ChemComp-AFH: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE-2-DEOXY-2-FLUORO HEPTOSE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AFH
• 名称: 名称: adenosine-5'-diphosphate-2-deoxy-2-fluoro heptose; 別称: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (2S,3R,4S,5S,6R)-6-[(1S)-1,2-DIHYDROXYETHYL]-3-FLUORO-4,5-DIHYDROXYTETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE; 日化辞名称: アデノシン5′-[二りん酸P²-(2-フルオロ-2-デオキシ-α-L-glycero-D-glu(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₆FN₅O₁₅P₂ / 原子数: 66 / 化学式量: 621.359 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AFH

履歴

作成	2006年7月24日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(OC1OC(C(O)C(O)C1F)C(O)CO)(O)OP(=O)(O)OCC4OC(n2c3ncnc(N)c3nc2)C(O)C4O
• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[CH]4O[CH]([CH](O)CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4F)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC4C(C(C(C(O4)C(CO)O)O)O)F)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@](O)(=O)O[C@@H]4O[C@H]([C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4F)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)O[C@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)[C@H](CO)O)O)O)F)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H26FN5O15P2/c18-7-10(27)11(28)13(5(25)1-24)36-17(7)37-40(32,33)38-39(30,31)34-2-6-9(26)12(29)16(35-6)23-4-22-8-14(19)20-3-21-15(8)23/h3-7,9-13,16-17,24-29H,1-2H2,(H,30,31)(H,32,33)(H2,19,20,21)/t5-,6+,7+,9+,10+,11-,12+,13+,16+,17-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SUPCMUQXGKOKIM-FJBXLJLUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2S,3R,4S,5S,6R)-6-[(1S)-1,2-dihydroxyethyl]-3-fluoro-4,5-dihydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl [[(2S,3R,4S,5S,6R)-6-[(1S)-1,2-dihydroxyethyl]-3-fluoro-4,5-dihydroxy-oxan-2-yl]oxy-hydroxy-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-2h1h:
E. coli heptosyltransferase WaaC with ADP-2-deoxy-2-fluoro heptose