PDB-9qt3: Structure of vaccinia virus A26 (residues 1-397) in complex with ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9qt3

タイトル

Structure of vaccinia virus A26 (residues 1-397) in complex with Fab 8M2110

要素

Anti-Fab VHH
Envelop protein OPG153
Heavy chain of Fab 8M2110
Light chain of Fab 8M2110

キーワード

VIRAL PROTEIN / vaccinia virus mpox virus orthopoxvirus neutralizing antibody

機能・相同性

Orthopoxvirus A26L/A30L / Orthopoxvirus A26L/A30L protein / Chordopoxvirus fusion protein/multifunctional envelope protein A27 / Chordopoxvirus multifunctional envelope protein A27 / fusion of virus membrane with host plasma membrane / viral envelope / virion membrane / membrane / Envelop protein OPG153

機能・相同性情報

生物種

Vaccinia virus Western Reserve (ウイルス)

Homo sapiens (ヒト)

Lama glama (ラマ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Guardado-Calvo, P. / Battini, L.

資金援助

フランス, 1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Structure of vaccinia virus A26 (residues 1-397) in complex with Fab 8M2110
著者: Guardado-Calvo, P. / Battini, L.

履歴

登録	2025年4月7日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2025年11月19日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9qt3.cif.gz	1.6 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9qt3.ent.gz	1.1 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9qt3.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qt/9qt3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qt/9qt3	HTTPS FTP

-
関連構造データ

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Envelop protein OPG153

B: Heavy chain of Fab 8M2110

C: Light chain of Fab 8M2110

D: Anti-Fab VHH

E: Envelop protein OPG153

F: Heavy chain of Fab 8M2110

G: Light chain of Fab 8M2110

H: Anti-Fab VHH

I: Envelop protein OPG153

J: Heavy chain of Fab 8M2110

K: Light chain of Fab 8M2110

L: Anti-Fab VHH

M: Envelop protein OPG153

N: Heavy chain of Fab 8M2110

O: Light chain of Fab 8M2110

P: Anti-Fab VHH

453 kDa, 16 ポリマー
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1

A: Envelop protein OPG153

B: Heavy chain of Fab 8M2110

C: Light chain of Fab 8M2110

D: Anti-Fab VHH

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
113 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Envelop protein OPG153

F: Heavy chain of Fab 8M2110

G: Light chain of Fab 8M2110

H: Anti-Fab VHH

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113 kDa, 4 ポリマー
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3

I: Envelop protein OPG153

J: Heavy chain of Fab 8M2110

K: Light chain of Fab 8M2110

L: Anti-Fab VHH

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113 kDa, 4 ポリマー
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4

M: Envelop protein OPG153

N: Heavy chain of Fab 8M2110

O: Light chain of Fab 8M2110

P: Anti-Fab VHH

登録者が定義した集合体
113 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	119.405, 119.405, 632.812
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	154
Space group name H-M	P3₂21
Space group name Hall	P3₂2"
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -y,x-y,z+2/3 #3: -x+y,-x,z+1/3 #4: x-y,-y,-z+1/3 #5: -x,-x+y,-z+2/3 #6: y,x,-z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
d_1	1	ens_1	VAL	VAL	ASP	ASP	A	A	15 - 321	15 - 321
d_1	2	ens_1	HIS	HIS	ASN	ASN	A	A	327 - 364	327 - 364
d_2	1	ens_1	VAL	VAL	ASP	ASP	E	E	15 - 321	15 - 321
d_2	2	ens_1	HIS	HIS	ASN	ASN	E	E	327 - 364	327 - 364
d_3	1	ens_1	VAL	VAL	ASN	ASN	I	I	15 - 364	15 - 364
d_4	1	ens_1	VAL	VAL	ASP	ASP	M	M	15 - 321	15 - 321
d_4	2	ens_1	HIS	HIS	ASN	ASN	M	M	327 - 364	327 - 364
d_1	1	ens_2	GLN	GLN	PRO	PRO	B	B	20 - 244	1 - 225
d_2	1	ens_2	GLN	GLN	PRO	PRO	F	F	20 - 244	1 - 225
d_3	1	ens_2	GLN	GLN	PRO	PRO	J	J	20 - 244	1 - 225
d_4	1	ens_2	GLN	GLN	PRO	PRO	N	N	20 - 244	1 - 225
d_1	1	ens_3	ASP	ASP	GLU	GLU	C	C	20 - 232	1 - 213
d_2	1	ens_3	ASP	ASP	GLU	GLU	G	G	20 - 232	1 - 213
d_3	1	ens_3	ASP	ASP	GLU	GLU	K	K	20 - 232	1 - 213
d_4	1	ens_3	ASP	ASP	GLU	GLU	O	O	20 - 232	1 - 213
d_1	1	ens_4	VAL	VAL	SER	SER	D	D	2 - 113	4 - 123
d_2	1	ens_4	VAL	VAL	SER	SER	H	H	2 - 113	4 - 123
d_3	1	ens_4	VAL	VAL	SER	SER	L	L	2 - 113	4 - 123
d_4	1	ens_4	VAL	VAL	SER	SER	P	P	2 - 113	4 - 123

NCSアンサンブル:

ID
ens_1
ens_2
ens_3
ens_4

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.448781325537, -0.843904999911, 0.29397223164), (-0.842949798317, -0.508982401638, -0.174277228407), (0.296700116898, -0.169591467796, -0.939791346355)	-43.1930468098, -15.1146361485, 167.591086504
2	given	(0.465709168212, 0.83381102767, -0.296435727906), (-0.850399873637, 0.514348488456, 0.110750563617), (0.244816309838, 0.200511352692, 0.948609599297)	20.1517743476, -47.1152053713, -34.6050075571
3	given	(-0.548896896716, -0.78979037927, 0.273757837493), (-0.795303095841, 0.392630502491, -0.461881233933), (0.257303677629, -0.471245631626, -0.843636398072)	-61.304414438, 2.05707736699, 112.193255408
4	given	(0.464712945108, -0.839106791688, 0.282739581225), (-0.837839516519, -0.520007417685, -0.16618432571), (0.286473075886, -0.159662386603, -0.944691007207)	-41.3010484099, -15.5387835283, 167.34185032
5	given	(0.464381674079, 0.835458522165, -0.293868539525), (-0.837790911989, 0.521991592266, 0.160097362227), (0.287151612512, 0.171854110647, 0.942342886685)	19.582212145, -50.1313070952, -31.5517566154
6	given	(-0.475840739449, -0.824384830174, 0.306537505796), (-0.86071967338, 0.364769023629, -0.355112944368), (0.18093433764, -0.432820067903, -0.883136203699)	-58.9960932124, -11.8951762083, 110.524945328
7	given	(0.462165773727, -0.839425349218, 0.285950836133), (-0.837791352967, -0.519010230256, -0.169511149434), (0.290703365114, -0.161224886353, -0.943132063675)	-41.7296687745, -15.264301792, 167.56954819
8	given	(0.458762261074, 0.835753626504, -0.30175000182), (-0.836811575839, 0.52056796241, 0.169574122593), (0.298803571523, 0.174713686632, 0.938185244687)	19.9032066301, -50.8965275726, -30.3465298536
9	given	(-0.467314947469, -0.801045497515, 0.374089362029), (-0.873115994282, 0.351697281554, -0.337605513399), (0.13887116476, -0.484391508037, -0.863759032682)	-64.95157739, -13.6371831216, 106.120042125
10	given	(0.474069656648, -0.823312328861, 0.312113392522), (-0.831684579022, -0.535091283609, -0.1482500564), (0.289065255025, -0.189299042131, -0.938406708728)	-43.8811453664, -16.3278014007, 167.83520583
11	given	(0.455030987821, 0.841000465563, -0.292685867517), (-0.83476261928, 0.51729727305, 0.18861309803), (0.310029304382, 0.158498417082, 0.937422040602)	18.4817559738, -52.5345162662, -28.9270015573
12	given	(-0.39643192955, -0.814573473694, 0.423452218305), (-0.909833839588, 0.286967190302, -0.299753592189), (0.122654431528, -0.504103052603, -0.854889468167)	-63.5739557975, -18.5411022646, 103.711746066

#1: タンパク質	Envelop protein OPG153 分子量: 52359.859 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Vaccinia virus Western Reserve (ウイルス) 遺伝子: OPG153, VACWR149, A26L / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P24758
#2: 抗体	Heavy chain of Fab 8M2110 分子量: 23980.904 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株 (発現宿主): expi293 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体	Light chain of Fab 8M2110 分子量: 23449.838 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株 (発現宿主): expi293 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体	Anti-Fab VHH 分子量: 13390.644 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Lama glama (ラマ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 433 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.88 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.24 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SOLEIL / ビームライン: PROXIMA 1 / 波長: 0.978565 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2024年10月1日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.978565 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.9→39.08 Å / Num. obs: 223523 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 18 % / B_iso Wilson estimate: 41.97 Å² / CC_1/2: 0.987 / Net I/σ(I): 8.6
反射シェル	解像度: 2.9→2.95 Å / Num. unique obs: 5717 / CC_1/2: 0.638

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.21.2_5419	精密化
XDS		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.9→39.08 Å / SU ML: 0.3341 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0.02 / 位相誤差: 23.9404
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2357	11388	5.09 %
R_work	0.2005	212135	-
obs	0.2023	223523	99.98 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 42.92 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.9→39.08 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	28269	0	0	433	28702

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0019	28934
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.503	39234
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0423	4285
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0036	5022
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.1383	10430

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Asym-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.509134627187
ens_1	d_3	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.581095945621
ens_1	d_4	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.642931853179
ens_2	d_2	B	B	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.558179412726
ens_2	d_3	B	B	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.453034917634
ens_2	d_4	B	B	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.15847072494
ens_3	d_2	C	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.561390696955
ens_3	d_3	C	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.549566515338
ens_3	d_4	C	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.14497862726
ens_4	d_2	D	D	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.51243386912
ens_4	d_3	D	D	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.5482130829
ens_4	d_4	D	D	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.694441613929

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.9-2.93	0.3559	340	0.307	6995	X-RAY DIFFRACTION	99.92
2.93-2.97	0.315	452	0.2969	7048	X-RAY DIFFRACTION	99.99
2.97-3	0.3206	324	0.2874	7137	X-RAY DIFFRACTION	100
3-3.04	0.3372	328	0.305	7166	X-RAY DIFFRACTION	100
3.04-3.08	0.3358	370	0.2993	7040	X-RAY DIFFRACTION	99.99
3.08-3.12	0.3407	399	0.2859	7075	X-RAY DIFFRACTION	99.99
3.12-3.17	0.2896	304	0.2736	7103	X-RAY DIFFRACTION	99.99
3.17-3.22	0.3155	420	0.2668	7121	X-RAY DIFFRACTION	100
3.22-3.27	0.3084	422	0.2589	6941	X-RAY DIFFRACTION	99.99
3.27-3.32	0.2963	348	0.258	7209	X-RAY DIFFRACTION	100
3.32-3.38	0.3063	435	0.2589	6889	X-RAY DIFFRACTION	100
3.38-3.44	0.2889	392	0.2627	7133	X-RAY DIFFRACTION	100
3.44-3.5	0.2533	364	0.2329	7202	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5-3.58	0.2766	364	0.2213	6959	X-RAY DIFFRACTION	100
3.58-3.65	0.261	350	0.2077	7079	X-RAY DIFFRACTION	99.97
3.65-3.74	0.2487	350	0.1966	7154	X-RAY DIFFRACTION	100
3.74-3.83	0.2321	376	0.1951	7062	X-RAY DIFFRACTION	100
3.83-3.93	0.2236	408	0.1849	6988	X-RAY DIFFRACTION	100
3.94-4.05	0.2137	386	0.1756	7132	X-RAY DIFFRACTION	100
4.05-4.18	0.1918	363	0.1617	7070	X-RAY DIFFRACTION	100
4.18-4.33	0.1871	408	0.1489	7029	X-RAY DIFFRACTION	100
4.33-4.5	0.1835	428	0.1412	7043	X-RAY DIFFRACTION	100
4.5-4.71	0.1674	383	0.1407	7072	X-RAY DIFFRACTION	100
4.71-4.96	0.1694	396	0.1345	7103	X-RAY DIFFRACTION	100
4.96-5.27	0.1678	304	0.1495	7101	X-RAY DIFFRACTION	100
5.27-5.67	0.1933	390	0.1665	7099	X-RAY DIFFRACTION	99.99
5.67-6.24	0.2196	396	0.1874	7045	X-RAY DIFFRACTION	99.99
6.24-7.14	0.2188	383	0.1981	7062	X-RAY DIFFRACTION	99.96
7.14-8.98	0.1914	450	0.1718	7027	X-RAY DIFFRACTION	100
8.98-39.08	0.208	355	0.1722	7051	X-RAY DIFFRACTION	99.5

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.507987914356	-0.134523588682	-0.0726559303461	1.27140959749	0.0298327428275	1.0068810384	0.0152910592324	0.0639755490101	-0.0738658204594	-0.0528440134538	-0.0267809533621	0.0637770407628	0.107259453462	-0.0694759663966	0.049861783097	0.320681788576	-0.0475495786881	-0.0059599269537	0.255784865161	-0.0566340541609	0.267607043138	-53.9904767445	-17.9444728674	61.1179211837
2	0.638508862534	-0.175865809471	-0.178036799892	0.502339263517	0.285926097369	0.417650236394	-0.0536684643935	0.177968780208	0.0600266566797	-0.172564594123	-0.0568812269465	0.154368743149	-0.0233780037277	-0.240208895863	0.0365646301401	0.278408314271	-0.00737926732804	-0.0585316683826	0.359047024244	-0.0736961416285	0.32893752698	-85.3227303354	2.92477333112	87.8679783942
3	0.725218148089	-0.24523528359	0.0622358968893	0.973462331427	0.0237977659201	0.46324885193	-0.0423490397609	-0.00563490202376	0.092125585794	0.00504137611396	0.00504014772545	0.238392929588	-0.0864147556653	-0.195652928189	0.000546147863114	0.243913653673	0.0475323517376	-0.00774703868704	0.257143017017	-0.0576223824753	0.312629130428	-77.5334864391	17.4629941804	96.7638441704
4	1.68002292355	-0.0166461786832	0.0139522361993	1.52348524303	0.581731538073	0.898992250758	-0.0447945319481	-0.159104052834	0.128435236586	0.158529931788	0.0995883236247	-0.00262313757939	-0.216142985446	0.063302685772	-0.00613280611344	0.449653294189	0.119018372677	-0.0688987842797	0.315702478789	-0.0733225051388	0.412610554387	-67.7088687701	42.543693489	106.035262792
5	0.971371984082	0.189350342365	0.101308117881	0.770681113923	0.0638411084566	0.922391029966	-0.0166693866764	-0.0428344962242	0.0577347312823	-0.0127812369872	0.0444481547155	-0.0728246129321	-0.1484873281	0.0635670452828	-0.0042499638821	0.306538871154	-0.024260699038	0.027722622775	0.190293828112	-0.0657461186508	0.261490396886	-34.3131548045	28.8793265566	97.1772704159
6	0.206450580124	-0.0521400353217	0.276379248822	0.340203887118	0.072842538196	0.769921429774	-0.0503090239889	0.0807901885411	0.0749514009904	0.11734529899	-0.0465689405719	0.143253848038	-0.160481960113	-0.0767798344066	-0.0157779760868	0.402405589004	0.0255046404257	0.00796050814875	0.283531867169	-0.0097953256534	0.357382114299	-58.5627411416	39.8249548476	59.4257506366
7	1.24041203474	-0.0522341431529	0.46292762105	0.487678176051	0.21938229191	0.499687892354	-0.0381684697106	0.0965786778746	0.199788139616	0.000465907100559	-0.0702911812629	0.159653023033	-0.080572768453	-0.135764530163	-0.00450980343508	0.271008933737	0.0100368018796	-0.0044062120632	0.286096725872	-0.0108432575644	0.31770485118	-64.5519156952	24.2264530234	50.9519804322
8	1.18954595045	-0.356471707099	0.502812185507	1.70163171383	0.178985457805	0.539047533862	0.0698777820047	0.319729146973	-0.326668240115	-0.139413543167	-0.165891012838	0.373639337136	0.119615070583	-0.0712471737465	0.0280498159765	0.348050996916	0.0133213679322	-0.039420558339	0.528195201903	-0.193598605265	0.539282303953	-77.9119850479	1.50315204578	40.7057119974
9	1.5701720603	0.0116314647396	-0.0603199221775	0.970833799755	-0.0180271381324	1.69965531706	-0.0124755582954	0.344203347379	-0.40046151836	-0.115056823792	0.0314525732089	0.121878716991	0.340158116559	-0.308353168105	0.027934210391	0.44019227775	-0.153240633604	-0.00244940043539	0.48715679783	-0.121469604502	0.382909178188	-38.0299484082	-3.66165422235	6.5077169298
10	0.844917868963	-0.0160319225636	0.0100968457703	0.530063137973	0.0830588869239	0.522409050335	-0.0927098131383	0.35057923293	0.145947087239	-0.163035660965	0.00683577437342	-0.0505710466634	-0.12840686793	-0.063915122433	-0.0202971755018	0.359789255825	-0.0231771244141	-0.0181394197975	0.425801833474	0.0868520972532	0.309685337219	-43.418383567	36.9455279348	27.2509490074
11	0.731503822067	0.0888723622984	-0.0107233109512	0.378321573144	0.135204645779	0.493812613316	-0.0664322687873	0.116000636432	0.292605629383	-0.0430220176234	0.0475158839247	0.0286336244836	-0.147688492713	-0.0136938969543	-0.0209419609657	0.374798048148	-0.0334102764215	-0.0224472393567	0.284744323197	0.0374660393476	0.388276667592	-30.2681853455	39.4831916116	40.3186802093
12	1.45290469686	0.0759753648951	0.487835422886	1.46857132468	-0.12944152051	1.17742589279	0.0271165821116	-0.0933042079368	0.172860691886	0.0901675793097	0.0737160794797	0.0980172021388	0.0051049479031	0.0277303464853	-0.0231142442751	0.412385604522	-0.0582869033697	0.0349980959526	0.249085766815	-0.0754279640887	0.344418241949	-7.58548236259	45.9926744773	56.2209330442
13	0.98627014573	-0.154093444006	-0.119545045092	1.05024148489	0.0516001309615	0.911626617444	-0.0308297088473	-0.0347594615163	-0.0708313227616	0.153896087564	0.0131175188324	-0.144966479268	0.00789840589186	0.116475330803	0.0270614967094	0.27384754428	-0.0111222622641	-0.0052401099077	0.219703778025	-0.0234029818454	0.2160643766	-0.572121471988	9.70262909223	55.0096925357
14	0.55687571139	0.273076969256	-0.0174724082929	0.282395841855	-0.288493367285	1.04918847418	0.00107096064752	-0.049616814671	0.0863225018895	0.0303799598797	-0.0350056953119	-0.0490760019986	-0.277229095626	0.0497080502175	0.0235901114773	0.386827799855	0.00112475677728	0.0767973686159	0.323478397046	-0.0479864822947	0.311662167902	6.12692265067	31.4053803446	16.221750266
15	0.529228607144	0.0193056677412	0.214585295776	0.194380682903	-0.0737284480643	1.2243910426	-0.0415760618964	0.113678005493	0.20792830091	-0.11110686394	0.0420214111869	0.0546479514921	-0.186362585511	-0.0366515789804	0.00650700522544	0.382177673	-0.00895283880698	0.0285566156094	0.370380019676	0.0134116970655	0.334948385948	-6.51250452456	27.5319751469	3.31555310322
16	1.43996674533	0.606130214827	0.50261458956	1.02439706923	0.251586434386	1.62546131793	-0.00725254464882	0.427684009725	0.40263694021	-0.0662299076914	0.070908003882	-0.108730707533	0.0959509829402	-0.393081333276	-0.00346263432333	0.520824241079	0.00839485841627	-0.0236053073071	0.668295593615	0.122261733688	0.422674892894	-26.4837927628	23.4885008551	-16.6866628455

