ChemComp-3R2: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-{[(1S,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-methylcy...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 3R2
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-{[(1S,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-methylcyclohexyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-3,4-dihydrothymidine

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₈N₂O₁₃P₂ / 原子数: 62 / 化学式量: 530.357 / 形式電荷: 0

その他

4rif

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 3R2 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4RIF

履歴

作成	2014年10月10日
公開	2015年1月28日

• 外部リンク: UniChem / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(OC1CC(C)C(O)C(O)C1)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(N2C(=O)NC(=O)C(=C2)C)CC3O
• CACTVS 3.385: C[CH]1C[CH](C[CH](O)[CH]1O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH](C[CH]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1CC(CC(C1O)O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(CC(O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@H]1C[C@@H](C[C@@H](O)[C@@H]1O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@H]1C[C@@H](C[C@H]([C@@H]1O)O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H28N2O13P2/c1-8-3-10(4-12(21)15(8)22)31-34(27,28)32-33(25,26)29-7-13-11(20)5-14(30-13)19-6-9(2)16(23)18-17(19)24/h6,8,10-15,20-22H,3-5,7H2,1-2H3,(H,25,26)(H,27,28)(H,18,23,24)/t8-,10-,11-,12+,13+,14+,15+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: CWVOKCJHBPKJQP-PVMIAKCWSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-{[(1S,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-methylcyclohexyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-3,4-dihydrothymidine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(1S,3S,4R,5R)-3-methyl-4,5-bis(oxidanyl)cyclohexyl] [[(2R,3S,5R)-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-4rif:
Landomycin Glycosyltransferase LanGT2, carbasugar substrate complex

PDB-4rih:
Chimeric Glycosyltransferase LanGT2S8Ac, carbasugar substrate complex