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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8z1e | ||||||
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タイトル | A homotrimeric GPCR architecture of the human cytomegalovirus (UL78) revealed by cryo-EM | ||||||
![]() | Uncharacterized protein UL78 | ||||||
![]() | ANTIVIRAL PROTEIN / human cytomegalovirus (HCMV) / UL78 / homotrimeric architecture / STRUCTURAL PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | GPCR, rhodopsin-like, 7TM / G-protein coupled receptors family 1 profile. / membrane / Uncharacterized protein UL78![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.12 Å | ||||||
![]() | Chen, Y. / Li, Y. / Zhou, Q. / Cong, Z. / Lin, S. / Yan, J. / Chen, X. / Yang, D. / Ying, T. / Wang, M.-W. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: A homotrimeric GPCR architecture of the human cytomegalovirus revealed by cryo-EM. 著者: Yanyan Chen / Yang Li / Qingtong Zhou / Zhaotong Cong / Shi Lin / Jiahui Yan / Xianyue Chen / Dehua Yang / Tianlei Ying / Ming-Wei Wang / ![]() ![]() | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 165.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 131.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 45.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 39724MC ![]() 39613 M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 31873.582 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: UL78 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P16751 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: A homotrimeric GPCR architecture of the human cytomegalovirus revealed by cryo-EM タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: NATURAL |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: OTHER / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER |
電子レンズ | モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 2200 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 80 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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対称性 | 点対称性: C3 (3回回転対称) | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.12 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 85264 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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