PDB-8uro: Crystal structure of IgG1-Fc fragment (E382S) in complex with Cor...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8uro

タイトル

Crystal structure of IgG1-Fc fragment (E382S) in complex with Corynebacterial ENGase CU43 (D187A-E189A)

要素

Corynebacterial protease CP40
Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

キーワード

IMMUNE SYSTEM / IgG1-Fc / CU43 / Endoglycosidase / IgG-specific

機能・相同性

機能・相同性情報

immunoglobulin complex / adaptive immune response / extracellular region / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Corynebacterium ulcerans (バクテリア)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.62 Å

データ登録者

Sastre, D.E. / Sultana, N. / Sundberg, E.J.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2025
タイトル: The mechanistic basis for interprotomer deglycosylation of antibodies by corynebacterial IgG-specific endoglycosidases.
著者: Sastre, D.E. / Bournazos, S. / Huliciak, M. / Grace, B.A.C. / Boder, E.J. / Du, J. / Sultana, N. / Azzam, T. / Brown, T.J. / Flowers, M.W. / Lollar, P. / Xu, T. / Chernova, T.A. / Keith, A.D. ...

履歴

登録	2023年10月26日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年10月30日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年7月16日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb8uro.ent.gz	405.6 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8uro_validation.pdf.gz	493 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8uro_full_validation.pdf.gz	512.9 KB	表示
XML形式データ	8uro_validation.xml.gz	49.7 KB	表示
CIF形式データ	8uro_validation.cif.gz	65 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ur/8uro ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ur/8uro	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (2) #170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Corynebacterial protease CP40

B: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

C: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

D: Corynebacterial protease CP40

E: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

F: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

197 kDa, 6 ポリマー
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1

A: Corynebacterial protease CP40

B: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

C: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

登録者が定義した集合体
根拠: SAXS, complex 1:1, gel filtration, complex 1:1, surface plasmon resonance, complex 1:1, light scattering, complex 1:1 by SEC-MALS
98.3 kDa, 3 ポリマー
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2

D: Corynebacterial protease CP40

E: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

F: Immunoglobulin gamma-1 heavy chain

登録者が定義した集合体
98.3 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	124.439, 81.991, 148.099
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 113.20, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Corynebacterial protease CP40 分子量: 46107.309 Da / 分子数: 2 / 変異: D187A, E189A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Corynebacterium ulcerans (バクテリア) 遺伝子: cpp, CULC0211_20780 / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A830QWM5
#2: 抗体	Immunoglobulin gamma-1 heavy chain 分子量: 26084.551 Da / 分子数: 4 / 変異: E382S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P0DOX5
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 65.25 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 0.2 M Ammonium acetate 0.1 M MES 6.5 30 %v/v Glycerol ethoxylate (MIDAS 2-31)

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年12月10日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.6→50 Å / Num. obs: 30847 / % possible obs: 98.7 % / 冗長度: 7 % / CC_1/2: 0.98 / CC star: 0.995 / R_merge(I) obs: 0.2 / R_pim(I) all: 0.082 / R_rim(I) all: 0.219 / Χ²: 0.501 / Net I/σ(I): 6.2
反射シェル	解像度: 3.6→3.66 Å / 冗長度: 7.2 % / R_merge(I) obs: 0.957 / Mean I/σ(I) obs: 1.333 / Num. unique obs: 1554 / CC_1/2: 0.747 / CC star: 0.925 / R_pim(I) all: 0.38 / Χ²: 0.342 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.20.1_4487: ???)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3.62→33.96 Å / SU ML: 0.67 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.38 / 位相誤差: 39.46 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.3689	1948	6.46 %
R_work	0.3338	-	-
obs	0.3362	30141	95.6 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.62→33.96 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9190	0	0	0	9190

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	9373
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.534	12842
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	4.039	1412
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.041	1542
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	1690

