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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 9iq8 | ||||||
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タイトル | Ankyrin-like protein, AnkB | ||||||
![]() | Ankyrin-like protein AnkB | ||||||
![]() | SIGNALING PROTEIN / AnkB / Ankyrin repeat domain-containing protein / Signal transduction mechanisms | ||||||
機能・相同性 | : / Ankyrin repeats (3 copies) / Ankyrin repeat profile. / Ankyrin repeat region circular profile. / ankyrin repeats / Ankyrin repeat / Ankyrin repeat-containing domain superfamily / Ankyrin repeat domain-containing protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sung, J.H. / Park, H.H. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural analysis of a bacterial ankyrin-like protein secreted by Acinetobacter baumannii. 著者: Sung, J.H. / Lee, S.Y. / Lee, C.S. / Lee, J.H. / Park, H.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 113.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 87.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 453.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 461.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 25.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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4 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17588.111 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: CBE85_13960 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.81 % |
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結晶化 | 温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 0.1M Bis-Tris pH 6.7, 0.005M Hexammine cobalt chloride, 31% (w/v) PEG 5000 MME |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 125 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年9月25日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.42→28.425 Å / Num. obs: 21670 / % possible obs: 99.77 % / 冗長度: 6.9 % / CC1/2: 0.986 / Net I/σ(I): 5.42 |
反射 シェル | 解像度: 2.42→2.507 Å / Num. unique obs: 2158 / CC1/2: 0.796 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.42→28.425 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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