+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-35869 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Multidrug resistance-associated protein 3 | |||||||||
マップデータ | ApoMRP2 | |||||||||
試料 |
| |||||||||
キーワード | ATP-binding cassette transporter / MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Defective ABCC2 causes DJS / bilirubin transmembrane transporter activity / bilirubin transport / xenobiotic export from cell / leukotriene transport / ABC-type glutathione-S-conjugate transporter / ABC-type glutathione S-conjugate transporter activity / ATPase-coupled inorganic anion transmembrane transporter activity / heme catabolic process / xenobiotic transmembrane transport ...Defective ABCC2 causes DJS / bilirubin transmembrane transporter activity / bilirubin transport / xenobiotic export from cell / leukotriene transport / ABC-type glutathione-S-conjugate transporter / ABC-type glutathione S-conjugate transporter activity / ATPase-coupled inorganic anion transmembrane transporter activity / heme catabolic process / xenobiotic transmembrane transport / Atorvastatin ADME / organic anion transmembrane transporter activity / xenobiotic transport across blood-brain barrier / ABC-type xenobiotic transporter / intercellular canaliculus / Paracetamol ADME / transepithelial transport / bile acid and bile salt transport / トランスロカーゼ; 他の化合物の輸送を触媒; ヌクレオシド三リン酸の加水分解に伴う / ABC-type xenobiotic transporter activity / Heme degradation / Aspirin ADME / xenobiotic transmembrane transporter activity / transport across blood-brain barrier / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / xenobiotic metabolic process / ABC-family proteins mediated transport / transmembrane transport / apical plasma membrane / negative regulation of gene expression / 細胞膜 / ATP hydrolysis activity / ATP binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.62 Å | |||||||||
データ登録者 | Yun CH / Gao HM | |||||||||
資金援助 | 中国, 1件
| |||||||||
引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: structure of multidrug resistance-associated protein 2 at 3.62 Angstroms resolution 著者: Yun CH / Gao HM | |||||||||
履歴 |
|
-構造の表示
添付画像 |
---|
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_35869.map.gz | 59.5 MB | EMDBマップデータ形式 | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | emd-35869-v30.xml emd-35869.xml | 13.9 KB 13.9 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_35869_fsc.xml | 8.5 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_35869.png | 70.4 KB | ||
Filedesc metadata | emd-35869.cif.gz | 6 KB | ||
その他 | emd_35869_half_map_1.map.gz emd_35869_half_map_2.map.gz | 59.4 MB 59.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-35869 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-35869 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 8izrMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_35869.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 64 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | ApoMRP2 | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-ハーフマップ: half map
ファイル | emd_35869_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: half map
ファイル | emd_35869_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
-全体 : multidrug resistance-associated protein 3 in apo state
全体 | 名称: multidrug resistance-associated protein 3 in apo state |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: multidrug resistance-associated protein 3 in apo state
超分子 | 名称: multidrug resistance-associated protein 3 in apo state タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-分子 #1: ATP-binding cassette sub-family C member 2
分子 | 名称: ATP-binding cassette sub-family C member 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO EC番号: トランスロカーゼ; 他の化合物の輸送を触媒; ヌクレオシド三リン酸の加水分解に伴う |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 179.447438 KDa |
組換発現 | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
配列 | 文字列: MLEKFCNSTF WNSSFLDSPE ADLPLCFEQT VLVWIPLGFL WLLAPWQLLH VYKSRTKRSS TTKLYLAKQV FVGFLLILAA IELALVLTE DSGQATVPAV RYTNPSLYLG TWLLVLLIQY SRQWCVQKNS WFLSLFWILS ILCGTFQFQT LIRTLLQGDN S NLAYSCLF ...文字列: MLEKFCNSTF WNSSFLDSPE ADLPLCFEQT VLVWIPLGFL WLLAPWQLLH VYKSRTKRSS TTKLYLAKQV FVGFLLILAA IELALVLTE DSGQATVPAV RYTNPSLYLG TWLLVLLIQY SRQWCVQKNS WFLSLFWILS ILCGTFQFQT LIRTLLQGDN S NLAYSCLF FISYGFQILI LIFSAFSENN ESSNNPSSIA SFLSSITYSW YDSIILKGYK RPLTLEDVWE VDEEMKTKTL VS KFETHMK RELQKARRAL QRRQEKSSQQ NSGARLPGLN KNQSQSQDAL VLEDVEKKKK KSGTKKDVPK SWLMKALFKT FYM VLLKSF LLKLVNDIFT FVSPQLLKLL ISFASDRDTY LWIGYLCAIL LFTAALIQSF CLQCYFQLCF KLGVKVRTAI MASV YKKAL TLSNLARKEY TVGETVNLMS VDAQKLMDVT NFMHMLWSSV LQIVLSIFFL WRELGPSVLA GVGVMVLVIP INAIL STKS KTIQVKNMKN KDKRLKIMNE ILSGIKILKY FAWEPSFRDQ VQNLRKKELK NLLAFSQLQC VVIFVFQLTP VLVSVV TFS VYVLVDSNNI LDAQKAFTSI TLFNILRFPL SMLPMMISSM LQASVSTERL EKYLGGDDLD TSAIRHDCNF DKAMQFS EA SFTWEHDSEA TVRDVNLDIM AGQLVAVIGP VGSGKSSLIS AMLGEMENVH GHITIKGTTA YVPQQSWIQN GTIKDNIL F GTEFNEKRYQ QVLEACALLP DLEMLPGGDL AEIGEKGINL SGGQKQRISL ARATYQNLDI YLLDDPLSAV DAHVGKHIF NKVLGPNGLL KGKTRLLVTH SMHFLPQVDE IVVLGNGTIV EKGSYSALLA KKGEFAKNLK TFLRHTGPEE EATVHDGSEE EDDDYGLIS SVEEIPEDAA SITMRRENSF RRTLSRSSRS NGRHLKSLRN SLKTRNVNSL KEDEELVKGQ KLIKKEFIET G KVKFSIYL EYLQAIGLFS IFFIILAFVM NSVAFIGSNL WLSAWTSDSK IFNSTDYPAS QRDMRVGVYG ALGLAQGIFV FI AHFWSAF GFVHASNILH KQLLNNILRA PMRFFDTTPT GRIVNRFAGD ISTVDDTLPQ SLRSWITCFL GIISTLVMIC MAT PVFTII VIPLGIIYVS VQMFYVSTSR QLRRLDSVTR SPIYSHFSET VSGLPVIRAF EHQQRFLKHN EVRIDTNQKC VFSW ITSNR WLAIRLELVG NLTVFFSALM MVIYRDTLSG DTVGFVLSNA LNITQTLNWL VRMTSEIETN IVAVERITEY TKVEN EAPW VTDKRPPPDW PSKGKIQFNN YQVRYRPELD LVLRGITCDI GSMEKIGVVG RTGAGKSSLT NCLFRILEAA GGQIII DGV DIASIGLHDL REKLTIIPQD PILFSGSLRM NLDPFNNYSD EEIWKALELA HLKSFVASLQ LGLSHEVTEA GGNLSIG QR QLLCLGRALL RKSKILVLDE ATAAVDLETD NLIQTTIQNE FAHCTVITIA HRLHTIMDSD KVMVLDNGKI IECGSPEE L LQIPGPFYFM AKEAGIENVN STKFLEENLY FQGSGGGGGG DYKDHDGDYK DHDIDYKDDD DKHHHHHH UniProtKB: ATP-binding cassette sub-family C member 2 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
濃度 | 2.00 mg/mL |
---|---|
緩衝液 | pH: 7.4 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy 最大 デフォーカス(公称値): 2.3000000000000003 µm 最小 デフォーカス(公称値): 1.2 µm |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |