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- PDB-9ce2: Respiratory supercomplex I+III2+IV open state -

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登録情報
データベース: PDB / ID: 9ce2
タイトルRespiratory supercomplex I+III2+IV open state
要素
  • (Cytochrome b-c1 complex subunit ...) x 6
  • (Cytochrome c oxidase subunit ...) x 12
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit ...) x 11
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit ...) x 10
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit ...) x 2
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein ...) x 3
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein ...) x 7
  • (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain ...) x 7
  • (NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit ...) x 2
  • (Ubiquinol-cytochrome c ...) x 2
  • Acyl carrier protein
  • Cytochrome b
  • Cytochrome c oxidase subunit
  • Cytochrome c1
  • NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
キーワードELECTRON TRANSPORT / electron transporter / heart / respiratory supercomplex
機能・相同性
機能・相同性情報


Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / : / respiratory chain complex IV assembly ...Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / : / respiratory chain complex IV assembly / RHOG GTPase cycle / mitochondrial respirasome assembly / pyramidal neuron development / Complex I biogenesis / thalamus development / mitochondrial respiratory chain complex III assembly / Respiratory electron transport / Neutrophil degranulation / Mitochondrial protein degradation / respiratory chain complex IV / respiratory chain complex / cytochrome-c oxidase / respiratory chain complex III / oxidative phosphorylation / cardiac muscle tissue development / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / quinol-cytochrome-c reductase activity / cytochrome-c oxidase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / hypothalamus development / midbrain development / ubiquinone binding / electron transport coupled proton transport / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / enzyme regulator activity / reactive oxygen species metabolic process / aerobic respiration / central nervous system development / hippocampus development / respiratory electron transport chain / electron transport chain / mitochondrial intermembrane space / metalloendopeptidase activity / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / fatty acid biosynthetic process / FMN binding / nervous system development / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / nuclear body / mitochondrial matrix / copper ion binding / heme binding / mitochondrion / proteolysis / nucleoplasm / metal ion binding / membrane
類似検索 - 分子機能
Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Cytochrome c oxidase, subunit 8 / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit 8 superfamily / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs superfamily / : / Cytochrome oxidase c subunit VIII / Cytochrome c oxidase subunit VIc ...Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Cytochrome c oxidase, subunit 8 / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit 8 superfamily / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs superfamily / : / Cytochrome oxidase c subunit VIII / Cytochrome c oxidase subunit VIc / Cytochrome c oxidase subunit VIIa, metazoa / Cytochrome C oxidase, subunit VIIB / Cytochrome c oxidase subunit IV / Cytochrome C oxidase, subunit VIIB domain superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIIa superfamily / Cytochrome C oxidase chain VIIB / Cytochrome c oxidase, subunit VIa, conserved site / Cytochrome c oxidase subunit VIa signature. / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8kDa, N-terminal / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8 kDa, N-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit VIa / Cytochrome c oxidase, subunit VIa superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIa / Cytochrome c oxidase, subunit VIb / : / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature. / Cytochrome c oxidase subunit VIIc / Cytochrome c oxidase subunit IV family / Cytochrome c oxidase, subunit VIb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIIc superfamily / Cytochrome c oxidase subunit IV superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIIc / Cytochrome c oxidase subunit IV / Cytochrome c oxidase subunit 2, C-terminal / Cytochrome oxidase c subunit VIb / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily / Cytochrome c oxidase subunit Va / Cytochrome c oxidase subunit VII / Cytochrome c oxidase subunit VII / Globular protein, non-globular alpha/beta subunit / Cytochrome c oxidase, subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit III domain / Cytochrome c oxidase subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. / Cytochrome c oxidase, subunit II / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit I domain / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / UcrQ family / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain / Cytochrome oxidase subunit II transmembrane region profile. / Cytochrome bc1 complex subunit Rieske, transmembrane domain superfamily / Cytochrome c oxidase subunit III / Cytochrome c oxidase subunit III-like / Cytochrome c oxidase, subunit III, 4-helical bundle / Cytochrome c oxidase subunit III / Heme-copper oxidase subunit III family profile. / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex 14kD subunit / Cytochrome c oxidase subunit III-like superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase, UQCRX/QCR9 like / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome c/quinol oxidase subunit II / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / : / Cytochrome b / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain superfamily / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / Copper centre Cu(A) / CO II and nitrous oxide reductase dinuclear copper centers signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / : / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature. / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / : / Cytochrome oxidase subunit I profile. / Cytochrome b/b6, C-terminal / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / Cytochrome b/b6 C-terminal region profile. / Peptidase M16, zinc-binding site / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / Insulinase family, zinc-binding region signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / HEME-A / HEME C / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Chem-NDP / IRON/SULFUR CLUSTER / Chem-ZMP / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 ...FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / HEME-A / HEME C / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Chem-NDP / IRON/SULFUR CLUSTER / Chem-ZMP / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / Cytochrome c1 / Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / Cytochrome c oxidase subunit 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 6C / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / Cytochrome c oxidase subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / Complex III subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 6 / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / Cytochrome c oxidase subunit 8 / Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 / Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / Cytochrome c oxidase subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / Cytochrome c oxidase subunit 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / Cytochrome b / Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 3 / Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
類似検索 - 構成要素
生物種Sus scrofa (ブタ)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.41 Å
データ登録者Zhang, Z. / Maharjan, R. / Tringides, M.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) 米国
引用ジャーナル: To Be Published
タイトル: Respiratory supercomplex I+III2+IV open state
著者: Zhang, Z. / Maharjan, R. / Tringides, M.
履歴
登録2024年6月25日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02025年7月9日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年7月9日Data content type: EM metadata / Data content type: EM metadata / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年7月9日Data content type: Image / Data content type: Image / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年7月9日Data content type: Primary map / Data content type: Primary map / Provider: repository / タイプ: Initial release

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
0: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
1: Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein
2: Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
3: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
4: Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
6: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
7: Cytochrome b
8: Cytochrome c1
9: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
A: Cytochrome c oxidase subunit 6C
a: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
b: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
c: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
d: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
e: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
f: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
g: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
h: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
i: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
j: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
k: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
m: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
n: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
o: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
p: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
q: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
r: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
B: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
C: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
D: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
E: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
F: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
H: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
I: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
J: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
K: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
N: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isoform X1
O: Acyl carrier protein
P: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
Q: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
R: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
S: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
T: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
U: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
V: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
W: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13
X: Acyl carrier protein
Y: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2
Z: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
l: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
s: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
t: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
u: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
v: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
w: Cytochrome b
x: Cytochrome c1
y: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
z: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
Aa: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
Ab: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
Ac: Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein
Ad: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
Ag: Cytochrome c oxidase subunit 8
Ah: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial
Ai: Cytochrome c oxidase subunit 7B
Aj: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial
Ak: Cytochrome c oxidase subunit 1
Al: Cytochrome c oxidase subunit 2
Am: Cytochrome c oxidase subunit 3
An: Cytochrome c oxidase subunit 4
Ao: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
Ap: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial
Aq: Cytochrome c oxidase subunit 6A2
Ar: Cytochrome c oxidase subunit
5: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
G: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
L: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
M: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
Ae: Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
Af: Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)1,894,732101
ポリマ－1,884,73980
非ポリマー9,99221
水00
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: 電子顕微鏡法, not applicable
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1

-
要素

+
Cytochrome b-c1 complex subunit ... , 6種, 12分子 0Ab3Ad6v9yu5zAa

#1: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial


分子量: 10685.803 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1JI21
#4: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 10


分子量: 6560.654 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SDI2
#5: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial


分子量: 48262.434 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RPD2
#8: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 7


分子量: 13587.549 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZPR8
#51: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial


分子量: 52756.320 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0PK14
#52: タンパク質 Cytochrome b-c1 complex subunit 8


分子量: 9784.339 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0SHY6

+
Ubiquinol-cytochrome c ... , 2種, 6分子 1Ac24AeAf

#2: タンパク質 Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein / cytochrome b-c1 complex subunit 9


分子量: 7412.530 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1J3N6
#3: タンパク質
Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1


分子量: 32174.654 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RNZ1

+
タンパク質 , 5種, 8分子 7w8xOXArG

#6: タンパク質 Cytochrome b


分子量: 42840.715 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q1HBG9
#7: タンパク質 Cytochrome c1


分子量: 35488.930 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287AZF9
#37: タンパク質 Acyl carrier protein


分子量: 17308.186 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1WW27
#64: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit


分子量: 10170.439 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0W345
#65: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial


分子量: 79627.398 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287ARY3

+
Cytochrome c oxidase subunit ... , 12種, 12分子 AAgAhAiAjAkAlAmAnAoApAq

#9: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 6C


分子量: 8617.122 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1TXH1
#53: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 8


分子量: 7615.939 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A1XQT4
#54: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial


分子量: 9028.479 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q8SPJ9
#55: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 7B


分子量: 9169.476 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287BJ57
#56: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial


分子量: 7358.661 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q1W0Y2
#57: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 1


分子量: 56992.711 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: O79876
#58: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 2 / Cytochrome c oxidase polypeptide II


分子量: 26203.564 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: P50667, cytochrome-c oxidase
#59: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 3


分子量: 29753.361 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q35916
#60: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 4


分子量: 19670.664 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1T8J9
#61: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial


分子量: 16771.195 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SJ34
#62: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial


分子量: 13801.783 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q5S3G4
#63: タンパク質 Cytochrome c oxidase subunit 6A2


分子量: 10876.370 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287AEB7

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit ... , 10種, 10分子 abcdenopZt

#10: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial


分子量: 21587.006 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SGC6
#11: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / Complex I-B17 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B17 subunit


分子量: 15603.177 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1UIV8
#12: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / Complex I-ASHI / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit


分子量: 21702.543 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RWL7
#13: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10


分子量: 20944.768 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0R7A9
#14: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial


分子量: 17384.729 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1EYI7
#22: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / Complex I-MNLL / NADH-ubiquinone oxidoreductase MNLL subunit


分子量: 7044.278 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1SNY5
#23: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4


分子量: 15117.350 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1T6M0
#24: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Complex I-B22 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B22 subunit


分子量: 26347.180 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: K7GSE5
#47: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / Complex I-B12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit


分子量: 12857.590 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0INK7
#50: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7


分子量: 16487.887 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SCH1

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit ... , 2種, 2分子 fg

#15: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial


分子量: 8664.053 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1EYQ2
#16: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2


分子量: 14327.655 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480JRW3

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein ... , 7種, 7分子 hCDFHIJ

#17: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5


分子量: 12506.591 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VX77
#28: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial


分子量: 53282.168 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480XQH6
#29: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / Complex I-30kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 30 kDa subunit


分子量: 30241.416 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZNN4
#31: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial


分子量: 13348.950 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1THU2
#32: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / Complex I-23kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 23 kDa subunit


分子量: 23893.281 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZUN9
#33: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / Complex I-20kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit


分子量: 29235.154 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VTL7
#34: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Complex I-18 kDa / NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit


分子量: 19718.500 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: G8IFA6

+
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain ... , 7種, 7分子 ijkmqrl

#18: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2


分子量: 39077.504 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
参照: UniProt: O79875, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
#19: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3


分子量: 12998.448 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: O79880
#20: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH dehydrogenase subunit 4L


分子量: 10827.253 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
参照: UniProt: P56632, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
#21: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6


分子量: 19021.332 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: O79882
#25: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH dehydrogenase subunit 4


分子量: 51859.387 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
参照: UniProt: O79881, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
#26: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase subunit 1


分子量: 35667.520 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
参照: UniProt: O79874, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
#48: タンパク質 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH dehydrogenase subunit 5


分子量: 68695.500 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
参照: UniProt: Q9TDR1, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein ... , 3種, 3分子 BER

#27: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial


分子量: 50637.766 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1SZP7
#30: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial


分子量: 27439.533 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VRV3
#40: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / Complex I-9kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 9 kDa subunit


分子量: 12172.800 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480TFA5

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit ... , 11種, 11分子 KNPQSTUVsLM

#35: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12


分子量: 17162.439 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SQP4
#36: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isoform X1


分子量: 13321.590 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0UWW0
#38: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2


分子量: 11099.798 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1FN21
#39: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / Complex I-B14 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B14 subunit


分子量: 17889.979 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0Z0K9
#41: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1


分子量: 8034.373 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0TJQ4
#42: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / Complex I-B9 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B9 subunit


分子量: 18319.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VPG4
#43: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial


分子量: 40476.082 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SIS9
#44: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11


分子量: 14686.894 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LGM4
#49: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / Complex I-19kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 19 kDa subunit


分子量: 27760.832 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SLR1
#66: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / Complex I-39kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 39 kDa subunit


分子量: 42066.738 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SL07
#67: タンパク質 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7


分子量: 12648.590 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8W4F7N8

+
NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit ... , 2種, 2分子 WY

#45: タンパク質 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13


分子量: 16911.611 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D0K655
#46: タンパク質 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2


分子量: 11939.366 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1G9F4

+
非ポリマー , 8種, 21分子

#68: 化合物
ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER


分子量: 175.820 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe2S2
#69: 化合物
ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME


分子量: 616.487 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C34H32FeN4O4
#70: 化合物 ChemComp-HEC / HEME C


分子量: 618.503 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C34H34FeN4O4
#71: 化合物 ChemComp-FMN / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE / FMN


分子量: 456.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C17H21N4O9P
#72: 化合物
ChemComp-SF4 / IRON/SULFUR CLUSTER


分子量: 351.640 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe4S4
#73: 化合物 ChemComp-ZMP / S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate


分子量: 568.704 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C25H49N2O8PS
#74: 化合物 ChemComp-HEA / HEME-A


分子量: 852.837 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C49H56FeN4O6
#75: 化合物 ChemComp-NDP / NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH


分子量: 745.421 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C21H30N7O17P3

+
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

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試料調製

構成要素名称: Cryo-EM structure of respiratory supercomplex I+III2
タイプ: COMPLEX
Entity ID: #9, #50, #31, #35, #43, #47, #10, #18, #21, #24-#25, #52, #4, #53-#64, #1-#3, #51, #5-#8, #27-#30, #65, #32-#34, #66-#67, #36-#39, #42, #44, #41
由来: NATURAL
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
緩衝液pH: 7.5
試料包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
急速凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズモード: BRIGHT FIELD / 倍率（公称値）: 81000 X / 最大 デフォーカス（公称値）: 1500 nm / 最小 デフォーカス（公称値）: 800 nm
撮影電子線照射量: 50 e/Å2
フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)

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解析

EMソフトウェア名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / カテゴリ: モデル精密化
CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
3次元再構成解像度: 3.41 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 6754 / 対称性のタイプ: POINT
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
ELECTRON MICROSCOPYf_bond_d0.004115805
ELECTRON MICROSCOPYf_angle_d0.717157315
ELECTRON MICROSCOPYf_dihedral_angle_d13.61842439
ELECTRON MICROSCOPYf_chiral_restr0.10617225
ELECTRON MICROSCOPYf_plane_restr0.00419903

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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