SASDB29: Single stranded poly-deoxyadenosine DNA (30mer, dA30) in 200 mM NaCl

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登録情報	データベース: SASBDB / ID: SASDB29
試料	Single stranded poly-deoxyadenosine DNA (30mer, dA30) in 200 mM NaCl Poly-deoxyadenosine (30mer) (DNA), dA30
引用	日付: 2017 Feb 25 タイトル: The impact of base stacking on the conformations and electrostatics of single-stranded DNA 著者: Plumridge A / Meisburger S / Andresen K
登録者	Alex Plumridge (Cornell University, Ithaca, NY, United States)

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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Data source

SASBDBのページ	SASDB29

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試料	名称: Single stranded poly-deoxyadenosine DNA (30mer, dA30) in 200 mM NaCl 試料濃度: 0.50-1.80
バッファ	名称: 1mM Na MOPS, 200mM NaCl / pH: 7
要素 #401	名称: dA30 / タイプ: DNA / 記述: Poly-deoxyadenosine (30mer) / 分子量: 9.3 / 分子数: 1 配列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA

ビーム

設備名称: Cornell High Energy Synchrotron Source (CHESS) G1
地域: Ithaca, NY / 国: USA

/ 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.1 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.8 mm

検出器

名称: Finger Lakes CCD / タイプ: CCD

スキャン

タイトル: Single stranded poly-deoxyadenosine DNA (30mer, dA
測定日: 2015年4月1日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 22 °C / 照射時間: 10 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/A /

	Min	Max
Q	0.01	0.29

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 267 /

	Min	Max
Q	0.015	0.281
P(R) point	1	267
R	0	94.17

結果

カーブのタイプ: extrapolated /

	実験値	Porod
分子量	9 kDa	-
体積	-	14.5 nm³

	Guinier	Guinier error	P(R)
前方散乱 I0	48.78	0.4	-
慣性半径, Rg	2.68 nm	0.04	2.7 nm

	Min	Max
D	-	9.5
Guinier point	6	37

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関連情報:EMDBヘッダ

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