登録情報 | データベース: PDB / ID: 9bja |
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タイトル | C. difficile Tcdb cysteine protease domain in complex with IP6 |
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要素 | Toxin B |
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キーワード | TOXIN / catalytic activity peptidase activity catalytic activity / acting on a protein toxin activity small molecule binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
glucosyltransferase activity / host cell cytosol / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / cysteine-type peptidase activity / host cell endosome membrane / toxin activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / lipid binding / host cell plasma membrane / proteolysis ...glucosyltransferase activity / host cell cytosol / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / cysteine-type peptidase activity / host cell endosome membrane / toxin activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / lipid binding / host cell plasma membrane / proteolysis / extracellular region / membrane / metal ion binding類似検索 - 分子機能 TcdA/TcdB toxin, N-terminal helical domain / TcdB toxin N-terminal helical domain / TcdA/TcdB toxin, catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB catalytic glycosyltransferase domain / Dermonecrotic/RTX toxin, membrane localization domain / Membrane Localization Domain / TcdA/TcdB toxin, pore forming domain / TcdA/TcdB pore forming domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain superfamily ...TcdA/TcdB toxin, N-terminal helical domain / TcdB toxin N-terminal helical domain / TcdA/TcdB toxin, catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB catalytic glycosyltransferase domain / Dermonecrotic/RTX toxin, membrane localization domain / Membrane Localization Domain / TcdA/TcdB toxin, pore forming domain / TcdA/TcdB pore forming domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain superfamily / Peptidase C80 family / CGT/MARTX cysteine protease (CPD) domain profile. / Choline-binding repeat / Putative cell wall binding repeat / Cell wall/choline-binding repeat / Cell wall-binding repeat profile. / Nucleotide-diphospho-sugar transferases類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Clostridioides difficile (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Veyron, S. / Cummer, R. |
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資金援助 | カナダ, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Canadian Institutes of Health Research (CIHR) | PJT-173262 | カナダ | Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC, Canada) | RGPIN-2020-04908 | カナダ |
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引用 | ジャーナル: Chemrxiv / 年: 2024 タイトル: Structure-activity relationship of inositol thiophosphate analogs as allosteric activators of Clostridioides difficile Toxin B 著者: Cummer, R. / Grosjean, F. / Bolteau, R. / Vasegh, S.E. / Veyron, S. / Keogh, L. / Trempe, J.-F. / Castagner, B. |
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履歴 | 登録 | 2024年4月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2024年7月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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