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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8xth | ||||||
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タイトル | Thanatin PM15Y in LPS | ||||||
![]() | Thanatin | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / STRUCTURE FROM CYANA 2.1 | ||||||
機能・相同性 | defense response to fungus / killing of cells of another organism / defense response to bacterium / innate immune response / extracellular region / Thanatin![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Swaleeha, A. / Bhattacharrya, S. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Thanatin VF16QK in LPS 著者: Swaleeha, A. / Bhattacharrya, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 112.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 84.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 422.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 593 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 18.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1909.308 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 300 uM Thanatin PM15Y in LPS, 90% H2O/10% D2O / Label: Thanatin PM15Y in LPS / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 300 uM / 構成要素: Thanatin PM15Y in LPS / Isotopic labeling: none |
試料状態 | イオン強度: 0 mM / Label: conditions_1 / pH: 5 / 圧: 1 atm / 温度: 278 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 2 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |