENP-A) to mediate attachments between chromosomes and the mitotic spindle. We describe cryo-electron microscopy structures of the human inner kinetochore constitutive centromere associated network (CCAN) complex bound to CENP-A reconstituted onto α-satellite DNA. CCAN forms edge-on contacts with CENP-A, and a linker DNA segment of the α-satellite repeat emerges from the fully wrapped end of the nucleosome to thread through the central CENP-LN channel that tightly grips the DNA. The CENP-TWSX histone-fold module further augments DNA binding and partially wraps the linker DNA in a manner reminiscent of canonical nucleosomes. Our study suggests that the topological entrapment of the linker DNA by CCAN provides a robust mechanism by which kinetochores withstand both pushing and pulling forces exerted by the mitotic spindle. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 15.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 31.2 KB 31.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 12.1 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 52.5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() ![]() | 9.9 MB 9.4 MB 10.8 MB 116.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7pknMC ![]() 7pb4C ![]() 7pb8C ![]() 7piiC ![]() 7r5rC ![]() 7r5sC ![]() 7r5vC ![]() 7ywxC ![]() 7yyhC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | 3D consensus refinement | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.86 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: HIKMLN body
ファイル | emd_13473_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | HIKMLN body | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: OPQURN body
ファイル | emd_13473_additional_2.map | ||||||||||||
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注釈 | OPQURN body | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: OPQURN focused refinement
ファイル | emd_13473_additional_3.map | ||||||||||||
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注釈 | OPQURN focused refinement | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Combined focused map from PHENIX
ファイル | emd_13473_additional_4.map | ||||||||||||
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注釈 | Combined focused map from PHENIX | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
+全体 : Human inner kinetochore CCAN
+超分子 #1: Human inner kinetochore CCAN
+分子 #1: Centromere protein H
+分子 #2: Centromere protein I
+分子 #3: Centromere protein K
+分子 #4: Centromere protein L
+分子 #5: Centromere protein M
+分子 #6: Centromere protein N
+分子 #7: Centromere protein O
+分子 #8: Centromere protein P
+分子 #9: Centromere protein Q
+分子 #10: Centromere protein U
+分子 #11: Centromere protein R
+分子 #12: water
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |