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- PDB-1anp: SOLUTION CONFORMATION OF AN ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE VARIANT SE... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 1anp
タイトルSOLUTION CONFORMATION OF AN ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE VARIANT SELECTIVE FOR THE TYPE-A RECEPTOR
要素ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE
キーワードHYPOTENSIVE HORMONE
機能・相同性
機能・相同性情報


positive regulation of delayed rectifier potassium channel activity / receptor guanylyl cyclase signaling pathway / neuropeptide receptor binding / regulation of high voltage-gated calcium channel activity / positive regulation of potassium ion export across plasma membrane / cGMP biosynthetic process / regulation of atrial cardiac muscle cell membrane repolarization / Physiological factors / cardiac conduction system development / YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression ...positive regulation of delayed rectifier potassium channel activity / receptor guanylyl cyclase signaling pathway / neuropeptide receptor binding / regulation of high voltage-gated calcium channel activity / positive regulation of potassium ion export across plasma membrane / cGMP biosynthetic process / regulation of atrial cardiac muscle cell membrane repolarization / Physiological factors / cardiac conduction system development / YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression / sodium ion export across plasma membrane / negative regulation of JUN kinase activity / neuropeptide hormone activity / negative regulation of systemic arterial blood pressure / cardiac muscle hypertrophy in response to stress / hormone receptor binding / aortic valve morphogenesis / regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel / positive regulation of heart rate / cGMP-mediated signaling / neuropeptide signaling pathway / positive regulation of cardiac muscle contraction / response to muscle stretch / cell projection / female pregnancy / hormone activity / 血圧 / vasodilation / フォールディング / perikaryon / collagen-containing extracellular matrix / Amyloid fiber formation / signaling receptor binding / protein-containing complex / extracellular space / extracellular region / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Natriuretic peptide, atrial type / Natriuretic peptide, conserved site / 心房性ナトリウム利尿ペプチド / Natriuretic peptides signature. / Natriuretic peptide / Natriuretic peptide
類似検索 - ドメイン・相同性
Natriuretic peptides A
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法溶液NMR
データ登録者Fairbrother, W.J. / Mcdowell, R.S. / Cunningham, B.C.
引用
ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994
タイトル: Solution conformation of an atrial natriuretic peptide variant selective for the type A receptor.
著者: Fairbrother, W.J. / McDowell, R.S. / Cunningham, B.C.
#1: ジャーナル: Embo J. / 年: 1994
タイトル: Production of an Atrial Natriuretic Peptide Variant that is Specific for Type-A Receptors
著者: Cunningham, B.C. / Lowe, D.G. / Li, B. / Bennett, B.D. / Wells, J.A.
履歴
登録1994年4月6日処理サイト: BNL
改定 1.01995年4月7日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12008年3月24日Group: Version format compliance
改定 1.22011年7月13日Group: Version format compliance
改定 1.32024年4月10日Group: Data collection / Database references / Other
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / struct_ref_seq_dif
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.process_site / _struct_ref_seq_dif.details

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)3,0311
ポリマ－3,0311
非ポリマー00
水0
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
NMR アンサンブル
データ基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)11 / -
代表モデル

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要素

#1: タンパク質・ペプチド ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE / 座標モデル: Cα原子のみ


分子量: 3031.323 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: POTENTIAL / 参照: UniProt: P01160

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実験情報

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実験

実験手法: 溶液NMR

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解析

NMRアンサンブル登録したコンフォーマーの数: 11

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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