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- PDB-8zys: Crystal structure of HSF5 DNA-binding domain in complex with 3-si... -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 8zys

タイトル

Crystal structure of HSF5 DNA-binding domain in complex with 3-site HSE DNA (25 bp)

要素

(DNA (25-MER)) x 2
Heat shock factor protein 5

キーワード

DNA BINDING PROTEIN/DNA / HSF5 / HSE / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex

機能・相同性

機能・相同性情報

male meiotic nuclear division / XY body / DNA-binding transcription repressor activity / DNA-binding transcription activator activity / sequence-specific double-stranded DNA binding / spermatogenesis / cell differentiation / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleus
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2 Å

データ登録者

Shi, X. / Zhang, Q. / Liu, W.

資金援助

中国, 4件

引用

ジャーナル: to be published
タイトル: Crystal structure of HSF5 DNA-binding domain in complex with 3-site HSE DNA (25 bp)
著者: Shi, X. / Zhang, Q. / Liu, W.

履歴

登録	2024年6月18日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBC
改定 1.0	2025年3月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年5月7日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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文書・要旨	8zys_validation.pdf.gz	506 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8zys_full_validation.pdf.gz	522.7 KB	表示
XML形式データ	8zys_validation.xml.gz	34.9 KB	表示
CIF形式データ	8zys_validation.cif.gz	46.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zy/8zys ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zy/8zys	HTTPS FTP

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類似性 (1)

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集合体

登録構造単位

A: Heat shock factor protein 5

B: Heat shock factor protein 5

C: Heat shock factor protein 5

D: Heat shock factor protein 5

E: Heat shock factor protein 5

F: Heat shock factor protein 5

G: DNA (25-MER)

H: DNA (25-MER)

I: DNA (25-MER)

J: DNA (25-MER)

117 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

A: Heat shock factor protein 5

B: Heat shock factor protein 5

C: Heat shock factor protein 5

G: DNA (25-MER)

H: DNA (25-MER)

登録者が定義した集合体
根拠: homology
58.3 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

D: Heat shock factor protein 5

E: Heat shock factor protein 5

F: Heat shock factor protein 5

I: DNA (25-MER)

J: DNA (25-MER)

登録者が定義した集合体
58.3 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	49.960, 50.000, 126.880
Angle α, β, γ (deg.)	78.955, 88.541, 73.066
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1
Space group name Hall	P1
Symmetry operation	#1: x,y,z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and (resid 13 through 53 or resid 71 through 92 or resid 108 through 129))
d_2	ens_1	(chain "B" and (resid 13 through 53 or resid 71 through 92 or resid 108 through 129))
d_3	ens_1	(chain "C" and (resid 13 through 53 or resid 71 through 92 or resid 108 through 129))
d_4	ens_1	(chain "D" and (resid 13 through 53 or resid 71 through 92 or resid 108 through 129))
d_5	ens_1	(chain "E" and (resid 13 through 53 or resid 71 through 92 or resid 108 through 129))
d_6	ens_1	(chain "F" and (resid 13 through 92 or resid 108 through 129))
d_1	ens_2	chain "G"
d_2	ens_2	chain "I"
d_1	ens_3	chain "H"
d_2	ens_3	(chain "J" and resid 2 through 25)

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
d_1	1	ens_1	ASN	ASN	PRO	PRO	A	A	13 - 53	10 - 50
d_1	2	ens_1	LEU	LEU	VAL	VAL	A	A	71 - 92	68 - 89
d_1	3	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	A	A	108 - 129	105 - 126
d_2	1	ens_1	ASN	ASN	PRO	PRO	B	B	13 - 53	10 - 50
d_2	2	ens_1	LEU	LEU	VAL	VAL	B	B	71 - 92	68 - 89
d_2	3	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	B	B	108 - 129	105 - 126
d_3	1	ens_1	ASN	ASN	PRO	PRO	C	C	13 - 53	10 - 50
d_3	2	ens_1	LEU	LEU	VAL	VAL	C	C	71 - 92	68 - 89
d_3	3	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	C	C	108 - 129	105 - 126
d_4	1	ens_1	ASN	ASN	PRO	PRO	D	D	13 - 53	10 - 50
d_4	2	ens_1	LEU	LEU	VAL	VAL	D	D	71 - 92	68 - 89
d_4	3	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	D	D	108 - 129	105 - 126
d_5	1	ens_1	ASN	ASN	PRO	PRO	E	E	13 - 53	10 - 50
d_5	2	ens_1	LEU	LEU	VAL	VAL	E	E	71 - 92	68 - 89
d_5	3	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	E	E	108 - 129	105 - 126
d_6	1	ens_1	ASN	ASN	VAL	VAL	F	F	13 - 92	10 - 89
d_6	2	ens_1	LEU	LEU	ARG	ARG	F	F	108 - 129	105 - 126
d_1	1	ens_2	DA	DA	DC	DC	G	G	1 - 2	1 - 2
d_2	1	ens_2	DA	DA	DC	DC	I	I	1 - 2	1 - 2
d_1	1	ens_3	DG	DG	DG	DG	H	H	2	2
d_2	1	ens_3	DG	DG	DG	DG	J	J	2	2

NCSアンサンブル:

ID
ens_1
ens_2
ens_3

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.300767955039, -0.953653802694, -0.00911382630726), (-0.953300443719, 0.300353377955, 0.0317192742169), (-0.0275118379581, 0.0182283559042, -0.999455264538)	61.2500708687, 43.6688666924, 78.502833075
2	given	(0.974728316968, -0.22124325922, -0.0309213251794), (0.221176199862, 0.97521769649, -0.00561543122649), (0.0313973998204, -0.00136554136945, 0.999506047296)	18.4227243995, 5.40111220593, -26.25171371
3	given	(-0.295611203702, -0.955306427704, -0.00190930173233), (-0.955307583389, 0.295612888751, -0.000664171764323), (0.00119890175615, 0.00162763380915, -0.999997956719)	62.4755049235, 46.079840613, 120.213522431
4	given	(0.99979571612, -0.0091516576149, -0.0180214647498), (0.00946297494477, 0.999806150237, 0.0172659796309), (0.0178599589592, -0.017432989139, 0.999688507864)	2.28247408753, 0.210749908799, 42.0523981051
5	given	(-0.483037051798, -0.875587150935, -0.00472733615303), (-0.87497134934, 0.482478725302, 0.0404897204885), (-0.0331714398835, 0.0236943189055, -0.999168771944)	52.3225193667, 29.3888199524, 146.563709236
6	given	(-0.287994618581, -0.957626667544, -0.00320394701049), (-0.95761726044, 0.288007145761, -0.00458982546874), (0.0053180989019, 0.00174630992356, -0.99998433399)	62.2261553263, 46.2635837524, 120.148297971
7	given	(-0.318977794438, -0.94756249013, -0.0194549210716), (-0.947756606099, 0.318838249228, 0.00997929978737), (-0.00325303718293, 0.021621705003, -0.999760931234)	64.1933340659, 45.0943291589, 120.164814744

-
要素

#1: タンパク質	Heat shock factor protein 5 / HSF 5 / Heat shock transcription factor 5 / HSTF 5 分子量: 14298.238 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HSF5, HSTF5 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q4G112
#2: DNA鎖	DNA (25-MER) 分子量: 7651.962 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)
#3: DNA鎖	DNA (25-MER) 分子量: 7704.969 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 363 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	N

-
実験情報

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.55 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.82 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 0.1 M HEPES pH 7.5, 10% v/v glycol, 5% PEG8000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL18U1 / 波長: 0.9791 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2023年1月7日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9791 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2→50 Å / Num. obs: 75257 / % possible obs: 96.7 % / 冗長度: 3.52 % / B_iso Wilson estimate: 39.03 Å² / CC_1/2: 0.996 / Net I/σ(I): 10.8
反射シェル	解像度: 2→2.05 Å / Num. unique obs: 5547 / CC_1/2: 0.893

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.19.1_4122	精密化
XDS	Jan 10, 2022	データ削減
XDS	Jan 10, 2022	データスケーリング
PHENIX	1.19.1_4122	位相決定
BUSTER	2.10.4	精密化

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2→41.51 Å / SU ML: 0.25 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.98 / 位相誤差: 29.3332
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2409	3843	5.11 %
R_work	0.2129	71306	-
obs	0.2144	75149	96.6 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 60.93 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2→41.51 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4782	2021	0	363	7166

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0071	7196
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.1814	10148
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0686	1084
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0196	952
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	27.1896	1593

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Asym-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.907477271798
ens_1	d_3	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.07545516813
ens_1	d_4	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.660703651164
ens_1	d_5	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.907557775724
ens_1	d_6	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.18016328907
ens_2	d_2	G	G	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.403117838363
ens_3	d_2	H	H	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.657676800035

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2-2.03	0.3251	131	0.3041	2576	X-RAY DIFFRACTION	97.13
2.03-2.05	0.2946	146	0.2802	2676	X-RAY DIFFRACTION	95.99
2.05-2.08	0.2936	138	0.2733	2651	X-RAY DIFFRACTION	95.55
2.08-2.11	0.2824	125	0.2682	2617	X-RAY DIFFRACTION	96.82
2.11-2.14	0.2298	137	0.2537	2616	X-RAY DIFFRACTION	96.49
2.14-2.17	0.3021	158	0.249	2686	X-RAY DIFFRACTION	95.31
2.17-2.21	0.2733	126	0.2458	2603	X-RAY DIFFRACTION	97.64
2.21-2.25	0.342	152	0.2962	2591	X-RAY DIFFRACTION	95.88
2.25-2.29	0.3169	158	0.2824	2618	X-RAY DIFFRACTION	95.4
2.29-2.33	0.2962	137	0.2475	2663	X-RAY DIFFRACTION	97.59
2.33-2.38	0.2778	147	0.2345	2681	X-RAY DIFFRACTION	94.96
2.38-2.43	0.2936	126	0.2416	2595	X-RAY DIFFRACTION	98.16
2.43-2.49	0.2635	143	0.237	2699	X-RAY DIFFRACTION	96.08
2.49-2.55	0.2785	146	0.2285	2593	X-RAY DIFFRACTION	97.58
2.55-2.62	0.2622	137	0.2245	2678	X-RAY DIFFRACTION	96.01
2.62-2.7	0.2632	128	0.2267	2674	X-RAY DIFFRACTION	97.39
2.7-2.78	0.2807	131	0.2328	2654	X-RAY DIFFRACTION	96.1
2.78-2.88	0.2646	148	0.2375	2659	X-RAY DIFFRACTION	98.28
2.88-3	0.2562	145	0.2434	2636	X-RAY DIFFRACTION	96.43
3-3.14	0.2578	158	0.2548	2671	X-RAY DIFFRACTION	96.68
3.14-3.3	0.2444	139	0.2102	2628	X-RAY DIFFRACTION	96.44
3.3-3.51	0.2157	149	0.1993	2627	X-RAY DIFFRACTION	96.69
3.51-3.78	0.2419	142	0.2053	2644	X-RAY DIFFRACTION	96.84
3.78-4.16	0.2371	138	0.1791	2680	X-RAY DIFFRACTION	96.97
4.16-4.76	0.1673	150	0.1631	2617	X-RAY DIFFRACTION	97.16
4.76-5.99	0.215	162	0.1837	2652	X-RAY DIFFRACTION	97.13
6-41.51	0.2267	146	0.2027	2621	X-RAY DIFFRACTION	95.84

