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Pairwise 3D Alignment |
2つのタンパク質のペアワイズの構造アライメントを計算します。 |
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Self 3D Alignment |
同じタンパク質の中で構造が似ている部分をアライメントします。 自分自身の中にある繰り返し構造を認識できます。 |
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Multiple 3D Alignment |
いくつかの立体構造(3〜10個)のマルチプル構造アライメントを行います。 |
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3D Library Search |
クエリとなる構造を与え、それと似ている構造を ライブラリ構造の中から探し出します。 この計算は時間がかかるため、メールで結果が返信されます。 ライブラリは毎週更新されます。 |
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PDB information |
PDBの各エントリの様々な情報を提供します。 |
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Sequence Search |
クエリとなるアミノ酸配列を与え、それをライブラリ構造の配列と比較します。 簡易な立体構造予測サービスです。 |
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ヘルプページ |
Kawabata T., Nishikawa.K. "Protein tertiary structure comparison using the Markov transition model of evolution" (2000). Proteins, vol 41, 108-122 [MEDLINE]
コメント・質問は :川端 までお寄せください。
LastModified:May 10, 2011