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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7r68 | ||||||
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タイトル | Human obscurin Ig12 | ||||||
要素 | Obscurin | ||||||
キーワード | STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein localization to M-band / phosphatidylinositol-5-phosphate binding / phosphatidylinositol-3-phosphate binding / phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding / M band / phosphatidylinositol-4-phosphate binding / regulation of small GTPase mediated signal transduction / sarcomere organization / structural constituent of muscle / ankyrin binding ...protein localization to M-band / phosphatidylinositol-5-phosphate binding / phosphatidylinositol-3-phosphate binding / phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding / M band / phosphatidylinositol-4-phosphate binding / regulation of small GTPase mediated signal transduction / sarcomere organization / structural constituent of muscle / ankyrin binding / myofibril / NRAGE signals death through JNK / RHOQ GTPase cycle / phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding / RHOA GTPase cycle / titin binding / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding / guanyl-nucleotide exchange factor activity / 筋鞘 / Z disc / G alpha (12/13) signalling events / nuclear body / calmodulin binding / non-specific serine/threonine protein kinase / リン酸化 / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / metal ion binding / 細胞膜 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Mauriello, G.E. / Wright, N.T. | ||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 2023 タイトル: The N-terminus of obscurin is flexible in solution. 著者: Mauriello, G.E. / Moncure, G.E. / Nowzari, R.A. / Miller, C.J. / Wright, N.T. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7r68.cif.gz | 559.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7r68.ent.gz | 471.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7r68.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r6/7r68 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r6/7r68 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 7r67C C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11148.623 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: OBSCN, KIAA1556, KIAA1639 発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌) 参照: UniProt: Q5VST9, non-specific serine/threonine protein kinase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 20 mM sodium chloride, 0.35 mM sodium azide, 50 mM D11 TRIS, 90% H2O/10% D2O Label: Sample A / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 20 mM / Label: conditions_1 / pH: 7.2 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE II / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE II / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 6 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |