ChemComp-JN3: CHENODEOXYCHOLIC ACID

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: JN3
• 名称: 名称: chenodeoxycholic acid; 別称: (3ALPHA,5ALPHA,7BETA,8ALPHA,17ALPHA)-3,7-DIHYDROXYCHOLAN-24-OIC ACID; 日化辞名称: ケノデオキシコ-ル酸
• ウィキペディア: ウィキペディア - ケノデオキシコール酸: ケノデオキシコール酸（ケノデオキシコールさん、英:Chenodeoxycholic acid, CDCA）は、胆汁酸の一種である。ケノデオキシコール酸は、白い結晶物で水に溶けないがアルコールや酢酸には溶け、融点は165-167 °Cである...

Chemical information

組成

組成式: C₂₄H₄₀O₄ / 原子数: 68 / 化学式量: 392.572 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: JN3 / 理論座標の詳細: OpenEye/OEToolkits V1.4.2

履歴

作成	2007年1月2日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / Brenda / ChEBI / ChEMBL / ChemicalBook / CompTox / DailyMed / DrugBank / GtoPharmacology / HMDB / KEGG_Ligand / LipidMaps / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)CCC(C4C3(C(C1C(C2(C(CC1O)CC(O)CC2)C)CC3)CC4)C)C
• CACTVS 3.341: C[CH](CCC(O)=O)[CH]1CC[CH]2[CH]3[CH](O)C[CH]4C[CH](O)CC[C]4(C)[CH]3CC[C]12C
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(CCC(=O)O)C1CCC2C1(CCC3C2C(CC4C3(CCC(C4)O)C)O)C

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: C[C@H](CCC(O)=O)[C@H]1CC[C@H]2[C@@H]3[C@H](O)C[C@@H]4C[C@H](O)CC[C@]4(C)[C@H]3CC[C@]12C
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C[C@H](CCC(=O)O)[C@H]1CC[C@@H]2[C@@]1(CC[C@H]3[C@H]2[C@@H](C[C@H]4[C@@]3(CC[C@H](C4)O)C)O)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C24H40O4/c1-14(4-7-21(27)28)17-5-6-18-22-19(9-11-24(17,18)3)23(2)10-8-16(25)12-15(23)13-20(22)26/h14-20,22,25-26H,4-13H2,1-3H3,(H,27,28)/t14-,15+,16-,17-,18+,19+,20-,22+,23+,24-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RUDATBOHQWOJDD-BSWAIDMHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (3alpha,5alpha,7beta,8alpha,17alpha)-3,7-dihydroxycholan-24-oic acid
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (4R)-4-[(3R,5S,7R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3,7-dihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-2jn3:
NMR structure of cl-BABP complexed to chenodeoxycholic acid

PDB-3o02:
The Crystal Structure of the Salmonella Type III Secretion System Tip Protein SipD in Complex with Chenodeoxycholate

PDB-6hl1:
Crystal Structure of Farnesoid X receptor (FXR) with bound NCoA-2 peptide and CDCA

PDB-6ie9:
RamR in complex with chenodeoxycholic acid

PDB-7svg:
Bile Salt Hydrolase A from Lactobacillus gasseri with chenodeoxycholate and taurine bound

PDB-8dml:
Vibrio parahaemolyticus VtrA/VtrC complex bound to the bile salt chenodeoxycholate