PDB-9sa7: Crystal structure of Methanocaldococcus jannaschii Malate dehydro...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9sa7

タイトル

Crystal structure of Methanocaldococcus jannaschii Malate dehydrogenase C7 mutant

要素

L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+))

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Malate dehydrogenase / NADP binding domain

機能・相同性

機能・相同性情報

L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase [NAD(P)+] / pyruvate catabolic process / L-lactate dehydrogenase (NAD+) activity / lactate metabolic process / tricarboxylic acid cycle / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Methanocaldococcaceae (古細菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Coquille, S. / Madern, D.

資金援助

フランス, 2件

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2026
タイトル: Unraveling the Link Between Thermal Adaptation and Latent Allostery in Malate Dehydrogenase From Methanococcales.
著者: Pereira, C.S. / Coquille, S. / Brochier-Armanet, C. / Sterpone, F. / Madern, D.

履歴

登録	2025年8月7日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2025年11月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年12月3日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.page_first / _citation.page_last ..._citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.name
改定 1.2	2026年2月25日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.title / _citation.year

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9sa7.cif.gz	772 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9sa7.ent.gz	598 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9sa7.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sa/9sa7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sa/9sa7	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	9s3kC 9s3yC 9sc9C 9sd3C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#102 - 2008年6月乳酸脱水素酵素 (Lactate Dehydrogenase) 類似性 (7) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (6) #142 - 2011年10月 PDBの先駆者たち (PDB Pioneers) 類似性 (7) #34 - 2002年10月ジヒドロ葉酸還元酵素 (Dihydrofolate Reductase) 類似性 (1) #57 - 2004年9月カタラーゼ (Catalase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+))

B: L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+))

D: L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+))

C: L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+))

ヘテロ分子

141 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, homology

単位格子

Length a, b, c (Å)	87.764, 87.764, 338.338
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	154
Space group name H-M	P3₂21
Space group name Hall	P3₂2"
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -y,x-y,z+2/3 #3: -x+y,-x,z+1/3 #4: x-y,-y,-z+1/3 #5: -x,-x+y,-z+2/3 #6: y,x,-z

#1: タンパク質	L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase (NAD(P)(+)) / MdhII 分子量: 34550.133 Da / 分子数: 4 変異: E42K, E46M, K105N, D135E, R140K, K198R, K217Y, E219K, R223D, R278K, D250N, K306G 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Methanocaldococcaceae (古細菌) / 遺伝子: mdh, mdhB, MJ0490 発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌) 参照: UniProt: Q60176, L-2-hydroxycarboxylate dehydrogenase [NAD(P)+]
#2: 化合物	ChemComp-NDP / NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE 分子量: 745.421 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₃₀N₇O₁₇P₃
研究の焦点であるリガンドがあるか	N
Has protein modification	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.67 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.9 % / 解説: Pyramidal shape
結晶化	温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 19-29 % Ethylene glycol Cryogenic conditions: 35% Ethylene glycol

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID30B / 波長: 0.873128 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2023年5月13日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.873128 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→169.17 Å / Num. obs: 34675 / % possible obs: 99.3 % / 冗長度: 3.8 % / B_iso Wilson estimate: 72.14 Å² / CC_1/2: 0.99 / R_merge(I) obs: 0.148 / R_pim(I) all: 0.08 / R_rim(I) all: 0.17 / Net I/σ(I): 4.3
反射シェル	解像度: 2.8→2.945 Å / R_merge(I) obs: 1.547 / Mean I/σ(I) obs: 1.1 / Num. unique obs: 1704 / CC_1/2: 0.392 / R_pim(I) all: 0.843 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.21.2_5419+SVN	精密化
XDS		データ削減
STARANISO		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.8→112.78 Å / SU ML: 0.3221 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 28.3046
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2464	1581	4.8 %
R_work	0.2152	31337	-
obs	0.2167	32918	85.61 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 75.58 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.8→112.78 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9474	0	192	0	9666

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0075	9798
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.8178	13243
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.048	1573
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0042	1660
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.1391	3710

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.8-2.89	0.4395	43	0.3548	886	X-RAY DIFFRACTION	27.17
2.89-2.99	0.3112	66	0.3066	1406	X-RAY DIFFRACTION	42.99
2.99-3.11	0.3345	130	0.3141	2489	X-RAY DIFFRACTION	76
3.11-3.26	0.3343	168	0.3083	3265	X-RAY DIFFRACTION	99.56
3.26-3.43	0.3592	133	0.2948	3273	X-RAY DIFFRACTION	99.21
3.43-3.64	0.3031	181	0.2589	3267	X-RAY DIFFRACTION	98.94
3.64-3.92	0.2672	190	0.2358	3232	X-RAY DIFFRACTION	99.65
3.92-4.32	0.2462	153	0.2086	3335	X-RAY DIFFRACTION	99.66
4.32-4.94	0.1862	150	0.1735	3358	X-RAY DIFFRACTION	99.4
4.94-6.23	0.2214	178	0.1961	3347	X-RAY DIFFRACTION	99.16
6.23-112.78	0.1982	189	0.1659	3479	X-RAY DIFFRACTION	97.27

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.27991163483	-0.294798323961	-0.639133460273	2.43386505692	-0.469092024157	2.40427387397	0.143398590011	0.323547360253	-0.218091820315	-0.127654845911	0.175571590827	0.424979626527	0.272914749012	-0.490364633676	-0.31653820235	0.420391138173	-0.031820343463	-0.10058511242	0.45140499213	0.035035120348	0.598321032651	-44.0452104915	14.0670209181	34.4751023549
2	1.81626764493	0.605771009251	-0.163941146969	2.26379579423	-0.655270435679	0.628758638771	0.0912191309733	0.230093743274	-0.317789356121	-0.38557311526	-0.00185751358592	0.205921283133	0.450715446889	0.0222140462288	-0.0804693349177	0.649296813872	0.0265223142539	-0.0954205057886	0.288088049544	-0.0530715547454	0.429927074246	-29.8572815441	0.271793369794	37.0957543367
3	1.53363296102	0.264274699735	0.0169314255144	2.00459511237	-0.364192714471	1.54050164349	-0.054296473034	0.208663275742	-0.314674223796	-0.252551414375	-0.0840367500946	-0.113628625123	0.352530636298	0.272275707056	0.137832380599	0.611349746392	0.105138186592	-0.0198030798575	0.350946765852	-0.0618760240793	0.424138196708	-17.6809885445	3.16325864474	36.3633721522
4	4.41755402135	0.319487826466	-0.768500461964	1.84297095096	-0.556580897908	3.05095023328	0.0698549353296	0.610198618363	-0.825681119548	-0.681728451333	-0.08283039488	-0.560699971098	0.809508442072	0.197760083022	0.0168978759039	0.874029350578	0.175228583046	0.0147007996256	0.393239265499	-0.0427001889334	0.703387245201	-21.3897410122	-12.9276935745	40.0529017592
5	1.32910689271	-1.63860811804	0.218616063723	3.0659857585	-0.389850310408	2.74023615052	-0.340386351534	-0.259084903506	0.115147414753	0.957734010292	0.0678946267681	0.0286703768905	-0.15590773569	0.171389284622	0.278712037707	0.71657808914	-0.00498905908935	-0.0808654290227	0.290250619411	0.0028720221526	0.404321523865	-27.7210789278	27.0085519278	52.6178396915
6	2.14447827077	-0.602652919007	0.904718843134	3.37541384181	-0.32473496068	2.83451596113	-0.252933473919	-0.17042471384	0.433080952047	0.851132483005	0.290924019432	0.420868782327	-0.730165981743	-0.494739402534	-0.0254950444034	0.707476928228	0.118197852457	0.0962776198061	0.304917333602	0.0258526971802	0.61771874557	-44.1651784708	41.6608806383	45.0457637743
7	4.00338168929	0.393285377715	0.0628647194967	3.26964249876	0.135610879442	3.07245808559	0.185732709262	0.346706966679	0.230043104505	0.180480982853	-0.306153561661	-0.355049180695	-0.893689598274	1.3634618876	0.140902340833	0.59743968589	-0.258772926727	0.0373411909217	0.70506067921	0.0242488442018	0.5079946352	-9.39085762031	39.3144012228	20.8139476203
8	1.31855185893	-0.225568544309	-0.267562975519	1.06211077281	-0.643498200869	0.794620048149	-0.317853746921	0.33293714524	0.806164379947	-0.315817965989	0.17269985227	-0.353400984994	-0.27047100487	0.499912916228	0.214816103472	0.92795267941	-0.337955462997	-0.016667263963	0.677297012902	0.0684309831607	0.718701974415	-12.2203523415	46.2587139119	20.0252498669
9	1.34645816484	-0.533922846016	0.683062340911	1.43439904388	-0.650221417208	0.540716210032	0.278360119694	0.462414695435	0.321234376813	-0.106179706135	-0.118523039419	-0.728260662161	-0.763632589405	0.649529818023	-0.0391601202765	0.887395501638	-0.444034127403	0.0380349368362	0.983689205685	0.0304781427921	0.847409277444	0.20832061369	43.1101239167	21.6786269063
10	1.22206437668	-0.00705028235063	0.293859734609	0.166715384783	-0.154557551426	0.160789484788	0.0528684938933	0.341221377549	0.701448467998	0.123101541942	-0.259596595216	-0.609813952011	-0.655025794621	0.839617325264	0.259116427378	0.605997930672	-0.347511798149	-0.0273024278369	0.968326789697	0.164676719565	1.03725784838	6.8066053491	34.7681565756	23.8562001084
11	1.58369085901	0.240378066815	0.483853608288	2.66645434655	-0.489886911873	1.72121367901	0.0181958835521	0.50524311652	-0.313707944216	0.113354193473	0.0553333065927	-0.414487081287	0.297813254919	0.847349727269	-0.0449606826158	0.594512503411	0.0314327647179	0.139421242944	0.684493040659	-0.0415335129245	0.600590538915	-2.81940953914	16.82443932	21.7818936028
12	2.09830501647	0.192587071811	0.667760641842	1.2968724112	1.11609485279	1.25234583821	-0.135121955554	0.63358214204	-0.368449767542	-0.107802404917	0.247877934306	-0.273567153706	0.503554222518	0.372668107487	-0.144511593725	0.961747403843	0.049923826248	0.143053908366	0.966059408611	-0.169478207359	0.697749979508	-4.49057026467	13.5373950152	10.3982599194
13	2.29250333738	0.0930275506368	0.763850018281	2.23811301482	0.342596747506	1.99964820352	0.00907864768516	0.113724876433	-0.0422333282019	0.403473504579	-0.120125497156	-0.622499868265	-0.000811006834811	0.935503133018	0.135125200181	0.623580210722	-0.109355846269	-0.0599465761783	0.790422873959	0.0797841537816	0.622167635991	0.631604575857	23.9172512246	29.3059205026
14	0.314641806568	0.52571067294	0.231042115686	0.926052072355	0.415767323788	2.14402800987	0.0555262137268	1.26628018124	-0.44562439918	0.259497450195	-0.117286988019	-0.298896371512	0.789294906912	1.56783577974	-0.171235187324	0.576441021306	0.210747885842	0.285594115726	1.43261553163	0.141241835309	1.21124991298	14.0101227171	16.1811219292	19.0447260623
15	3.98070327975	-0.138509974364	0.118451429399	3.75229185398	0.572058749984	3.87438863738	-0.151220132022	1.06802895085	-0.0781433071801	-0.48251762129	-0.159457640938	0.327565096153	0.132676704149	-0.249126795875	0.281316713169	0.684616778708	-0.220251333969	-0.0336157969983	0.62465230725	-0.0152689018048	0.410355038127	-23.9096634217	31.0213905386	7.31214053814
16	1.5786044813	-1.1686123136	-0.127399722396	1.67835231459	-0.406730713675	1.97860355673	-0.00983677253325	0.387462212392	-0.102662248439	-0.590440393553	-0.19481484519	0.198058998662	0.174893181703	0.342387316546	0.236178258712	0.888048735828	-0.194017595323	0.0442276906755	0.799617345448	-0.122677036356	0.52122713088	-22.4650696178	26.4626050791	3.01911056079
17	4.94401624832	-0.731637218792	-0.21449658656	0.219654787804	-0.441529501418	1.68004411388	0.798728561807	2.06485056316	-0.108717464371	-0.246689561151	-0.328469205245	-0.206136720439	-0.280314710034	-1.13230878411	-0.358662716206	1.28894816559	-0.0641374376814	-0.108485382655	1.35181659178	0.136259646506	0.506542525947	-31.4133929829	39.4537235801	-8.22408213185
18	1.15050397575	-0.762974156257	0.253524763423	0.394358003113	-0.167560138436	1.05472362101	-0.230951986184	0.959974907162	-0.0633912054543	-0.518992770389	-0.0599761967063	0.309939900103	-0.333023198571	-0.232588762269	0.25820884292	0.94726370532	-0.233964409223	-0.307012432905	1.01195214125	0.0358110058992	0.626367843398	-36.4867013511	38.3378293814	-1.48775134445
19	2.26311131642	-0.860703706684	0.23315951321	0.986315969085	-0.288301176233	1.28672064014	0.278845647845	0.270509046846	0.253236946533	0.445880527716	-0.083752956079	0.170637991602	-0.467071552176	-0.304855691808	-0.374357981501	0.953087631151	-0.183656021942	-0.0979298078435	0.52085883834	0.160401491689	0.540409551365	-35.9824258227	44.5421783396	12.9575716342
20	1.20892952254	-0.56878670359	1.18094011736	0.919052880961	-0.559942594268	1.35411352822	-0.109697342746	0.100327597294	0.547414948223	-0.150596203309	0.159680011612	0.320009785311	-1.16887169793	-0.0289838630685	0.0114422516059	1.1064118282	-0.0246743395257	-0.194194688771	0.577057990992	0.153562909911	0.786789905193	-35.2710768394	54.7031098734	19.9611001639
21	0.905999662445	-0.46293334362	-0.18326351	1.67212024456	0.676082901936	1.83202360621	-0.18019322198	0.909839325797	-0.0932291074371	-0.311562952774	-0.0378896158435	0.357500302622	-0.232650607567	-0.128630335782	0.133622391325	0.685826175634	-0.229973689792	-0.178041445557	0.737726804708	0.0880145344918	0.617975276374	-37.43518304	40.9855086035	10.0942332607
22	3.48937331099	0.347269307117	0.0589973946127	3.7855290823	-1.01537589474	3.46701979254	0.183209024369	0.592142577084	-0.632590545379	0.00524844599708	0.191200876738	0.927148460484	-0.142083285465	-0.457063806897	-0.462899547022	0.692823708014	-0.158228906743	-0.241131770611	0.875920183265	0.109468910299	0.801435152247	-47.7254960818	41.1269067603	12.3313642402
23	0.504556481907	0.093897385021	-0.509147890871	0.476781145216	0.65685533953	1.11905685378	-0.608955861026	0.679388911162	0.779218912892	-0.541020649469	-0.00817298269726	0.160933691517	-1.12783920192	-0.710565132137	0.438825869992	1.48389194592	0.0456812952861	-0.367505351496	1.19600480646	0.419826726422	1.01223624023	-42.6049970478	53.5835137036	-0.930454190871

