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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 9ceq | ||||||
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タイトル | Lanthanide Binding Tag complex LBT3-NH2:La3+ | ||||||
要素 | Lanthanide Binding Tag Peptide | ||||||
キーワード | DE NOVO PROTEIN / Rare earth complex / calmodulin derivative | ||||||
機能・相同性 | LANTHANUM (III) ION 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Kt, S. / Messinger, R.J. / Favaro, D.C. | ||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Role of Water in the Selective Complexation of Rare Earth Elements by Lanthanide Binding Tag Peptides 著者: Kt, S. / Favaro, D.C. / Messinger, R.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 9ceq.cif.gz | 94.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb9ceq.ent.gz | 65.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 9ceq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 9ceq_validation.pdf.gz | 522.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 9ceq_full_validation.pdf.gz | 669.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 9ceq_validation.xml.gz | 16.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 9ceq_validation.cif.gz | 22.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ce/9ceq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ce/9ceq | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1920.020 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) |
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#2: 化合物 | ChemComp-LA / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 300 uM LBT3, 600 uM LANTHANUM (III) ION, 50 mM D13 MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O 詳細: 300uM LBT3 with 600uM La3+ cations in 50mM MES-D13 buffer, 100mM NaCl, pH 6 Label: LBT3:La sample / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 mM / Label: conditions_1 / pH: 6 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III HD / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III HD / 磁場強度: 800 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 5 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |