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- EMDB-34867: Cryo-EM Structures and Translocation Mechanism of Crenarchaeota R... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-34867
タイトルCryo-EM Structures and Translocation Mechanism of Crenarchaeota Ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit
    • RNA: x 2種
    • タンパク質・ペプチド: x 34種
  • RNA: x 3種
  • タンパク質・ペプチド: x 29種
  • リガンド: x 2種
キーワードSulfolobus acidocaldarius ribosome small subunit / RIBOSOME (リボソーム)
機能・相同性
機能・相同性情報


ribonuclease P activity / tRNA 5'-leader removal / translation elongation factor activity / cytosolic ribosome / large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / リボソーム生合成 / regulation of translation / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding ...ribonuclease P activity / tRNA 5'-leader removal / translation elongation factor activity / cytosolic ribosome / large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / リボソーム生合成 / regulation of translation / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / tRNA binding / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex / GTPase activity / GTP binding / RNA binding / zinc ion binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Translation elongation factor EFG/EF2, archaeal / Domain of unknown function DUF5622 / Domain of unknown function (DUF5622) / Ribosomal protein L14e / Ribosomal protein L1, archaea / : / Ribosomal protein S27ae / Ribosomal protein L40e, archaeal / : / Ribosomal protein S9, archaeal ...Translation elongation factor EFG/EF2, archaeal / Domain of unknown function DUF5622 / Domain of unknown function (DUF5622) / Ribosomal protein L14e / Ribosomal protein L1, archaea / : / Ribosomal protein S27ae / Ribosomal protein L40e, archaeal / : / Ribosomal protein S9, archaeal / Ribosomal protein S13, archaeal / Ribosomal protein S17, archaeal / Ribosomal protein S6e, archaeal / Ribosomal protein S4, archaeal / Ribosomal protein S12, archaea / Ribosomal protein S3, archaeal / 30S ribosomal protein S3Ae / Ribosomal protein S7, archaeal / Ribosomal protein S19e, archaeal / Ribosomal protein S11, archaeal / Ribosomal protein S2, archaeal / Ribosomal protein S14, type Z, archaeal / Ribosomal protein S8e, archaeal / Ribosomal protein L19e, archaeal / Ribosomal protein L15e, archaeal / Ribosomal protein L30, archaeal / Ribosomal protein L6P, archaea / Ribosomal protein L14P, archaeal / Ribosomal protein L21e, archaeal / Ribosomal protein L18e, archaea / Ribosomal protein L10e, archaea / Ribosomal protein L32e, archaeal / Ribosomal protein L3, archaeal / Ribosomal protein L4, archaea / Ribosomal protein L5, archaeal / Ribosomal protein L7Ae, archaea / Ribosomal protein L24e / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III / Ribosomal protein L23 / Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G C-terminus / Elongation factor EFG, domain V-like / Elongation factor G C-terminus / EF-G domain III/V-like / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S17e, conserved site / Tr-type G domain, conserved site / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain signature. / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L1, conserved site / Ribosomal S17 / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S27, zinc-binding domain superfamily / Ribosomal protein S17, archaeal/eukaryotic / Ribosomal protein L1 / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S28e conserved site / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein S28e / Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein S3Ae / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein S4, KOW domain / Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S4e / Ribosomal protein S4e, central region / Ribosomal protein S4e, central domain superfamily / Ribosomal protein L30/YlxQ / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein S13/S15, N-terminal / Ribosomal protein S15P / Ribosomal S13/S15 N-terminal domain
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 ...Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Elongation factor 2 / Large ribosomal subunit protein uL1 / Large ribosomal subunit protein eL20 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein eL18 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein eL8 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Conserved protein / Small ribosomal subunit protein eS27 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein eS24 / Small ribosomal subunit protein eS31 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein eL14 / 50S ribosomal protein L40e / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein eL37 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL16
類似検索 - 構成要素
生物種Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.1 Å
データ登録者Wang YH / Zhou J
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)31971226 中国
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res / 年: 2023
タイトル: Cryo-electron microscopy structure and translocation mechanism of the crenarchaeal ribosome.
著者: Ying-Hui Wang / Hong Dai / Ling Zhang / Yun Wu / Jingfen Wang / Chen Wang / Cai-Huang Xu / Hai Hou / Bing Yang / Yongqun Zhu / Xing Zhang / Jie Zhou /
要旨: Archaeal ribosomes have many domain-specific features; however, our understanding of these structures is limited. We present 10 cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of the archaeal ribosome ...Archaeal ribosomes have many domain-specific features; however, our understanding of these structures is limited. We present 10 cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of the archaeal ribosome from crenarchaeota Sulfolobus acidocaldarius (Sac) at 2.7-5.7 Å resolution. We observed unstable conformations of H68 and h44 of ribosomal RNA (rRNA) in the subunit structures, which may interfere with subunit association. These subunit structures provided models for 12 rRNA expansion segments and 3 novel r-proteins. Furthermore, the 50S-aRF1 complex structure showed the unique domain orientation of aRF1, possibly explaining P-site transfer RNA (tRNA) release after translation termination. Sac 70S complexes were captured in seven distinct steps of the tRNA translocation reaction, confirming conserved structural features during archaeal ribosome translocation. In aEF2-engaged 70S ribosome complexes, 3D classification of cryo-EM data based on 30S head domain identified two new translocation intermediates with 30S head domain tilted 5-6° enabling its disengagement from the translocated tRNA and its release post-translocation. Additionally, we observed conformational changes to aEF2 during ribosome binding and switching from three different states. Our structural and biochemical data provide new insights into archaeal translation and ribosome translocation.
履歴
登録2022年11月28日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年9月20日-
マップ公開2023年9月20日-
更新2024年4月3日-
現状2024年4月3日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_34867.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_34867.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 209.3 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.087 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.33
最小 - 最大-0.50721174 - 1.25776
平均 (標準偏差)0.009609065 (±0.09800317)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ380380380
Spacing380380380
セルA=B=C: 413.06 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_34867_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_34867_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit

全体名称: Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit
要素
  • 複合体: Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit
    • RNA: 23s rRNA (3000-MER)
    • RNA: 5s rRNA (122-MER)
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18Aeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L37Aeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L37eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L39eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L40Eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L44eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L7Aeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21eリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: DUF2280 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Conserved proteinConservation
  • RNA: 16s rRNA (1493-MER)
  • RNA: tRNA (76-MER)
  • RNA: mRNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
  • タンパク質・ペプチド: Elongation factor 2EEF2
  • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L47Aリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L1
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14 type Zリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S28eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S27aeリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S24eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S27eリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3Aeリボソーム
  • タンパク質・ペプチド: PHE-PHE-PHE-PHE-PHE-PHE
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
  • リガンド: UNKNOWN

+
超分子 #1: Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit

超分子名称: Sulfolobus acidocaldarius ribosome small sbunit / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1, #4-#38
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)

+
分子 #1: 23s rRNA (3000-MER)

分子名称: 23s rRNA (3000-MER) / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 980.552312 KDa
配列文字列: GCCGAAGCCU CCCGGUGGAU GGCUCGGCUC GGGCACCGAA GAAGGGCGCG GCAAGCAGCG AAAUGCUCGG GUGAGGCGCA AGCAGCCGU UGACCCCGAG GUCCCCUAAU GGGAUAUCCU GCCGGGUUUC CGGCGCUCCC GGUUUAUAAC UGGGAGUGGG A ACCCCCCG ...文字列:
GCCGAAGCCU CCCGGUGGAU GGCUCGGCUC GGGCACCGAA GAAGGGCGCG GCAAGCAGCG AAAUGCUCGG GUGAGGCGCA AGCAGCCGU UGACCCCGAG GUCCCCUAAU GGGAUAUCCU GCCGGGUUUC CGGCGCUCCC GGUUUAUAAC UGGGAGUGGG A ACCCCCCG AACGGAAACA UCUUAGUAGG GGGAGGAAAA GAAAUCAAUU GAGAUCCCCU GAGUAGGGGC GACCGAAAGG GG GACAGCC CAAACUAAAC CUGCCGAUGA UAAGUCGGUG GGGAUGUGGU GUUACGACCU CUAGCCUGAG GUUCGACCUC GGC UUUCCU AACCUAUCUA GCCGAACUCC CCUGGAACGG GGGGCCAUAG AGGGUGAAAG CCCCGUAGGC UAAAGAUAGG UGGA AAGUG GCUAGAGGUA GAGUACCAUC CCCUGGUUUG GGGGUGGGAA GUUAGGGGAC ACGUGCCUCU AAGGCUAAAU AUGUC CCGA GACCGAUAGC AAACUAAGUA CCGUGAGGGA AAGCUGAAAA GAACCCCGGA AGGGGGAGUG CAAAGAGCCU GAAACC GGG UGGUUAUACA GGGUGUGGCU CGAAAGAAGU GAACCCUUCC GAAGGAAAGG GGCGCAAGCC CUUAGUACGA GGAAGGG CG AUCGGGGUCA CGCCUUUCGU CUUGAAACAC GGGCCGGGGA GUUCACAUCA GUGGCGAGCU UAAGGAGAUU AUCUCCGA A GGCAUAGGGA AACCAAGUGC CCGCAGCCUA GUUUCUAGGC GAGGGGCAGG GUCUGUCAGG GCCUGAAGCC ACUGAUGUG AGGCUAGAAA CCGGGCGAUC UAGUCCGGGG CAGGCUGAAG GUGGGGGAAA CCCCACUGGA GGGCCGAAUA GGGGUUCUGA CGUGCAAUU CGUUCCCUUG ACCUCGGACU AGGGGCAAAA GACCAAUCUA GCCCGGUGAU AGCUAGUUCC CCCCGAAAUG C GUCCUAGC GCAGCCUCCC UAAAGGCAGC UCGCGGGGUA GAGUGACAGA UCGGGGGCUC CAGGCGAAAG CCUGGGGCUU CC GGUCUAA CUCCGAACCC ACGAGCGCCG AAGAAGGGGG GAGUGGGUCA CUCGGCGUAA GGUUGGGUGG CAAAAGGGGA ACA ACCCAG ACCUGGGUUA AGGCCCCAAA GUCCCGGCUA AGUGCCAACG AAAAGGCGUC UCCAGCCUUA GACAGCGGGA AGGU GGGCC CAGCAGCAGC CAUCCUCUAA GGAGUGCGUA ACAGCUCACC CGCCGAGGCU GGAGGCCCUA AAGAUUGGUC GGGGC UCAA GCCGGGCGCC GAGACCCAGG AGGGGGUCUC UACUAGAGAU CCUCUGGUAG GGGGGCGCUG UGAUGGGGUA GAAGGU GGG UCGUGAGAUC CACUGGACCC GUCACAGGUG CAGAUCCCGG CGGUAGUAAC AGCGAAGGGG GGUGAGAAUC CCCCUCG CC GGAAGGGCAA GGGUUUCCCG GCAACGUUCG UCAGCCGGGA GUUAGCCGGU CCUAAGGUAG GGCCUAAUAG GUACCUAC C GAAAGGGAAA GGGGUUAACA UUCCCCUGCC UCCCGGGUAG GUGCGGUAAC GCAAGCCAGA CUCCUGACGG AUUGGGGUA GGGAGAGUAG GACCACCGUC CUACCCAAGC ACUCAAGCCC UUGGAGAGCC GUAACGGUGA GAAGAGGGCG AAGGUGUGAU GGGCCUUCC GUUAGGAGGG UUCUCCUGAU CCCUAGUCCC CAUGAAAAGG GAGUCUGGAA CGAUCCCGGG AGACCGUACC U AGAACCGA CACUGGUGCC CCUGGGUGAG AAGCCCAAGG CGUCUGAGGG GUAACCCAGG CUAGGGAACU CGGCAAAUUA GC CCCGUAA CUUCGGGAGA AGGGGUGCCU AUCGUGGUUU AACAAAGCCA CGAUAGGUCG CAGUGACCAG AGGGACCUGA CUG UUUAAU AAAAACAUAG GUCCCCGCUA GCCCGAAAGG GUGUGUACGG GGGCUAAAUC CUGGCCACUG GUGGUUGGUU AAAU CCGGG UUCAACCGGG CGAAGCCCCA CCGAAGGCCG GGGGUAACUC UGACCCUCUU AAGGUAGCCA AAUGCCUUGC CGGGU AAGU UCCGGCGCGC AUGAAUGGAU CAACGCGGUC CCUACUGUCC CAGCCUGGGG CCUCGUGAAC GCCCUGAGCC GGUGCA CAG UCCGGCAUCU CCCUACACCG AGAGAAGACC CCGUGGAGCU UCACCGCAGC CUGGCGUUGU CCCUCGGGCG UUUAUGC GU AGAGUAGGUG GGAGGGGUCG AACCUGUCCU UUCGGGGGCA GGGGACCCGA AAGUGAAACA CCACCCAUGG ACGCUCGA G GGACUAACCU CUCGAAAGAG AGGAACAACG UCAGGUGGGC GGUUCGGCUG GGGCGGCACU CCCGCGAAAA GAUAACACG GGAGCCCAAA GGUCGGCUCA GGCGGUACAG AACGCCGCCG UAGAGCGCAA GGGCAAAAGC CGGCCUGACG UGACCCUUCC AAGUACGGG GUCACGACGC GAAAGCGGGG CCUAGCGAAC GCUCGUGCCC CCACACGUGG GGGCCGGGCA UGACAGAAAA G UUACCCCG GGGAUAACAG GGUCGUCGCG GGCGAGAGCU CACAUCGACC CCGCGGUUUG CUACAUCGAU GUCGGCUCUU CC CACCCUG GAGGUGCAGC UGCCUCCAAG GGUAGGGCUG CCCGCCCGUU AAAGGGGAGC GUGAGCUGGG UUUAGACCGU CGC GAGACA GGUCGGACUC UAAGGGUAGG GAGUGCGGAC CGCUUGAGGG GAAGGAACCC CUAGUACGAG AGGAACAGGG UUCC GGGGC CUCCAGUUUA CCGGUUGUCC GGUAGGGCAA UGCCGGGCAG CCGCGCCCUG AGGGGUAACC GCUGAAAGCA UCUAA GCGG GAACCCCUCC CCUAAAAGAG GCGGUCAGGC GUUAGCCGGG GCCUUCCCCU AGAAGAGGGG GUUGAUGGGG UGGGGA UGU AAGCUCCAAG GUUGUAAGAC CGAGGAGUUU AGUCCGCCAC UCCCAAUCAG GCUCCCCCC

+
分子 #2: 16s rRNA (1493-MER)

分子名称: 16s rRNA (1493-MER) / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 487.531875 KDa
配列文字列: CGCCCCGAUU CCGGUUGAUC CUGCCGGACC CGACCGCUAU CGGGGUAGGG AUAAGCCAUG GGAGUCUUAC ACUCCCGGGU AAGGGAGUG UGGCGGACGG CUGAGUAACA CGUGGCUAAC CUACCCUCGG GACGGGGAUA ACCCCGGGAA ACUGGGGAUA A UCCCCGAU ...文字列:
CGCCCCGAUU CCGGUUGAUC CUGCCGGACC CGACCGCUAU CGGGGUAGGG AUAAGCCAUG GGAGUCUUAC ACUCCCGGGU AAGGGAGUG UGGCGGACGG CUGAGUAACA CGUGGCUAAC CUACCCUCGG GACGGGGAUA ACCCCGGGAA ACUGGGGAUA A UCCCCGAU AGGGAAGGAG UCCUGGAAUG GUUCCUUCCC UAAAGGGCUA UAGGCUAUUU CCCGUUUGUA GCCGCCCGAG GA UGGGGCU ACGGCCCAUC AGGCUGUCGG UGGGGUAAAG GCCCACCGAA CCUAUAACGG GUAGGGGCCG UGGAAGCGGG AGC CUCCAG UUGGGCACUG AGACAAGGGC CCAGGCCCUA CGGGGCGCAC CAGGCGCGAA ACGUCCCCAA UGCGCGAAAG CGUG AGGGC GCUACCCCGA GUGCCUCCGC AAGGAGGCUU UUCCCCGCUC UAAAAAGGCG GGGGAAUAAG CGGGGGGCAA GUCUG GUGU CAGCCGCCGC GGUAAUACCA GCUCCGCGAG UGGUCGGGGU GAUUACUGGG CCUAAAGCGC CUGUAGCCGG CCCACC AAG UCGCCCCUUA AAGUCCCCGG CUCAACCGGG GAACUGGGGG CGAUACUGGU GGGCUAGGGG GCGGGAGAGG CGGGGGG UA CUCCCGGAGU AGGGGCGAAA UCCUUAGAUA CCGGGAGGAC CACCAGUGGC GGAAGCGCCC CGCUAGAACG CGCCCGAC G GUGAGAGGCG AAAGCCGGGG CAGCAAACGG GAUUAGAUAC CCCGGUAGUC CCGGCUGUAA ACGAUGCGGG CUAGGUGUC GAGUAGGCUU AGAGCCUACU CGGUGCCGCA GGGAAGCCGU UAAGCCCGCC GCCUGGGGAG UACGGUCGCA AGACUGAAAC UUAAAGGAA UUGGCGGGGG AGCACCACAA GGGGUGGAAC CUGCGGCUCA AUUGGAGUCA ACGCCUGGAA UCUUACCGGG G GAGACCGC AGUAUGACGG CCAGGCUAAC GACCUUGCCU GACUCGCGGA GAGGAGGUGC AUGGCCGUCG CCAGCUCGUG UU GUGAAAU GUCCGGUUAA GUCCGGCAAC GAGCGAGACC CCCACCCCUA GUUGGUAUUC UGGACUCCGG UCCAGAACCA CAC UAGGGG GACUGCCGGC GUAAGCCGGA GGAAGGAGGG GGCCACGGCA GGUCAGCAUG CCCCGAAACU CCCGGGCCGC ACGC GGGUU ACAAUGGCAG GGACAACGGG AUGCUACCUC GAAAGGGGGA GCCAAUCCUU AAACCCUGCC GCAGUUGGGA UCGAG GGCU GAAACCCGCC CUCGUGAACG AGGAAUCCCU AGUAACCGCG GGUCAACAAC CCGCGGUGAA UACGUCCCUG CUCCUU GCA CACACCGCCC GUCGCUCCAC CCGAGCGAGA AAGGGGUGAG GUCCCUUGCG AUAAGUGGGG GAUCGAACUC CUUUCCC GC GAGGGGGGAG AAGUCGUAAC AAGGUAGCCG UAGGGGAACC UGCGGCUGGA UCACCUCAUA U

+
分子 #4: 5s rRNA (122-MER)

分子名称: 5s rRNA (122-MER) / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 39.440457 KDa
配列文字列:
UGCCCACCCG GUCAUAGUGA GCGGGUAACA CCCGGACUCG UUUCGAACCC GGAAGUUAAG CCGCUCACGU CAGAGGGGCC GUGGGAUCC GAGAGGGCCC GCAGCCUCUC UGAGCUGGGA UGG

GENBANK: GENBANK: CP000077.1

+
分子 #66: tRNA (76-MER)

分子名称: tRNA (76-MER) / タイプ: rna / ID: 66 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 24.485539 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGUCGGU AGAGCAGGGG AUUGAAAAUC CCCGUGUCCU UGGUUCGAUU CCGAGUCCGG GCACCA

+
分子 #67: mRNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')

分子名称: mRNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
タイプ: rna / ID: 67 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 3.935198 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUU

+
分子 #3: Elongation factor 2

分子名称: Elongation factor 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 81.106492 KDa
配列文字列: VEQVLSLMKD VTRVRNIGII AHVDHGKTTT SDTLLAASGI ISQKVAGEAL ALDYLSVEQQ RGITVKAANI SLYHEIDGKG YVINLIDTP GHVDFSGRVT RSLRVLDGSI VVIDAVEGIM TQTETVLRQS LEERVRPILF INKVDRLIKE LKLSSQEIQK R LIDLIIEV ...文字列:
VEQVLSLMKD VTRVRNIGII AHVDHGKTTT SDTLLAASGI ISQKVAGEAL ALDYLSVEQQ RGITVKAANI SLYHEIDGKG YVINLIDTP GHVDFSGRVT RSLRVLDGSI VVIDAVEGIM TQTETVLRQS LEERVRPILF INKVDRLIKE LKLSSQEIQK R LIDLIIEV NNLIETYGEP EFKDQWKIKP ELGNVVFGSA KDKWGFSVPM AGKRGVKFSD VVNAYTSGDK AKIEELASKV PI HEALLDA VIKFVPNPRD SQKYRIPKIW KGDLDSEIAK AMINADPNGP IVMMINDMKV DPHAGLVATG RVFSGTLRAG EEV WLVNAK RQQRILQVSL YMGAIRELAE EIPVGNIAAA LGMDAARSGE TGVDIRFKDS VLGSFEKLHY ISEPVVTISV EPRN PKDLT KMIDALRKLS IEDSNLVVKI NEETGEYLLS GMGFLHLEVS LQLLKENYGL DVVTTPPIVV YRESIRNKSQ VFEGK SPNK HNKLYISVEP LNNQTIDLIA NGTIKEDMDN KEMAKILRDQ AEWDYDEAKK IVAIDENINV FIDATSGVQH LREIMD TLL QGFRLAMKEG PLAFEPVRGV KVVLHDAVVH EDPAHRGPAQ LYPAVRNAIF AGILTSKPTL LEPLQKLDIR IPMEYLG NV TAVITRKRGK VINVVQTGNV ARVYAEIPVG ESFELASELR ASSAGRAFWG TEFSRWAPVP DSILVDLIMK IRERKGKP K QLPKVEDF

UniProtKB: Elongation factor 2

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 24.88175 KDa
配列文字列: GKKLLQQRAG RGGINFRSPS WRRVGPARYP NIEGDHKGKI IDILHNPGVT APVVKVKLDN GLQFYIPAVQ GVAVGQEISI GKNATISNG NIVEVGQLPE GTVICNVEKL KGDGGKFARA AGSYAVISGK AGNKVLIKLS SEKIVEVSQN ARATVGIIAG G GFVEKPLL ...文字列:
GKKLLQQRAG RGGINFRSPS WRRVGPARYP NIEGDHKGKI IDILHNPGVT APVVKVKLDN GLQFYIPAVQ GVAVGQEISI GKNATISNG NIVEVGQLPE GTVICNVEKL KGDGGKFARA AGSYAVISGK AGNKVLIKLS SEKIVEVSQN ARATVGIIAG G GFVEKPLL KAGNNYWKYR VRAVKWPVVR GVAMNAVSHP HGGGLHQSVS RPSTVSRNAP PGRKVGHIAS RRTGRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 38.18634 KDa
配列文字列: RKLSSPRRGS AGLRPRKRAD EILPTPKNWP LVNLKEPKLL GFIGYKAGMT HVYMIDDKPT SPNYGKEVYT PVTIVESPPI LGLALRAYH IDSKGELSVL VDYWANFEEG SLKYLKRKIT SLKVDSSKMK EKLDLIQKNL NNITYMRLLV STQPWLVPSL G KKRPEIVE ...文字列:
RKLSSPRRGS AGLRPRKRAD EILPTPKNWP LVNLKEPKLL GFIGYKAGMT HVYMIDDKPT SPNYGKEVYT PVTIVESPPI LGLALRAYH IDSKGELSVL VDYWANFEEG SLKYLKRKIT SLKVDSSKMK EKLDLIQKNL NNITYMRLLV STQPWLVPSL G KKRPEIVE IQIGGGSIQD QLNYGLSLLG KQIPVRDVFR EGQLTDIIGV TKGKGFQGVI KRYSVVEFPR WHKHRKGSRK IG ARGPSIS TPSYVPQPGQ LGFHRRTEYN KRIIKIGDNV NEINPAGGIV NYGLVKNTYL VIEGSVLGSR KRPLFLRYPI RPS WSPESA PKITYVNLAS QQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 27.357971 KDa
配列文字列: KVSVLDLKGN QLEEIELPLF FSYPVRKDLI RRVFLSEFTK SLQPKGRDPL AGKRTSALSF GINLGIARVP RVKGSGEAAL APNTVGGRL AFPPTTEKRL VEEVNLKEKK LGIISALAAT ADPNFVKARG HRFTSNNVPI ILVDDFENIS KAKEIMDILK S IGVVDDIK ...文字列:
KVSVLDLKGN QLEEIELPLF FSYPVRKDLI RRVFLSEFTK SLQPKGRDPL AGKRTSALSF GINLGIARVP RVKGSGEAAL APNTVGGRL AFPPTTEKRL VEEVNLKEKK LGIISALAAT ADPNFVKARG HRFTSNNVPI ILVDDFENIS KAKEIMDILK S IGVVDDIK RVKESKGVRA GKGKMRGRRY QIAKGPLIVV SNHKSPVVES ASNIPGVNVV SANLVSVIHL APGGHPGRLT IY TKSSINI LRQR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 19.095418 KDa
配列文字列:
KENVMRRVVL DKVTVNIGVG ESGERLQKAY QLVQELTGVK PVYTKGRKSI REFGVRKGAP IGVKATLRRQ AAVEFLKKVL PAVNFRLKQ SSFDNYGNVS FGIAEHVLIP GTRYDPEIGI FGMDVAITLV RPGYRTMKRK RKKASIPRRH RVTKEEAINF M KENFNVTI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 20.30567 KDa
配列文字列:
LKAAYIREEI QIPDKVKVSL ENNVLKVKGP KGEVIKDFSY AKGIRIQLNE GKIILETTFA DRRKKALLYS IIAHIKNMIT GTINGYRYY LKVISTHFPI SVKVSGDEVQ VSNLIGEKNI RRAKILPGVK VTVKGEDIVV EGSDIYNVAQ TAANIESSTK I VGYDRRIF SDGIYIYKKE VIG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #10: 50S ribosomal protein L18Ae

分子名称: 50S ribosomal protein L18Ae / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 8.926346 KDa
配列文字列:
VKIFMVRGTA IFSASRFPTS QKFTKYVRAL NEKQAIEYIY SQLGGKNKIK RYNIHIQEIK EVKEDEITDK TIRDLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL20

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L10e

分子名称: 50S ribosomal protein L10e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 18.670025 KDa
配列文字列:
RPGRCYRKFS GPAYTRREYI PGIPMPKITK FVMGNVNGDY DYELRLITTE KGQIRHNALE AARVIALKYL SKKLASEQNF ALVVTKYPH HVIRENKMMA FAGADRLQDG MRLSFGKPIG TAARLEKLGE LVMYVRVKKE HLEAAKEALK IASSKLPIRT K IEIS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 15.808851 KDa
配列文字列:
VIVDATNQIL GRMSTHIAKL LKSGKKVYVV NAEKAIISGP RSRVLEGYSL LFTVKTMQNP YRQGIRRPRN PINIVKRTVR GMLPKNKLG KQIYRNLKAY IGIPKELEGK SMIRFDDADV SRLKGKYITV AELSRLLGGL K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L14e

分子名称: 50S ribosomal protein L14e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 9.559101 KDa
配列文字列:
AIEIGRICVK TRGREAGKKC VIVDIIDSNF VLVTGPKEIN GVKRRRVNIL HIEPTDKKVE INKGATDQEV KQAIEQSGLT DFIKEA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 14.707115 KDa
配列文字列:
MNVLGSRKGF TPALQHNSSV VVADNSGAKE AVIIGIYGYR GVLRRVPFAN IADLVMVSVR KGSPDVRKQK FKAVIVRQRM PFRRPDGTW ISFEDNAVVI INPDGTPKGT EVRGPIAREA AERWPKIASV ATMVI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L15e

分子名称: 50S ribosomal protein L15e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 20.179402 KDa
配列文字列:
SMYHYIEQTW QNKDWRRSIL RKRLIEWRRQ PAITRIDRPT RLNRARALGY KAKQGFVMVR VRVRRGGLNK PRPNSGRRPK RMGVYGYGP SKGYRWIAEE RAARKFPNLE VLGSYYVAED GMYKYYEVIM VDYSHPVIRS DPELKWLQDS VNRKRVFRGL T SAGQKSRG L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL15

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L18e

分子名称: 50S ribosomal protein L18e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 12.747252 KDa
配列文字列:
TNIMLRKLIT SLKKQDKAIW VRVAEELEAP RRKRAYINIY KINRYSKAND IIVVPGKVLG VGNLDHPVTV VALSFSKPAK EKILRSGGK VMSLYKAIQE LNDFKGKTVR LMK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL18

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 21.766139 KDa
配列文字列: TQGPNYRIKF RRRREGKTDY YTRYTYVINN AIRFVPRLTN KYVIVSVSKF DQKGDIMIAY AHSIELVKKY GWKGDTNNTP AAYLTGYLA GLRAVKSGVK AAVSDIGLFV PVKGGRIFAV IKGAIDAGLK VPVGDLGKLK DRVNGSHISA YAQKLKNENQ E LYNKLFSS ...文字列:
TQGPNYRIKF RRRREGKTDY YTRYTYVINN AIRFVPRLTN KYVIVSVSKF DQKGDIMIAY AHSIELVKKY GWKGDTNNTP AAYLTGYLA GLRAVKSGVK AAVSDIGLFV PVKGGRIFAV IKGAIDAGLK VPVGDLGKLK DRVNGSHISA YAQKLKNENQ E LYNKLFSS YIQRGLDPVL LPQHFEEVLN KIKEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L19e

分子名称: 50S ribosomal protein L19e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.108916 KDa
配列文字列:
PEFQLQRRLA ADIAGVGLNN IKFNPERLEE VEEALTREDI KKLIKERAVI VNPKRGISSG RLKERKHKRR SKGEGRKHGS RKGKSGART GDKEIWINKI RKIRRYIRWL RDNNVIDKHT YRLLYKRAKG NYFKNLSDVK SYLRQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL19

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.360293 KDa
配列文字列:
YPILSIPEDK LAKAVIKNID ASVRDLYNVC KAIRGMNLKE AREFLNNVLE EKEALPFWRY SHGTSHRSNI SRKWKVKSGR YPKKAIKYV LKLLDNAENN ANSKGLDIDN LKIVHIAAHK GLVLKRYMTR AFGRSTRKYK YLSHIEVILG E

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 9.261987 KDa
配列文字列:
IIKEFLATEK AVKLIESQNT LTIIVNRNTT KKDIKNEVEK LFSVKVEKIN TLITPKGEKK AYVKLKQEYK ASDVAHKLGM L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L24e

分子名称: 50S ribosomal protein L24e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.338608 KDa
配列文字列:
RQCSFCGKDI LPGTGLMYVR NDGSLLWFCS SKCRKSMLKL HRDPKKLKWT KSYL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 14.130666 KDa
配列文字列:
MISSKPSKQR KLVYNLPNHL RYKLLTARLS EDLEKQYGIK RISIRKGDSV KLMRGSQVGY EGKVVEVDRK RGRVAIEGLT KKKADGTPV YVWVHASKVI ITKLDTGDKE RMDAIERKRK MRE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 7.37879 KDa
配列文字列:
PLEVDELRKM DLKQLKERLN ELEMQLLKLR VESRMGTLKN TASIKNTRKD IARILTVIGE KSK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L30e

分子名称: 50S ribosomal protein L30e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 10.391282 KDa
配列文字列:
FEGELKTLLR SGKVILGTRK TLKLLKTGKV KGVVVSSTLR QDLKDDIMTF SKFSDIPIYL YKGSGYELGT LCGKPFMVSV IGIVDEGES KILEF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.819736 KDa
配列文字列:
MNELIGVIRI RGWAATPWYI QDTLSMLRLK NAFNAMIYPK DSSIQGMLNL VSSYVTWGEL NDEGLRLLVS KLEISRGKKV NEEYVKDKL NVDFQSFVES IKDGKLRLNK LDEIFSLPIR LHPPKGGFKG KVSRPFRAGG EFGYRGDKIN ELIRRM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L31e

分子名称: 50S ribosomal protein L31e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 8.935899 KDa
配列文字列:
KPEKENFEMV INFRRVIMGR KTTRTKRAIK YVRYMVKRHF GAEKVIIDPL LAKAITMNGR DKIVRRVRIA VKRIG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL31

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L32e

分子名称: 50S ribosomal protein L32e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 14.328114 KDa
配列文字列:
KPAKKNMKSP GKAIKFLRFD WDKYYRIGRQ ERWRKPRGID NAIRLELKGY QPKVKIGYRT DKQIRGLHPS GLRPILVKSV KDLEAFAKG KQDVIIIISS TIGLRKRIEL IKKAEELGLK IANR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL32

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L34e

分子名称: 50S ribosomal protein L34e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 8.993502 KDa
配列文字列:
SPQQRSGSFR KVFVKLPSGK STIHYERRKD NIARCGMCKK PLNGVKNNYT YKYSKTEKRP ERVYGGYLCH KCLESLI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL34

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L37Ae

分子名称: 50S ribosomal protein L37Ae / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 7.536857 KDa
配列文字列:
TGIAGRFGAR YGSSTRKKWK EVMERRYMPH QCPYCKTTGK VVRIASGIWY CRKCETKWAG LAYTP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL43

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L37e

分子名称: 50S ribosomal protein L37e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.274416 KDa
配列文字列:
MKGTPSFGKM NKTPTHVRCR RCGRNSFNAR KGYCAACGFG RSKKIRRYSW QNKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL37

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L39e

分子名称: 50S ribosomal protein L39e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 5.861087 KDa
配列文字列:
KHKSLGKKLR LGKALKRNSP IPAWVIIKTQ AEIRFNPLRR NWRRNNLKV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L40E

分子名称: 50S ribosomal protein L40E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.336725 KDa
配列文字列:
MPLTDPVKLQ IVQQRVFLKK ICRDCGALNS IRATKCRRCH SSNLRAKKKE LPAKK

UniProtKB: 50S ribosomal protein L40e

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L44e

分子名称: 50S ribosomal protein L44e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 10.805958 KDa
配列文字列:
MKVPKVIKTY CPKCKTHTEH SVSLYKGGKR RSLAEGQRRY ERKNVGYGSK RKPEQKRFAK TTKKQTLVLK CQKCSYTIVK EGMRLKKLE LVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL42

+
分子 #34: 50S ribosomal protein L7Ae

分子名称: 50S ribosomal protein L7Ae / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 13.351481 KDa
配列文字列:
PSYVKFEVPQ ELADKVLEAV KKAKDSGKIK KGTNETTKAV ERSQAKLVVI AEDVQPEEIV AHLPLLCEEK KIPYVYVPSK KSLGEACGL QVAAASVALM DPGEAKDLVD EIVKRVNEIK GKSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL8

+
分子 #35: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 16.476072 KDa
配列文字列:
MVVRKEKKSR KYRGYRTHGW GTKGQHRDRG AQGGRQIGMH KEKWSWTVKF GEGWYGKHGF RNPTSKLVNA IGLRKLQEYI DNDKIKIEE ENGKKVVDLA KYGYDKLLGG GNLRLPLVIK VAKATEKAKE RVKEIGGEII LTSSE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L21e

分子名称: 50S ribosomal protein L21e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 11.15529 KDa
配列文字列:
VARSKGYRSK TRKLLEKKVR EKGAIPKLSL LMHDYSQGEY VVVKINPSIH KGMPHRRYHG KVGLVVGKRG KAYEVKVNIG DKERVLIVR PEHLIPFN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL21

+
分子 #37: DUF2280 domain-containing protein

分子名称: DUF2280 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 11.662535 KDa
配列文字列:
MKVVKYVLTA KIDYDGKEIE IKRSFRHRKN IFEFLKNADS NLKGALSEYA KQNKVKSSDL PLNEFITCGE IEEEQGVMRT ECKGKEKVS VKIEVQTQKI AK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #38: Conserved protein

分子名称: Conserved protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 8.320918 KDa
配列文字列:
MLKHQKYVYV DIGDQKKFLK VRFLKSRSEN NNPEAYVILD KISIKLPRNA KVIKYEDLPA EVKDKLKLKL

UniProtKB: Conserved protein

+
分子 #39: 50S ribosomal protein L47A

分子名称: 50S ribosomal protein L47A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 9.276666 KDa
配列文字列:
MKISNVESKY SMKVRGQELL IEEARNEKGE KIIIFQSLTS AKLLNNEEWK ENTTDAKNVE KREDLPQDVR KITGKILSLI

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #40: 50S ribosomal protein L1

分子名称: 50S ribosomal protein L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 24.416643 KDa
配列文字列: LADKESLIEA LKLALSTEYN VKRNFTQSVE IILTFKGIDM KKGDLKLREI VPLPKQPSKA KRVLVVPSFE QLEYAKKASP NVVITREEL QKLQGQKRPV KKLARQNEWF LINQESMALA GRILGPALGP RGKFPTPLPN TADISEYINR FKRSVLVKTK D QPQVQVFI ...文字列:
LADKESLIEA LKLALSTEYN VKRNFTQSVE IILTFKGIDM KKGDLKLREI VPLPKQPSKA KRVLVVPSFE QLEYAKKASP NVVITREEL QKLQGQKRPV KKLARQNEWF LINQESMALA GRILGPALGP RGKFPTPLPN TADISEYINR FKRSVLVKTK D QPQVQVFI GTEDMKPEDL AENAIAVLNA IENKAKVETN LRNIYVKTTM GKAVKVKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL1

+
分子 #41: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 22.396506 KDa
配列文字列: VLIKRHFLQK AAIKVMVDEY LAKQFYNAEY AGVEIVKTPI GTRVIIYAGR PPLIIGKGGK TIKQLAQVLE KFFGLENPQI TVTAAENPE LNARVMAFRL AIALEKGYHF RRAAFITIRR IMSSGAVGAE VIVSGKLTSE RAKYEKLKEG TVYKSGQQLE K IIDRAIGI ...文字列:
VLIKRHFLQK AAIKVMVDEY LAKQFYNAEY AGVEIVKTPI GTRVIIYAGR PPLIIGKGGK TIKQLAQVLE KFFGLENPQI TVTAAENPE LNARVMAFRL AIALEKGYHF RRAAFITIRR IMSSGAVGAE VIVSGKLTSE RAKYEKLKEG TVYKSGQQLE K IIDRAIGI AMLKPGVYGV EVVITKPTRS IDKIELKEKV EKT

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #42: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 21.86232 KDa
配列文字列: ENIEVSNLNV KVFGKWDTKV EVRDPSLKKY IDLMSIYLPH TGGRHEHRRF GKSRIPIVER LINNLMRPGR NKGKKMLAYN IVKTTFDII AVKTGQNPIQ VLVRAIENAA PREEVTRIMY GGIVYYVAVD VAPQRRVDLA LRHLVTGASE ASFNNPKPIE E ALAEEIIA ...文字列:
ENIEVSNLNV KVFGKWDTKV EVRDPSLKKY IDLMSIYLPH TGGRHEHRRF GKSRIPIVER LINNLMRPGR NKGKKMLAYN IVKTTFDII AVKTGQNPIQ VLVRAIENAA PREEVTRIMY GGIVYYVAVD VAPQRRVDLA LRHLVTGASE ASFNNPKPIE E ALAEEIIA AANNDNKSVA IRKKEEIERI ALSSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #43: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 11.775886 KDa
配列文字列:
TKARIRLWSS NIDSLNFVVN QIRNMAQKTG IQVSGPIPLP TTRMEVPVMR LPHGEGKKKW EHWEMKVHKR IIDIAADERV MRQLMRVRV PDDVYIEIEL I

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #44: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.140783 KDa
配列文字列:
QQQFKYIVRL FGQDVDGTMK LPYALAMIKG IGYNTAMIII RKLNLDKDKR LGEISDEDIK KIENLLNNKI IPESPNWIYN RQKDYESGA DMHLVTSDLI FYVRNDIERE RRSRSWRGVR HSLGLKVRGQ RTRTTGRTGA TIGVRRAK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #45: 30S ribosomal protein S14 type Z

分子名称: 30S ribosomal protein S14 type Z / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.190371 KDa
配列文字列:
KYKPPAERRF GKGVQLCKRC GSRDSVIQKY GLYLCRQCFR EVAYPMGFRK TR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #46: 30S ribosomal protein S17e

分子名称: 30S ribosomal protein S17e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 7.336366 KDa
配列文字列:
GNVYTKDIKR VARELYDKFK DQASDKYDDN KKLVDEYVNV SSKKVKNRIA GYLTRYVKIS KN

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #47: 30S ribosomal protein S19e

分子名称: 30S ribosomal protein S19e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.55966 KDa
配列文字列:
TVQMVPADIL IPKLAEYLKN NVKELNPPNW VYFAKTASFK ERVPDDIENW WYIRAASLLR HLYIYKEPIG LQKTRKLYSG SKRRGTKPP RSVKAPTHSI RTILQQLEKA GLVTKTRRGR ILSPKGRSLL DKLAYEMFKE LAEKKQDLKK Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #48: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 13.800354 KDa
配列文字列:
WKKFRYRGKS LEDLLNMPMD EFIKLLPSRQ RRSLKRGFSD KQRRLLEKIR KISREGKQNK VIKTHVRNMV ILPEMVGLRF AVYNGKEFV EFQVVPEMIG RYLGEYSITT KKVEHG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #49: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 15.638136 KDa
配列文字列:
QAEQNFMITY ARRKSARASC YIKPGNGKVF VNDIPIEIIP IEVVRYKIME PLVLAGDKIT SSIEARIYTQ GGGIMGQADA ARMALARAL VKFTNSKELV EIYKSYDRTM LAGDPRQTES EKWMRYSARR WRQKAYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #50: 30S ribosomal protein S28e

分子名称: 30S ribosomal protein S28e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 7.094255 KDa
配列文字列:
GFPAEVIQIL DRTGVTGEVT QVRVRVLEGR DKGRILTRNV KGPVRLGDIL ILRETEREAR KLS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #51: 30S ribosomal protein S27ae

分子名称: 30S ribosomal protein S27ae / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.261392 KDa
配列文字列:
QSKAVVRTYY EVEQDSIKLK NKKCPRCGSI MAHHMKPLER WACGKCGYTE FIGK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS31

+
分子 #52: 30S ribosomal protein S2

分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 22.474012 KDa
配列文字列: ELLVPLDTYL SAGVHIGTHT CTRYMERFIY RVRPEGLYVL DVRKIDERLR VAAKFISRFR PEAVLTVASR PYAFTPVQKF SEVVRGKEI SGRFPPGTLT NPYLDNYIEP EVLIVTDPRT DLQAIKEASK VGIPIVAFTD TDARVDFIDV IIPANNKGRK S LALLYWVL ...文字列:
ELLVPLDTYL SAGVHIGTHT CTRYMERFIY RVRPEGLYVL DVRKIDERLR VAAKFISRFR PEAVLTVASR PYAFTPVQKF SEVVRGKEI SGRFPPGTLT NPYLDNYIEP EVLIVTDPRT DLQAIKEASK VGIPIVAFTD TDARVDFIDV IIPANNKGRK S LALLYWVL ARQILRERKE IPLDGDIPLR VEDFETRL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #53: 30S ribosomal protein S4e

分子名称: 30S ribosomal protein S4e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 27.339988 KDa
配列文字列: VHITRFEAPW FLKVGKKEYK WIIRSRAGPH KIQESVPLAI LLKYYLKAVD TTREAKRIIF DGKVLVDGKV RRDYKYPVGL MDVVEIPSA DLRVRIIPDN VRYLTTINIS REDAKYKFVR IMNKTTLKSG VLQLNLEDGR NILLKGEELS QYNLPTLTTL K IELPEQKI ...文字列:
VHITRFEAPW FLKVGKKEYK WIIRSRAGPH KIQESVPLAI LLKYYLKAVD TTREAKRIIF DGKVLVDGKV RRDYKYPVGL MDVVEIPSA DLRVRIIPDN VRYLTTINIS REDAKYKFVR IMNKTTLKSG VLQLNLEDGR NILLKGEELS QYNLPTLTTL K IELPEQKI TTAYTIKEGV YAMIIGGRNA GLHGKISKIQ LAKYKRIKYS LVTLEGKDGS TFQTNLINVM AIGENEADSN LG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4

+
分子 #54: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 19.440623 KDa
配列文字列:
DPRKSKKKWM GPSHPWIKIN LGKEQILIGK YGLRNKKEIW IAQTMIRNFR HQARSLLALP PAERNIREKQ LIQKLYRMGI LEKDNSTLD DILSLTEENY LERRLQTIVY KKGLARTIYQ ARQLITHGHI AISGRKVTSP GYVVLRGEED LIDYYPTSPF K QNPPSQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #55: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 22.782686 KDa
配列文字列: EDWKPRTKVG QLIKEGKINS MKELFERNLP IVEPEIVDVL LPKLRYDIVD IGIVQKQTDA GELSRYKVLI VMGNMDGYIS YGTGKAKQL RVAIQKAIRD AKMRIIPVRR GCGSWECTCG ESHSLPFIVS GKAGSVEVTL LPAPKGTGLV VGSVLKTFLS L AGLKDVWS ...文字列:
EDWKPRTKVG QLIKEGKINS MKELFERNLP IVEPEIVDVL LPKLRYDIVD IGIVQKQTDA GELSRYKVLI VMGNMDGYIS YGTGKAKQL RVAIQKAIRD AKMRIIPVRR GCGSWECTCG ESHSLPFIVS GKAGSVEVTL LPAPKGTGLV VGSVLKTFLS L AGLKDVWS RTKGSTYTHE NFIKAAYIAL YNTYRFVTPV DWGRMK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #56: 30S ribosomal protein S6e

分子名称: 30S ribosomal protein S6e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 11.479355 KDa
配列文字列:
ALAYRTRAFQ LSLDQSKLPN LVGTKIGDVI DINVSGVNLK LKITGGSDNS GFSMRFDVGG GAKRKILVSG PPGYYPKEDG LRRKRTVRG NMITPEIVQI NTIMIR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #57: 30S ribosomal protein S8e

分子名称: 30S ribosomal protein S8e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 14.113179 KDa
配列文字列:
SYYQGNDSRK ITGGQKGKNR DKRKYELGSP PTETKISDKD IKEKDRVAGG NFKLRLRYAS YANVYDPQSK TAKKVKIISV LESPANREY ARRGIIVKGT LIQTELGKAK VTSRPGQDGI INALLLR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #58: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 14.624191 KDa
配列文字列:
INPLANALAT LYNNEMRRNK QALITPASKL IISVLRVMQK EGYIGEFEYI DDGRAGKIIV QLLGRINKCG PISPRYPLDY NGLLRLPDY IRKYLPSKEI GIIIISTPKG VMSHRDGIRE KIGGVTLGYV Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #59: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 13.652649 KDa
配列文字列:
REIRWGNARI YASQNNTIIT ITDITGAEII SKASGGMVVK ADREKPSPYA AMLAANKAAN DAFDKGISAI HIKVRAQGGY GSKTPGPGA QPAIRALARA GFIIGRIEDV TPLPHDTIRR PGGRRGRRV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #60: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 15.703551 KDa
配列文字列:
GSKSPKGLFA ARKLRLKRLK FSWSQRSFKR RMLALKEKFD PLEGAPMARG IVLEKVGIES RQPNSAVRKA VRVQLVKNGR IVTAFVPGD GGVNFIDEHD EVVIAGIGGT LGRSMGDLPG VRYKVVMVNG VSLDALYKGK KQKP

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #61: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 17.438426 KDa
配列文字列:
MNKKRAKGNS HSIRPVRSGP PKWVRFTREE VELLVEELAK RGYPPSMIGM VLRDQYGVPL VKQITGRKLT AILQDRNMKP KIPEDLFNL MRRAVNIRRH LFEYPKDKSA KRGLEEVESK IRRLASYYKE TGKLPQEWSY DPAKAELLVT

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #62: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 12.602619 KDa
配列文字列:
KKGQLVKNVG IEGVSAPSKT CDDEYCPYHG SLKVRGIVLE GKLIRARANR TGTVEREYIF YDSKYKRYER RRSRIHVHIP SCLEVKEGD NVIIGESRPI AKSISFVILG VK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #63: 30S ribosomal protein S24e

分子名称: 30S ribosomal protein S24e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 10.765213 KDa
配列文字列:
VSDKVEGIVE RDIQNNVANR RELYIKLFHI GSGTPSRKEL VKAIASTFST AEDLVVVKKV FTNYGSGISY ARVNVYKDKD SLQKLEPQY LIGRDTG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS24

+
分子 #64: 30S ribosomal protein S27e

分子名称: 30S ribosomal protein S27e / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 6.576969 KDa
配列文字列:
MKAKFKILIP EPKSKFIRVK CRQCNNEQVI FSNATFPVRC LSCGAQIVIP KGGKAKIEG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27

+
分子 #65: 30S ribosomal protein S3Ae

分子名称: 30S ribosomal protein S3Ae / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 21.876621 KDa
配列文字列: IRDKWKLKKW YVITAPKVFG EALLGSTPAY DINKALSRKI EVTLYDLTGD YNLVYIHLYF KILGNISGDK LSTIFYGHEL SRDYIRSLV RRKSSKINAV VDVTTKDGYM LRVKGLVLTT YRAHISQKTA IRKVISDITR KKAEESDFDQ FVQDVIFGKL S NDIFQEAK ...文字列:
IRDKWKLKKW YVITAPKVFG EALLGSTPAY DINKALSRKI EVTLYDLTGD YNLVYIHLYF KILGNISGDK LSTIFYGHEL SRDYIRSLV RRKSSKINAV VDVTTKDGYM LRVKGLVLTT YRAHISQKTA IRKVISDITR KKAEESDFDQ FVQDVIFGKL S NDIFQEAK KIYPLRKVEI EKTKLLKAPK V

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #68: PHE-PHE-PHE-PHE-PHE-PHE

分子名称: PHE-PHE-PHE-PHE-PHE-PHE / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 (好気性・好酸性)
分子量理論値: 901.058 Da
配列文字列:
FFFFFF

+
分子 #69: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 69 / コピー数: 1 / 式: GNP
分子量理論値: 522.196 Da
Chemical component information

ChemComp-GNP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Gpp(NH)p / GppNHp, GMPPNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM / 5'-Guanylyl imidodiphosphate

+
分子 #70: UNKNOWN

分子名称: UNKNOWN / タイプ: ligand / ID: 70 / コピー数: 57 / 式: UNK
分子量理論値: 103.12 Da
Chemical component information

ChemComp-UNK:
UNKNOWN / (S)-2-アミノ酪酸

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態2D array

-
試料調製

濃度5 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 26.7 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

4v51

初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 3095

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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