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	chain 'A' and (resid 1 through 72 )	A	A	1 - 72	1 - 72
2	2	chain 'A' and (resid 73 through 179 )	A	A	73 - 179	73 - 179
3	3	chain 'A' and (resid 180 through 289 )	A	A	180 - 289	180 - 289
4	4	chain 'A' and (resid 290 through 312 )	A	A	290 - 312	290 - 312
5	5	chain 'B' and (resid 1 through 91 )	B	C	1 - 91	1 - 91
6	6	chain 'B' and (resid 92 through 313 )	B	C	92 - 313	92 - 313
7	7	chain 'D' and (resid 1 through 22 )	D	E	1 - 22	1 - 22
8	8	chain 'D' and (resid 23 through 52 )	D	E	23 - 52	23 - 52
9	9	chain 'D' and (resid 53 through 113 )	D	E	53 - 113	53 - 109
10	10	chain 'D' and (resid 114 through 136 )	D	E	114 - 136	110 - 132
11	11	chain 'D' and (resid 137 through 195 )	D	E	137 - 195	133 - 191
12	12	chain 'D' and (resid 196 through 229 )	D	E	196 - 229	192 - 225
13	13	chain 'D' and (resid 230 through 289 )	D	E	230 - 289	226 - 282
14	14	chain 'D' and (resid 290 through 306 )	D	E	290 - 306	283 - 299
15	15	chain 'C' and (resid 1 through 22 )	C	G	1 - 22	1 - 22
16	16	chain 'C' and (resid 23 through 91 )	C	G	23 - 91	23 - 87
17	17	chain 'C' and (resid 92 through 113 )	C	G	92 - 113	88 - 109
18	18	chain 'C' and (resid 114 through 136 )	C	G	114 - 136	110 - 132
19	19	chain 'C' and (resid 137 through 163 )	C	G	137 - 163	133 - 159
20	20	chain 'C' and (resid 164 through 222 )	C	G	164 - 222	160 - 218
21	21	chain 'C' and (resid 223 through 274 )	C	G	223 - 274	219 - 270
22	22	chain 'C' and (resid 275 through 289 )	C	G	275 - 289	271 - 285
23	23	chain 'C' and (resid 290 through 313 )	C	G	290 - 313	286 - 309

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)