PDB-9klb: G9a in complex with RK-133232 (compound 16g)

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9klb

タイトル

G9a in complex with RK-133232 (compound 16g)

要素

Histone-lysine N-methyltransferase EHMT2

キーワード

TRANSFERASE / histone lysine methyltransferase / inhibitor / protein-inhibitor complex

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of protein modification process / phenotypic switching / neuron fate specification / [histone H3]-lysine9 N-methyltransferase / peptidyl-lysine dimethylation / histone H3K9 methyltransferase activity / histone H3K9me2 methyltransferase activity / histone H3K27 methyltransferase activity / synaptonemal complex assembly / negative regulation of autophagosome assembly ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.81 Å

データ登録者

Niwa, H. / Shirai, F. / Sato, S. / Nishigaya, Y. / Ihara, K. / Shirouzu, M. / Umehara, T.

資金援助

日本, 1件

引用

ジャーナル: Eur.J.Med.Chem. / 年: 2025
タイトル: Discovery of potent substrate-type lysine methyltransferase G9a inhibitors for the treatment of sickle cell disease.
著者: Nishigaya, Y. / Takase, S. / Sumiya, T. / Kikuzato, K. / Hiroyama, T. / Maemoto, Y. / Aoki, K. / Sato, T. / Niwa, H. / Sato, S. / Ihara, K. / Nakata, A. / Matsuoka, S. / Hashimoto, N. / ...

履歴

登録	2024年11月14日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2025年5月21日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年6月4日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.year

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9klb.cif.gz	240.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9klb.ent.gz		表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9klb.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kl/9klb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kl/9klb	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	9klcC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#226 - 2018年10月アミノグリコシド系抗生物質と耐性 (Aminoglycoside Antibiotics and Resistance) 類似性 (1) #177 - 2014年9月アポトソーム (Apoptosomes) 類似性 (1) #67 - 2005年7月 TATA結合タンパク質 (TATA-Binding Protein) 類似性 (1) #31 - 2002年7月 p53腫瘍抑制因子 (p53 Tumor Suppressor) 類似性 (1) #250 - 2020年10月カプサイシン受容体TRPV1 (Capsaicin Receptor TRPV1) 類似性 (1) #112 - 2009年4月 Oct・Sox転写因子 (Oct and Sox Transcription Factors) 類似性 (1) #172 - 2014年4月 RecAとRad51 (RecA and Rad51) 類似性 (1) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (1) #213 - 2017年9月サーチュイン (Sirtuins) 類似性 (1) #221 - 2018年5月ヒトパピローマウイルスとワクチン (Human Papillomavirus and Vaccines) 類似性 (1) #234 - 2019年6月 MDM2とがん (MDM2 and Cancer) 類似性 (1) #236 - 2019年8月サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase) 類似性 (1) #98 - 2008年2月低分子干渉RNA (Small Interfering RNA) 類似性 (1) #223 - 2018年7月ピエゾ1機械受容チャネル (Piezo1 Mechanosensitive Channel) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#226 - 2018年10月
アミノグリコシド系抗生物質と耐性 (Aminoglycoside Antibiotics and Resistance)
類似性 (1)
#177 - 2014年9月
アポトソーム (Apoptosomes)
類似性 (1)
#67 - 2005年7月
TATA結合タンパク質 (TATA-Binding Protein)
類似性 (1)
#31 - 2002年7月
p53腫瘍抑制因子 (p53 Tumor Suppressor)
類似性 (1)
#250 - 2020年10月
カプサイシン受容体TRPV1 (Capsaicin Receptor TRPV1)
類似性 (1)
#112 - 2009年4月
Oct・Sox転写因子 (Oct and Sox Transcription Factors)
類似性 (1)
#172 - 2014年4月
RecAとRad51 (RecA and Rad51)
類似性 (1)
#122 - 2010年2月
エンハンセオソーム (Enhanceosome)
類似性 (1)
#213 - 2017年9月
サーチュイン (Sirtuins)
類似性 (1)
#221 - 2018年5月
ヒトパピローマウイルスとワクチン (Human Papillomavirus and Vaccines)
類似性 (1)
#234 - 2019年6月
MDM2とがん (MDM2 and Cancer)
類似性 (1)
#236 - 2019年8月
サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase)
類似性 (1)
#98 - 2008年2月
低分子干渉RNA (Small Interfering RNA)
類似性 (1)
#223 - 2018年7月
ピエゾ1機械受容チャネル (Piezo1 Mechanosensitive Channel)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Histone-lysine N-methyltransferase EHMT2

B: Histone-lysine N-methyltransferase EHMT2

ヘテロ分子

67.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	56.703, 78.341, 70.754
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 91.71, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Histone-lysine N-methyltransferase EHMT2 / Euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 2 / HLA-B-associated transcript 8 / Histone H3-K9 ...Euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 2 / HLA-B-associated transcript 8 / Histone H3-K9 methyltransferase 3 / H3-K9-HMTase 3 / Lysine N-methyltransferase 1C / Protein G9a 分子量: 32604.924 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: Q96KQ7, 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの
#2: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#3: 化合物	ChemComp-SFG / SINEFUNGIN / ADENOSYL-ORNITHINE / シネフンギン分子量: 381.387 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₅H₂₃N₇O₅
#4: 化合物	ChemComp-A1L57 / ~{N}-[(~{E},2~{S})-4-cyclopropyl-1-[(6-ethoxypyridin-3-yl)amino]-1-oxidanylidene-but-3-en-2-yl]-4-(pyridin-4-ylamino)benzamide 分子量: 457.524 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₆H₂₇N₅O₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 233 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.41 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.94 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.1M Bis-Tris propane (pH~7.5), 0.2M Sodium Formate or Fluoride, 10% Ethylene Glycol, ~25% PEG3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / ビームライン: BL-17A / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年6月16日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.81→45.92 Å / Num. obs: 56455 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7 % / CC_1/2: 0.983 / R_merge(I) obs: 0.118 / R_pim(I) all: 0.048 / R_rim(I) all: 0.128 / Χ²: 1.05 / Net I/σ(I): 9.3
反射シェル	解像度: 1.81→1.85 Å / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7.1 % / R_merge(I) obs: 1.907 / Num. measured all: 23708 / Num. unique obs: 3330 / CC_1/2: 0.799 / R_pim(I) all: 0.769 / R_rim(I) all: 2.058 / Χ²: 1.06 / Net I/σ(I) obs: 1.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.20.1_4487: ???)	精密化
Aimless		データスケーリング
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.81→44.89 Å / SU ML: 0.25 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0.01 / 位相誤差: 25.48 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2209	5594	5.05 %
R_work	0.1828	-	-
obs	0.1847	56355	99.74 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.81→44.89 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4241	0	130	233	4604

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.832
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.039	1658
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.053	646
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	793

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.81-1.83	0.3804	199	0.3339	3497	X-RAY DIFFRACTION	100
1.83-1.85	0.3908	208	0.3236	3436	X-RAY DIFFRACTION	99
1.85-1.87	0.334	182	0.3235	3512	X-RAY DIFFRACTION	100
1.87-1.9	0.3018	180	0.2827	3540	X-RAY DIFFRACTION	99
1.9-1.92	0.3771	190	0.2785	3413	X-RAY DIFFRACTION	99
1.92-1.95	0.2738	191	0.2711	3543	X-RAY DIFFRACTION	100
1.95-1.98	0.3394	190	0.2577	3482	X-RAY DIFFRACTION	100
1.98-2.01	0.2298	135	0.2339	3530	X-RAY DIFFRACTION	100
2.01-2.04	0.2539	199	0.2307	3475	X-RAY DIFFRACTION	100
2.04-2.07	0.2724	196	0.2185	3516	X-RAY DIFFRACTION	100
2.07-2.11	0.2988	197	0.2048	3489	X-RAY DIFFRACTION	100
2.11-2.15	0.2499	164	0.2183	3520	X-RAY DIFFRACTION	100
2.15-2.19	0.2402	189	0.2108	3532	X-RAY DIFFRACTION	100
2.19-2.23	0.2608	188	0.204	3416	X-RAY DIFFRACTION	100
2.23-2.28	0.2728	177	0.2074	3577	X-RAY DIFFRACTION	100
2.28-2.33	0.202	185	0.1866	3491	X-RAY DIFFRACTION	100
2.33-2.39	0.2224	204	0.1816	3474	X-RAY DIFFRACTION	100
2.39-2.46	0.2266	188	0.1873	3537	X-RAY DIFFRACTION	100
2.46-2.53	0.2519	215	0.1939	3501	X-RAY DIFFRACTION	100
2.53-2.61	0.2131	188	0.1846	3523	X-RAY DIFFRACTION	100
2.61-2.7	0.2445	202	0.1847	3513	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7-2.81	0.2141	160	0.1855	3469	X-RAY DIFFRACTION	100
2.81-2.94	0.2536	156	0.1849	3578	X-RAY DIFFRACTION	100
2.94-3.09	0.2239	154	0.1885	3527	X-RAY DIFFRACTION	100
3.09-3.29	0.1963	188	0.1718	3501	X-RAY DIFFRACTION	100
3.29-3.54	0.1935	209	0.1647	3536	X-RAY DIFFRACTION	100
3.54-3.9	0.2106	204	0.1466	3438	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9-4.46	0.1799	195	0.1327	3498	X-RAY DIFFRACTION	100
4.46-5.62	0.1702	169	0.1445	3536	X-RAY DIFFRACTION	100
5.62-44.89	0.1729	192	0.1688	3480	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.2945	-0.7917	-0.4801	2.8305	0.4541	1.9138	-0.1186	-0.1834	-0.0719	0.1058	0.12	-0.4638	0.0709	0.247	-0.0467	0.2427	-0.046	0.0101	0.1938	-0.069	0.3967	11.3058	-3.1503	34.8479
2	1.7109	-1.195	-0.9665	1.3228	0.0624	2.0909	-0.0425	0.6979	0.259	-0.0773	0.0569	0.0643	-0.0567	-0.5299	0.0036	0.2799	-0.0029	0.0299	0.37	0.0494	0.2392	-16.4641	12.3088	35.0594
3	1.0665	-0.5342	-0.1609	1.4811	0.619	0.9212	0.054	0.611	-0.0807	-0.2505	-0.1096	0.0417	0.0216	-0.3985	0.0385	0.2841	-0.0518	0.0114	0.401	-0.0282	0.1969	-9.1453	0.8213	25.14
4	2.0059	-0.6524	-0.2364	0.5523	0.6194	1.3231	0.0758	0.3447	0.5922	-0.3756	0.1464	-0.6249	-0.516	-0.1736	-0.1104	0.3457	-0.0039	0.0988	0.2415	0.0528	0.4165	3.4896	16.3014	28.467
5	3.4507	-0.9264	-0.64	2.3078	0.1806	1.7841	0.0495	0.5993	0.0812	-0.3538	0.0035	-0.3028	-0.026	-0.158	-0.0945	0.2417	-0.0447	0.0396	0.2354	0.0144	0.196	-0.0421	6.8432	24.6091
6	0.3445	0.0175	0.7516	0.7586	0.4002	2.111	0.1336	1.5208	0.3867	-0.4931	-0.1011	-0.1488	-0.0278	-0.1011	-0.1564	0.5198	-0.0203	0.2839	0.725	0.0812	0.56	12.3079	9.8456	10.4667
7	1.154	-0.4756	0.3263	1.7262	1.0357	2.2277	-0.1896	0.5823	-0.6084	-0.3075	0.1661	0.2519	0.1912	-0.5886	0.0304	0.2392	-0.0499	-0.0155	0.366	-0.0448	0.3357	-27.3013	-5.5617	48.6276
8	4.4666	0.7034	-1.1037	4.0804	-1.4375	2.9895	-0.1166	0.8203	0.3943	-0.1551	0.3422	0.3792	-0.1274	-0.4651	-0.2461	0.191	0.0051	-0.0202	0.2727	0.0309	0.2329	-28.1156	4.773	49.8558
9	5.2843	-1.7464	0.3098	3.4817	-1.3556	2.2251	-0.1203	-0.223	0.3611	0.1827	0.129	-0.2842	-0.2813	0.1447	-0.0135	0.2582	-0.0564	0.0036	0.191	-0.023	0.2349	3.0656	10.0473	50.6656
10	4.0622	-0.0751	-0.8972	3.7024	-0.6496	2.9271	-0.1368	-0.924	-0.3966	0.5875	0.1683	-0.0666	0.0558	-0.1001	0.0176	0.2452	0.0274	-0.0256	0.4132	0.0676	0.2388	0.9139	1.5873	59.5233
11	4.2636	0.8879	-0.5837	0.9343	-0.1457	1.3738	-0.0337	-0.133	-0.5763	0.0216	-0.0083	-0.045	0.119	-0.033	0.0459	0.1961	0.0015	0.0072	0.1807	0.0412	0.257	-18.081	-3.0133	57.3649
12	3.2279	0.7643	-0.9604	1.5464	0.0237	2.9701	0.1957	-0.2043	0.7471	0.2312	0.0702	0.2017	-0.5812	-0.1437	-0.1721	0.2811	0.0265	0.036	0.2079	0.0143	0.3272	-21.5735	13.5404	58.2906
13	4.0988	0.4663	-0.9651	1.8357	-0.4431	2.3873	0.0888	-0.5868	-0.136	0.2351	-0.0366	-0.0414	-0.0314	-0.0417	-0.0493	0.1829	0.0052	-0.0188	0.2033	0.0217	0.1535	-12.756	4.1155	61.2692
14	0.8428	-0.3662	1.1892	2.8166	-1.7285	2.2412	-0.0302	-0.6546	0.3063	0.6266	0.4792	0.7718	-0.5022	-0.6465	-0.2207	0.3508	0.0614	0.1439	0.5189	-0.0273	0.3718	-28.3006	10.1425	71.7747
15	0.7502	-0.5585	-0.061	0.8532	-0.4834	0.6407	-0.3636	-0.9556	0.6898	0.6203	0.3386	0.3661	-0.2656	-0.0988	-0.7878	0.4561	0.0407	0.1857	0.8289	-0.0818	0.4933	-30.5381	11.8205	83.5218

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 918 through 954 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 955 through 985 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 986 through 1062 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 1063 through 1096 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 1097 through 1155 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 1156 through 1184 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 917 through 938 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 939 through 958 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 959 through 985 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 986 through 1027 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 1028 through 1069 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 1070 through 1118 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 1119 through 1155 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 1156 through 1175 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 1176 through 1191 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)