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Yorodumi- PDB-9h0q: N terminal domain of BC2L-C lectin in complex with N-(beta-L-Fuco... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 9h0q | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | N terminal domain of BC2L-C lectin in complex with N-(beta-L-Fucopyranosyl)-biphenyl-3-carboxamide | ||||||
Components | Lectin | ||||||
Keywords | SUGAR BINDING PROTEIN / Lectin / beta-fucosylamide / Burkholderia / anti-adhesive | ||||||
| Function / homology | Lectin Bc2l-C, N-terminal / : / Bc2l-C, N-terminal domain / Calcium-mediated lectin / Calcium-mediated lectin superfamily / Fucose-binding lectin II (PA-IIL) / identical protein binding / N-(beta-L-Fucopyranosyl)-biphenyl-3-carboxamide / Lectin Function and homology information | ||||||
| Biological species | Burkholderia cenocepacia J2315 (bacteria) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.55 Å | ||||||
Authors | Antonini, G. / Varrot, A. | ||||||
| Funding support | European Union, 1items
| ||||||
Citation | Journal: J.Med.Chem. / Year: 2025Title: Toward Dual-Target Glycomimetics against Two Bacterial Lectins to Fight Pseudomonas aeruginosa - Burkholderia cenocepacia Infections: A Biophysical Study. Authors: Antonini, G. / Fares, M. / Hauck, D. / Mala, P. / Gillon, E. / Belvisi, L. / Bernardi, A. / Titz, A. / Varrot, A. / Mazzotta, S. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 9h0q.cif.gz | 640.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb9h0q.ent.gz | 413.6 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 9h0q.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 9h0q_validation.pdf.gz | 3.3 MB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 9h0q_full_validation.pdf.gz | 3.4 MB | Display | |
| Data in XML | 9h0q_validation.xml.gz | 60 KB | Display | |
| Data in CIF | 9h0q_validation.cif.gz | 76.3 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h0/9h0q ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h0/9h0q | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 9g3kC ![]() 9g3lC C: citing same article ( |
|---|---|
| Similar structure data | Similarity search - Function & homology F&H Search |
| Experimental dataset #1 | Data reference: 10.5281/zenodo.13912326 / Data set type: diffraction image dataDetails: 9H0Q N terminal domain of BC2L-C lectin in complex with N-(beta-L-Fucopyranosyl)-biphenyl-3-carboxamide Metadata reference: 10.5281/zenodo.13912326 |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Components on special symmetry positions |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Burkholderia cenocepacia J2315 (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
Citation

PDBj