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	(chain 'A' and resid 15 through 364)	A	A	15 - 364	1 - 346
2	2	(chain 'B' and resid 20 through 244)	B	B	20 - 244	1 - 219
3	3	(chain 'C' and resid 20 through 232)	C	C	20 - 232	1 - 213
4	4	(chain 'D' and resid 2 through 113)	D	D	2 - 113	1 - 120
5	5	(chain 'E' and resid 15 through 364)	E	E	15 - 364	1 - 346
6	6	(chain 'F' and resid 20 through 244)	F	F	20 - 244	1 - 219
7	7	(chain 'G' and resid 20 through 232)	G	G	20 - 232	1 - 213
8	8	(chain 'H' and resid 2 through 113)	H	H	2 - 113	1 - 120
9	9	(chain 'I' and resid 15 through 364)	I	I	15 - 364	1 - 345
10	10	(chain 'J' and resid 20 through 244)	J	J	20 - 244	1 - 219
11	11	(chain 'K' and resid 20 through 232)	K	K	20 - 232	1 - 213
12	12	(chain 'L' and resid 2 through 113)	L	L	2 - 113	1 - 120
13	13	(chain 'M' and resid 15 through 364)	M	M	15 - 364	1 - 350
14	14	(chain 'N' and resid 20 through 244)	N	N	20 - 244	1 - 219
15	15	(chain 'O' and resid 20 through 232)	O	O	20 - 232	1 - 213
16	16	(chain 'P' and resid 2 through 113)	P	P	2 - 113	1 - 120

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)