[日本語] English
万見生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

+
検索語

名称・Taxonomy-ID・キーワード:

-
Archelosauria

ウィキペディア - Archelosauria:

Archelosauria is a clade grouping turtles and archosaurs (birds and crocodilians) and their fossil relatives, to the exclusion of lepidosaurs (the clade containing lizards, snakes and the tuatara). The majority of phylogenetic analyses based on molecular data (e.g...

-
系統検索の結果

検索語「Archelosauria」の検索結果、72件中、1から20件目までを表示しています

名称EMDBPDBSASBDB
Alligator mississippiensis (アメリカアリゲーター)000
Alligator sinensis (ヨウスコウアリゲーター)000
Crocodylus porosus (ワニ)020
Aves (鳥類)000
Aquila chrysaetos chrysaetos (イヌワシ)000
Spizaetus tyrannus (クロクマタカ)000
Dromas ardeola (カニチドリ)000
Pedionomus torquatus (クビワミフウズラ)000
Limosa lapponica baueri (オオソリハシシギ)000
Columba livia (カワラバト)070
Eurystomus gularis (アオノドアフリカブッポウソウ)000
Piaya cayana (リスカッコウ)000
Eurypyga helias (ジャノメドリ)000
Anas platyrhynchos (アヒル)2350
Anas platyrhynchos platyrhynchos (マガモ)000
Anas sp. (カモ)010
Asarcornis scutulata (カモ)110
Lophonetta specularioides (カモ)020
Anser indicus (インドガン)030
Anser anser (ハイイロガン)010

ページ:

+
万見生物種について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

他の情報も見る