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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1spa | ||||||
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タイトル | ROLE OF ASP222 IN THE CATALYTIC MECHANISM OF ESCHERICHIA COLI ASPARTATE AMINOTRANSFERASE: THE AMINO ACID RESIDUE WHICH ENHANCES THE FUNCTION OF THE ENZYME-BOUND COENZYME PYRIDOXAL 5'-PHOSPHATE | ||||||
要素 | ASPARTATE AMINOTRANSFERASEアスパラギン酸アミノ基転移酵素 | ||||||
キーワード | TRANSFERASE(AMINOTRANSFERASE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 L-phenylalanine biosynthetic process from chorismate via phenylpyruvate / L-tyrosine:2-oxoglutarate aminotransferase activity / L-phenylalanine biosynthetic process / アスパラギン酸アミノ基転移酵素 / L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / identical protein binding / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Hinoue, Y. / Yano, T. / Metzler, D.E. / Miyahara, I. / Hirotsu, K. / Kagamiyama, H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1992 タイトル: Role of Asp222 in the catalytic mechanism of Escherichia coli aspartate aminotransferase: the amino acid residue which enhances the function of the enzyme-bound coenzyme pyridoxal 5'-phosphate. 著者: Yano, T. / Kuramitsu, S. / Tanase, S. / Morino, Y. / Kagamiyama, H. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Role of an Active Site Residue Analyzed by Combination of Mutagenesis and Coenzyme Analogue 著者: Yano, T. / Hinoue, Y. / Chen, V.J. / Metzler, D.E. / Miyahara, I. / Hirotsu, K. / Kagamiyama, H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1spa.cif.gz | 91 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1spa.ent.gz | 68.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1spa.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sp/1spa ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sp/1spa | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 138 / 2: CIS PROLINE - PRO 195 |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43575.203 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P00509, アスパラギン酸アミノ基転移酵素 |
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#2: 化合物 | ChemComp-NPL / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.36 % |
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-解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.209 / Rfactor obs: 0.209 / 最高解像度: 2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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拘束条件 |
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