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.31365674005	6.15279255421	0.0115355225261	9.51206439699	1.58303083614	5.94770566723	-0.0660711902557	0.591010601607	0.113745922025	-1.37273710395	0.0536540960628	0.502930572014	-0.0806615636766	0.0053365351274	-0.0820001272419	0.478178542909	0.0706057288867	0.0026640437099	0.337878234384	0.0357639978388	0.568191180453	32.9963449803	-7.14773625947	30.06817509
2	4.96975467819	-3.23601561278	1.65099610209	3.57384852941	-3.18882681205	3.57723827267	-0.455529721693	0.184547167759	-0.733865384071	-0.881010270021	-0.341002142705	-1.03880184658	-0.55863285804	-0.384448299638	0.22514900215	0.559954256835	0.0326422402751	0.0557031170052	0.226256118861	-0.0799720821647	0.606830959723	37.1139039682	-19.1947326725	33.3435460964
3	6.82618065717	-0.919132671989	5.94567951545	6.16926212901	0.525291699717	7.39101767561	0.340125656409	-0.379085515908	-0.701218641491	-0.350692848533	0.0285770189179	0.154941110747	0.429540653286	-0.4226524736	-0.362597964275	0.395092960143	-0.0307630470961	-0.0317993500848	0.289647660086	0.0311049475724	0.607215842387	31.5889689674	-16.0398044087	39.5663440341
4	2.34217443323	2.9189473697	-0.0682062673513	8.77282809706	3.32738382343	2.55459387541	-0.355068354286	1.27904000221	-0.0779036695943	-1.39635612338	0.69624865324	-2.15930473531	-0.312459548693	1.71240966721	-0.682260782612	0.682020306164	-0.00276590659297	0.13173226547	0.872117408738	-0.013221336077	1.13516743882	44.1959198787	-8.71378496095	37.6944146967
5	5.91678932274	-0.263706234713	0.820688659536	6.19696021979	1.77751967272	3.99619083132	0.126299280165	-0.352383463586	-0.259625034184	0.497950273159	0.0648521506259	0.0605973004722	0.236154585152	-0.253942342311	-0.129316508619	0.237243987971	0.00317549604405	-0.00139023847839	0.243639405847	0.0334767483105	0.38238377935	29.7248085337	-6.49267107021	43.6815193175
6	5.24396015854	-1.91929025663	0.773914422038	9.39916444505	-5.05697783496	6.9582176847	0.319798064245	0.0384084212434	-0.641871117585	-0.938569500831	0.253253507173	1.05291150181	0.755619174263	-1.05540807471	-0.411560756449	0.358902229198	0.0212880439998	-0.0579285785945	0.382484021003	0.0319856111955	0.631131673616	22.5963522815	-8.22758739593	33.1309565377
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38	3.47029494418	-1.49643256118	2.65605569421	4.0434243575	1.19921557165	6.69465978086	0.586771426549	-0.276198474016	0.350507873274	0.53751477752	-0.794110070095	-0.762108200129	-1.1558035102	1.48353423346	0.117764863577	0.864844208071	-0.351780797261	0.0160758490036	0.993457774521	0.0393466375847	0.40444857634	48.8193356235	5.10363420074	106.533205518
39	1.83639690981	0.3776765421	0.920990400002	0.35527516446	0.339111155984	0.594895123823	0.0787251254021	-0.567683909795	0.237262943008	0.268033355997	-0.250754969941	0.36653220075	-0.488953957112	-0.20456084463	-0.0400713927186	1.30522491628	-0.335617453003	-0.160409306904	0.877836869627	-0.293394992345	-0.736096821018	40.6701786683	8.58173373153	115.441676507
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43	4.37120803912	2.13725265331	-2.38579923182	2.78130765826	-1.7366358396	3.14341448712	0.12068081265	-0.318483645056	0.560114179105	0.153461365549	0.0971504341239	0.385866698034	-0.119784401785	-0.178385816474	-0.258682258893	0.222219286109	0.0554561359928	-0.0160726186644	0.295794785409	-0.0234545956999	0.523759822809	36.9804731838	6.70165451896	44.3540108494
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46	5.05108581674	1.66856614811	-2.34368158809	1.79944565943	-0.541677829078	6.16308815041	0.251454972904	-0.310493377294	0.328394278711	0.233970856908	-0.00145225392533	0.308565014704	-0.160817633182	-0.180028393148	-0.364263865266	0.350783112544	0.00048927630347	0.0273736062142	0.277497554527	0.00974038575423	0.441490455704	34.1940127023	4.53270716094	93.9999331872
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49	4.93579297065	3.55080454467	-3.6621771788	4.15775802687	-2.60919439198	4.13683522691	0.136319661092	0.230201100934	0.731604759705	-0.171484800564	0.301971655146	0.320230703059	-0.191391322043	-0.0256061289945	-0.51104203134	0.33262911352	0.0507209199046	-0.0282368055935	0.286074760437	0.0191316614916	0.485810553942	44.0064873525	11.8240583844	76.9347402296

