endonuclease activity, active with either ribo- or deoxyribonucleic acids and producing 3'-phosphomonoesters / micrococcal nuclease / nucleic acid binding / extracellular region / membrane / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
Thermonuclease family signature 1. / Thermonuclease active site / Thermonuclease family signature 2. / Staphylococcal nuclease (SNase-like), OB-fold / Staphylococcal nuclease homologue / Thermonuclease domain profile. / Staphylococcal nuclease homologues / SNase-like, OB-fold superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性
モノクロメーター: M / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54184 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.95→23.21 Å / Num. obs: 22934 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 9.6 % / Biso Wilson estimate: 25.76 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.015 / Rsym value: 0.043 / Net I/σ(I): 104.39
反射 シェル
解像度: 1.95→2.02 Å / 冗長度: 7.2 % / Rmerge(I) obs: 0.193 / Mean I/σ(I) obs: 5.88 / Num. unique obs: 2297 / Rsym value: 0.242 / % possible all: 99.9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0425
精密化
CrysalisPro
1.171.42.95a
データスケーリング
CrysalisPro
1.171.42.95a
データ削減
PHASER
2.8.3
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.95→21.76 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.948 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.922 / SU B: 9.143 / SU ML: 0.146 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.187 / ESU R Free: 0.172 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.26094
1137
5 %
RANDOM
Rwork
0.21065
-
-
-
obs
0.21313
21748
99.86 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK