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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1uyv | ||||||
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タイトル | Acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase domain L1705I/V1967I mutant | ||||||
要素 | ACETYL-COA CARBOXYLASEアセチルCoAカルボキシラーゼ | ||||||
キーワード | TRANSFERASE (転移酵素) / CARBOXYLASE (カルボキシル化) / CARBOXYLTRANSFERASE / MUTANT (ミュータント (人類)) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / Biotin transport and metabolism / Fatty acyl-CoA biosynthesis / Carnitine metabolism / アセチルCoAカルボキシラーゼ / carboxyl- or carbamoyltransferase activity / acetyl-CoA binding / biotin carboxylase / acetyl-CoA carboxylase complex / biotin carboxylase activity ...: / Biotin transport and metabolism / Fatty acyl-CoA biosynthesis / Carnitine metabolism / アセチルCoAカルボキシラーゼ / carboxyl- or carbamoyltransferase activity / acetyl-CoA binding / biotin carboxylase / acetyl-CoA carboxylase complex / biotin carboxylase activity / malonyl-CoA biosynthetic process / acetyl-CoA carboxylase activity / acetyl-CoA biosynthetic process / long-chain fatty acid biosynthetic process / protein import into nucleus / fatty acid biosynthetic process / endoplasmic reticulum membrane / protein homodimerization activity / ミトコンドリア / ATP binding / identical protein binding / metal ion binding / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / その他 / 解像度: 2.6 Å | ||||||
データ登録者 | Zhang, H. / Tweel, B. / Tong, L. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2004 タイトル: Molecular Basis for the Inhibition of the Carboxyltransferase Domain of Acetyl-Coenzyme-A Carboxylase by Haloxyfop and Diclofop 著者: Zhang, H. / Tweel, B. / Tong, L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1uyv.cif.gz | 343.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1uyv.ent.gz | 277.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1uyv.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uy/1uyv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uy/1uyv | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 83458.555 Da / 分子数: 3 / 断片: CARBOXYLTRANSFERASE, RESIDUES 1482-2218 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) 参照: UniProt: Q00955, アセチルCoAカルボキシラーゼ #2: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | ENGINEERED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 72.27 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 5.5 / 詳細: pH 5.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5.5 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X4A / 波長: 0.92011 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.92011 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.6→30 Å / Num. obs: 117132 / % possible obs: 95 % / 冗長度: 2.3 % / Biso Wilson estimate: 34.5 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 16 |
反射 シェル | 解像度: 2.6→2.69 Å / 冗長度: 1.9 % / Rmerge(I) obs: 0.256 / Mean I/σ(I) obs: 3 / % possible all: 89 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / Num. measured all: 315564 / Rmerge(I) obs: 0.05 |
反射 シェル | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.256 |
-解析
ソフトウェア | 名称: CNS / バージョン: 1.1 / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: その他 / 解像度: 2.6→27.56 Å / Rfactor Rfree error: 0.002 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1
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原子変位パラメータ | Biso mean: 48 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→27.56 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.6→2.69 Å / Rfactor Rfree error: 0.01 / Total num. of bins used: 10
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 28 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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