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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDCV8 |
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試料 | Uncharacterized protein CTHT_0072540 (Prp19 full-length) from Chaetomium thermophilum
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 Prp19 complex / protein K63-linked ubiquitination / spliceosomal complex / RING-type E3 ubiquitin transferase / mRNA splicing, via spliceosome / ubiquitin protein ligase activity / DNA repair 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Chaetomium thermophilum (菌類) |
引用 | ジャーナル: Mol Cell / 年: 2018 タイトル: Prp19/Pso4 Is an Autoinhibited Ubiquitin Ligase Activated by Stepwise Assembly of Three Splicing Factors. 著者: Tales Rocha de Moura / Sina Mozaffari-Jovin / Csaba Zoltán Kibédi Szabó / Jana Schmitzová / Olexandr Dybkov / Constantin Cretu / Michael Kachala / Dmitri Svergun / Henning Urlaub / ...著者: Tales Rocha de Moura / Sina Mozaffari-Jovin / Csaba Zoltán Kibédi Szabó / Jana Schmitzová / Olexandr Dybkov / Constantin Cretu / Michael Kachala / Dmitri Svergun / Henning Urlaub / Reinhard Lührmann / Vladimir Pena / 要旨: Human nineteen complex (NTC) acts as a multimeric E3 ubiquitin ligase in DNA repair and splicing. The transfer of ubiquitin is mediated by Prp19-a homotetrameric component of NTC whose elongated ...Human nineteen complex (NTC) acts as a multimeric E3 ubiquitin ligase in DNA repair and splicing. The transfer of ubiquitin is mediated by Prp19-a homotetrameric component of NTC whose elongated coiled coils serve as an assembly axis for two other proteins called SPF27 and CDC5L. We find that Prp19 is inactive on its own and have elucidated the structural basis of its autoinhibition by crystallography and mutational analysis. Formation of the NTC core by stepwise assembly of SPF27, CDC5L, and PLRG1 onto the Prp19 tetramer enables ubiquitin ligation. Protein-protein crosslinking of NTC, functional assays in vitro, and assessment of its role in DNA damage response provide mechanistic insight into the organization of the NTC core and the communication between PLRG1 and Prp19 that enables E3 activity. This reveals a unique mode of regulation for a complex E3 ligase and advances understanding of its dynamics in various cellular pathways. |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1468 | タイプ: atomic / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 1.555 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #1469 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r9988) / ダミー原子の半径: 3.60 A / カイ2乗値: 1.003 / P-value: 0.030000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Uncharacterized protein CTHT_0072540 (Prp19 full-length) from Chaetomium thermophilum 試料濃度: 0.60-4.40 |
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バッファ | 名称: 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 2 mM β-mercaptoethanol / pH: 7.5 |
要素 #763 | タイプ: protein / 記述: Full-length hypothetical protein CTHT_0072540 / 分子量: 51.788 / 分子数: 4 / 由来: Chaetomium thermophilum / 参照: UniProt: G0SFY0 配列: MLCALSGEIP EEPVVSKKTG VLFEKRLILK YLEEHNNIEP GTTEELDPET DLLPIKTSRV VRPRPPNFTS IPSLLKAFQD EWDALVLETY TTREQLARVR EELATALYQH DAAVRVIARL TRERDEAREA LARLTVTGAA PAAQNGEAMA VDSESLSEGL VEHVNEVQQQ ...配列: MLCALSGEIP EEPVVSKKTG VLFEKRLILK YLEEHNNIEP GTTEELDPET DLLPIKTSRV VRPRPPNFTS IPSLLKAFQD EWDALVLETY TTREQLARVR EELATALYQH DAAVRVIARL TRERDEAREA LARLTVTGAA PAAQNGEAMA VDSESLSEGL VEHVNEVQQQ LMKTRKKRPI PQGWATADDV AALQQVAYTD LNVTQASSLD LENECAAVGG LDGKLDIYSV VANKVERTLD IGEPVTATEW TGTKVVIGTA KGWVKVYDAG RESATFQTHA GPVTGLAVHP GGRILASVGV DKSFVFYDLE TGERVARGYA DAALTTCAFH PDGNLFAAGT QTGHILVFHT TTLEQAESFP LGTPIQALAF SENGFWFAAT GKGTSSVTIF DLRKSGAAAA VKELQTGEVL SISWDYTGQY LATGGGTGVT VQMYTKATKS WSEPVRLGMP VVGVKWGGEA KRLVVVSREG VVSVLGKKEE |
-実験情報
ビーム | 設備名称: MAX IV I911-4 / 地域: Lund / 国: Sweden / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.091 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.2 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Uncharacterized protein CTHT_0072540 (Prp19 full-length) from Chaetomium thermophilum 測定日: 2013年10月15日 / セル温度: 25 °C / 照射時間: 120 sec. / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 263 /
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結果 | カーブのタイプ: merged
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