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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDC37 |
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試料 | Saposin nanoparticle (SapNP) SapA:SoyPI
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 positive regulation of beta-galactosidase activity / ganglioside GM1 transport to membrane / ganglioside GM2 binding / ganglioside GM3 binding / ganglioside GP1c binding / ganglioside GM1 binding / ganglioside GT1b binding / sphingolipid metabolic process / prostate gland growth / epithelial cell differentiation involved in prostate gland development ...positive regulation of beta-galactosidase activity / ganglioside GM1 transport to membrane / ganglioside GM2 binding / ganglioside GM3 binding / ganglioside GP1c binding / ganglioside GM1 binding / ganglioside GT1b binding / sphingolipid metabolic process / prostate gland growth / epithelial cell differentiation involved in prostate gland development / Glycosphingolipid catabolism / lysosomal transport / azurophil granule membrane / regulation of lipid metabolic process / enzyme activator activity / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway / lysosomal lumen / Peptide ligand-binding receptors / regulation of autophagy / phospholipid binding / late endosome / Platelet degranulation / G alpha (i) signalling events / scaffold protein binding / protease binding / collagen-containing extracellular matrix / lysosome / lysosomal membrane / intracellular membrane-bounded organelle / Neutrophil degranulation / protein homodimerization activity / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Homo sapiens (ヒト) Glycine max (ダイズ) |
引用 | 日付: 2018 Feb タイトル: Saposin Lipid Nanoparticles: A Highly Versatile and Modular Tool for Membrane Protein Research 著者: Flayhan A / Mertens H / Ural-Blimke Y / Martinez Molledo M / Svergun D |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1501 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (2.9.0) / ダミー原子の半径: 1.80 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 4.835 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: Saposin nanoparticle (SapNP) SapA:SoyPI / Entity id: 779 / 781 |
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バッファ | 名称: PBS / PK: 7 / pH: 7.4 |
要素 #779 | 名称: sapA / タイプ: protein / 記述: saposin-a / 分子量: 9.084 / 分子数: 1 / 由来: Homo sapiens / 参照: UniProt: P07602 配列: SMSLPCDICK DVVTAAGDML KDNATEEEIL VYLEKTCDWL PKPNMSASCK EIVDSYLPVI LDIIKGEMSR PGEVCSALNL CES |
要素 #781 | 名称: soyPI / タイプ: other / 記述: L-α-phosphatidylinositol (soy) / 分子量: 0.866 / 由来: Glycine max |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 3.1 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: sapAsoyPI / 測定日: 2016年12月15日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 0.05 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 1200 /
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結果 | カーブのタイプ: extrapolated
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