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	chain 'A' and (resid 11 through 23 )	A	A	11 - 23	1 - 13
2	2	chain 'A' and (resid 24 through 29 )	A	A	24 - 29	14 - 19
3	3	chain 'A' and (resid 30 through 50 )	A	A	30 - 50	20 - 40
4	4	chain 'A' and (resid 51 through 76 )	A	A	51 - 76	41 - 51
5	5	chain 'A' and (resid 77 through 108 )	A	A	77 - 108	52 - 72
6	6	chain 'A' and (resid 109 through 126 )	A	A	109 - 126	73 - 90
7	7	chain 'A' and (resid 127 through 131 )	A	A	127 - 131	91 - 95
8	8	chain 'B' and (resid 11 through 29 )	B	B	11 - 29	1 - 19
9	9	chain 'B' and (resid 30 through 50 )	B	B	30 - 50	20 - 40
10	10	chain 'B' and (resid 51 through 76 )	B	B	51 - 76	41 - 52
11	11	chain 'B' and (resid 77 through 112 )	B	B	77 - 112	53 - 76
12	12	chain 'B' and (resid 113 through 131 )	B	B	113 - 131	77 - 95
13	13	chain 'C' and (resid 13 through 23 )	C	C	13 - 23	1 - 11
14	14	chain 'C' and (resid 24 through 29 )	C	C	24 - 29	12 - 17
15	15	chain 'C' and (resid 30 through 37 )	C	C	30 - 37	18 - 25
16	16	chain 'C' and (resid 38 through 50 )	C	C	38 - 50	26 - 38
17	17	chain 'C' and (resid 51 through 76 )	C	C	51 - 76	39 - 51
18	18	chain 'C' and (resid 77 through 107 )	C	C	77 - 107	52 - 72
19	19	chain 'C' and (resid 108 through 112 )	C	C	108 - 112	73 - 77
20	20	chain 'C' and (resid 113 through 120 )	C	C	113 - 120	78 - 85
21	21	chain 'C' and (resid 121 through 129 )	C	C	121 - 129	86 - 94
22	22	chain 'D' and (resid 10 through 37 )	D	D	10 - 37	1 - 28
23	23	chain 'D' and (resid 38 through 50 )	D	D	38 - 50	29 - 41
24	24	chain 'D' and (resid 51 through 76 )	D	D	51 - 76	42 - 53
25	25	chain 'D' and (resid 77 through 108 )	D	D	77 - 108	54 - 72
26	26	chain 'D' and (resid 109 through 120 )	D	D	109 - 120	73 - 84
27	27	chain 'D' and (resid 121 through 131 )	D	D	121 - 131	85 - 95
28	28	chain 'E' and (resid 12 through 29 )	E	E	12 - 29	1 - 18
29	29	chain 'E' and (resid 30 through 50 )	E	E	30 - 50	19 - 39
30	30	chain 'E' and (resid 51 through 76 )	E	E	51 - 76	40 - 52
31	31	chain 'E' and (resid 77 through 108 )	E	E	77 - 108	53 - 71
32	32	chain 'E' and (resid 109 through 126 )	E	E	109 - 126	72 - 89
33	33	chain 'E' and (resid 127 through 132 )	E	E	127 - 132	90 - 95
34	34	chain 'F' and (resid 12 through 23 )	F	F	12 - 23	1 - 12
35	35	chain 'F' and (resid 24 through 37 )	F	F	24 - 37	13 - 26
36	36	chain 'F' and (resid 38 through 50 )	F	F	38 - 50	27 - 39
37	37	chain 'F' and (resid 51 through 86 )	F	F	51 - 86	40 - 58
38	38	chain 'F' and (resid 87 through 120 )	F	F	87 - 120	59 - 80
39	39	chain 'F' and (resid 121 through 130 )	F	F	121 - 130	81 - 90
40	40	chain 'G' and (resid 1 through 15 )	G	G	1 - 15
41	41	chain 'G' and (resid 16 through 25 )	G	G	16 - 25
42	42	chain 'H' and (resid 2 through 11 )	H	H	2 - 11
43	43	chain 'H' and (resid 12 through 25 )	H	H	12 - 25
44	44	chain 'I' and (resid 1 through 5 )	I	I	1 - 5
45	45	chain 'I' and (resid 6 through 10 )	I	I	6 - 10
46	46	chain 'I' and (resid 11 through 20 )	I	I	11 - 20
47	47	chain 'I' and (resid 21 through 25 )	I	I	21 - 25
48	48	chain 'J' and (resid 1 through 10 )	J	J	1 - 10
49	49	chain 'J' and (resid 11 through 25 )	J	J	11 - 25

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)