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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2npl | ||||||
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タイトル | NMR Structure of CARD d2 Domain | ||||||
要素 | Coxsackievirus and Adenovirus Receptor | ||||||
キーワード | CELL ADHESION (細胞接着) / Coxsakievirus and Adenovirus Receptor | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 AV node cell-bundle of His cell adhesion involved in cell communication / cell adhesive protein binding involved in AV node cell-bundle of His cell communication / homotypic cell-cell adhesion / AV node cell to bundle of His cell communication / epithelial structure maintenance / gamma-delta T cell activation / regulation of AV node cell action potential / germ cell migration / apicolateral plasma membrane / cell-cell junction organization ...AV node cell-bundle of His cell adhesion involved in cell communication / cell adhesive protein binding involved in AV node cell-bundle of His cell communication / homotypic cell-cell adhesion / AV node cell to bundle of His cell communication / epithelial structure maintenance / gamma-delta T cell activation / regulation of AV node cell action potential / germ cell migration / apicolateral plasma membrane / cell-cell junction organization / transepithelial transport / connexin binding / cardiac muscle cell development / heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules / bicellular tight junction / 介在板 / cell adhesion molecule binding / mitochondrion organization / 好中球 / acrosomal vesicle / filopodium / PDZ domain binding / Cell surface interactions at the vascular wall / 接着結合 / neuromuscular junction / beta-catenin binding / Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell / cell-cell junction / integrin binding / virus receptor activity / 細胞結合 / cell body / heart development / 成長円錐 / actin cytoskeleton organization / basolateral plasma membrane / defense response to virus / neuron projection / 脂質ラフト / signaling receptor binding / protein-containing complex / extracellular space / extracellular region / 核質 / identical protein binding / 細胞膜 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / SA | ||||||
Model type details | minimized average | ||||||
データ登録者 | Jiang, S. / Caffrey, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2007 タイトル: Solution structure of the coxsackievirus and adenovirus receptor domain 2 著者: Jiang, S. / Caffrey, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2npl.cif.gz | 42.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2npl.ent.gz | 30.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2npl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/np/2npl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/np/2npl | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10539.775 Da / 分子数: 1 / 断片: Domain CAR 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CXADR, CAR / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P78310 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: SA / ソフトェア番号: 1 詳細: Structure is based on the average structure of the 30 lowest energy structures with 488 distance restraints, 234 dihedral restraints and 47 hodrogen bond restraints. | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: lowest energy / 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |