例025:二次構造の予測

キーワード:structure

jV> load ftp 3fip 構造(PDBML)をロードする。
PDBID:3fip
jV> wireframe off 針金表現(wireframe)を消す。
PDBID:3fip
jV> cartoon on リボン表現(wireframe)をONにする。struct_confCategoryでαらせんであると規定されたA鎖の450-459番残基(auth_seq_id)とB鎖の450-457番残基(同)のみがリボン表示になる。
jV> select helix αらせんを選択。
jV> color red 選択されている領域(αらせん)の色を赤に変更。
PDBID:3fip
jV> structure 構造予測を実行。
File 1
  Model 1: Helices ... 2 Strands ... 74 Turns ... 37
jV> select all 全体を選択。
jV> cartoon on リボン表現(wireframe)をONにする。
PDBID:3fip