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Yorodumi- PDB-9s88: Amuc0121_S1_15 in complex with O6 sulfated Lewis A antigen (6'S-LeA) -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 9s88 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Amuc0121_S1_15 in complex with O6 sulfated Lewis A antigen (6'S-LeA) | ||||||
Components | Sulfatase | ||||||
Keywords | HYDROLASE / Carbohydrate sulfatase / mucin / Akkermansia muciniphila / Sulfation | ||||||
| Function / homology | Function and homology information | ||||||
| Biological species | Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 (bacteria) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.92 Å | ||||||
Authors | Dey, D. / Cartmell, A. | ||||||
| Funding support | United Kingdom, 1items
| ||||||
Citation | Journal: To Be PublishedTitle: The role of Akkermansia muciniphila sulfatases in colonic mucin utilisation Authors: Dey, D. / Salman, N.D. / Tomlinson, C.W.E. / Gugel, S. / Chunsheng, J. / Raba, G. / Nilsson, M. / McIver, Z. / Simpkin, A. / Davy, M. / Rigden, D.J. / Czjzek, M. / Byrne, D.P. / Case, A. / ...Authors: Dey, D. / Salman, N.D. / Tomlinson, C.W.E. / Gugel, S. / Chunsheng, J. / Raba, G. / Nilsson, M. / McIver, Z. / Simpkin, A. / Davy, M. / Rigden, D.J. / Czjzek, M. / Byrne, D.P. / Case, A. / Baumann, C. / Wright, G.S.A. / van der Post, S. / Martens, E.C. / Yates, E.A. / Davey, L. / Luis, A.S. / Cartmell, A. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 9s88.cif.gz | 496 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb9s88.ent.gz | 395.5 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 9s88.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/s8/9s88 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/s8/9s88 | HTTPS FTP |
|---|
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 9s7xC ![]() 9s85C ![]() 9s8aC ![]() 9s8fC ![]() 9s8xC ![]() 9s8yC ![]() 9sf6C C: citing same article ( |
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| Similar structure data | Similarity search - Function & homology F&H Search |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
United Kingdom, 1items
Citation






PDBj