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.62-3.71	0.5034	115	0.3885	1727	X-RAY DIFFRACTION	82
3.71-3.82	0.3663	152	0.3509	1970	X-RAY DIFFRACTION	95
3.82-3.93	0.3885	130	0.3309	2002	X-RAY DIFFRACTION	96
3.93-4.05	0.3811	139	0.3228	1998	X-RAY DIFFRACTION	96
4.05-4.2	0.3574	132	0.3308	2046	X-RAY DIFFRACTION	97
4.2-4.37	0.3663	142	0.3236	2050	X-RAY DIFFRACTION	98
4.37-4.56	0.3301	136	0.3047	2065	X-RAY DIFFRACTION	98
4.56-4.8	0.3344	151	0.32	2076	X-RAY DIFFRACTION	99
4.8-5.1	0.3309	146	0.3114	2054	X-RAY DIFFRACTION	99
5.1-5.5	0.3855	141	0.3267	2077	X-RAY DIFFRACTION	99
5.5-6.05	0.3688	139	0.3436	2053	X-RAY DIFFRACTION	97
6.05-6.92	0.4176	132	0.3421	1828	X-RAY DIFFRACTION	86
6.92-8.69	0.3691	146	0.3351	2104	X-RAY DIFFRACTION	99
8.69-33.96	0.3634	147	0.3515	2143	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.44	0.1034	-1.0906	0.0226	-0.0415	0.9033	0.893	0.1078	0.0884	-0.6124	0.5932	-0.3655	0.2281	0.325	0.5373	1.1482	0.2869	-0.1704	1.0534	0.0156	1.1854	58.1798	-19.4909	-9.7167
2	0.5829	-0.1182	-0.2453	0.6518	0.989	1.476	0.3334	-0.0853	-0.3601	0.0201	0.5777	0.3273	0.6181	-0.4308	2.0201	0.5598	-0.1834	-0.2669	0.5107	0.4318	1.1774	38.6757	-1.077	-25.6757
3	0.0929	0.0151	0.1457	0.0392	0.1373	0.6389	0.2458	-0.1479	-0.2251	-0.2655	0.1764	0.5628	0.6327	-0.9462	0.7073	1.3222	-0.2677	-0.6881	0.8706	0.2002	1.1044	38.0964	-6.2422	-29.0549
4	0.4815	-0.0718	0.1977	0.6091	0.8028	1.2453	0.3807	-0.0441	-0.378	0.4667	-0.0589	0.1247	0.9242	-0.1509	-0.5228	1.0849	0.1882	-0.4851	0.4093	0.1899	0.8608	43.1313	-11.1426	-25.7854
5	0.9332	-0.227	-0.5213	1.059	-1.5589	3.0852	0.7	-0.0572	-0.9869	-0.5107	0.5644	0.3437	0.4075	-0.8765	1.608	1.2348	-0.2062	-0.3191	0.8501	0.1005	0.785	43.5717	-22.2371	-17.2783
6	0.3143	0.1021	-0.2038	0.2857	-0.192	0.2532	-0.1472	0.0587	-0.3596	-0.4195	0.1516	-0.0446	0.1501	-0.1046	0.107	0.9833	-0.2663	-0.4209	0.466	0.2319	0.9913	47.1642	-23.9445	-10.92
7	1.3391	-0.0944	0.0997	0.5064	-0.1628	1.511	0.5063	-0.3058	-0.3237	-0.2433	0.5827	0.0415	0.1699	0.3895	1.4292	0.2958	0.2619	0.3492	0.6125	-0.2788	0.858	53.182	-13.203	-17.5194
8	0.3583	0.1624	-0.5144	0.2615	0.0654	1.2736	0.2179	0.2468	0.1782	-0.4803	0.3736	0.2391	-0.6628	-0.2217	0.3569	0.948	0.0501	-0.0748	0.2746	-0.0969	0.5103	50.8887	-4.7003	-7.2574
9	0.7364	0.3144	0.0987	0.2843	-0.2995	0.6448	0.1068	-0.1175	0.2192	0.02	0.3028	-0.1247	-0.0214	-0.42	0.6134	0.1934	0.2206	0.159	1.4116	0.0038	1.0194	35.4027	7.2905	-12.6035
10	0.3333	-0.2316	-0.5271	0.5608	0.4631	1.1214	0.4725	-0.2769	0.5946	0.1968	0.6451	0.0497	0.0865	0.2843	2.5032	-0.1242	0.5815	0.3296	-0.0751	0.0391	0.866	44.248	7.3415	-17.427
11	0.2228	-0.3515	0.1185	0.5459	-0.0047	0.1202	-0.5913	-0.4359	0.2126	0.5121	0.517	0.2859	-0.0051	-0.0231	-0.0001	0.6382	0.0645	0.0045	0.6307	0.0366	0.7519	58.6819	-22.1013	16.4611
12	0.0862	-0.0617	0.056	0.0472	-0.0427	0.0403	-0.064	0.1209	0.2178	0.0382	0.0748	-0.0673	-0.0155	0.1818	0.262	0.2092	-0.2436	0.3728	0.989	0.494	1.019	58.932	-29.2132	12.5248
13	0.4807	-0.3774	0.5959	0.9853	-0.7706	0.8214	-0.3046	-0.4043	0.9648	0.1596	-0.2209	-0.2305	-0.4167	0.0958	-0.0896	0.5666	-0.0531	0.0171	0.7858	0.003	0.8515	64.6686	-16.2186	18.8592
14	1.4315	-0.521	-1.2214	0.1848	0.4419	1.0498	0.8304	0.0271	-0.0876	-0.6181	-0.2546	-0.3283	0.0262	0.2503	0.399	1.0575	0.0726	-0.2837	0.7588	0.1168	0.6847	56.4753	-18.0957	8.3163
15	0.0373	-0.007	-0.019	0.0051	0.0037	0.0397	-0.0875	-0.306	0.136	-0.0902	0.3048	0.3256	-0.0091	0.0007	0.004	1.0541	0.0791	-0.5665	0.6702	-0.1256	1.4502	55.3028	-0.9713	33.2584
16	0.002	0.0037	0.005	0.0018	0.0033	0.0089	-0.2377	-0.29	-0.2738	0.3702	-0.0738	0.0914	0.0865	0.3745	0	0.9277	0.1204	0.162	1.3133	-0.3456	0.7236	43.306	-12.7003	57.2806
17	0.4802	-0.3855	-0.0505	0.3662	0.1461	0.2075	0.4336	0.3505	0.6556	-0.0928	-0.2871	-0.0793	-0.4373	0.1566	0.4743	0.4915	-0.239	0.5048	0.9368	-0.114	0.6725	52.9808	-10.0265	39.1608
18	0.0194	-0.1386	-0.0122	0.4072	-0.0176	0.1586	0.1713	-0.9316	0.6134	0.6745	-0.1107	0.335	0.3553	0.142	-0.0175	0.6681	-0.182	0.1782	1.0462	-0.0892	0.832	52.1877	-11.4437	49.3642
19	0.4708	0.0836	0.0964	0.3696	-0.1215	0.3568	0.1535	-0.2906	-0.0212	-0.0419	-0.0899	-0.3524	0.0168	0.0786	0.1507	0.2877	0.5252	0.1177	1.413	-0.2905	0.5622	61.2471	-6.3306	40.8205
20	0.2839	-0.6678	-0.1557	1.6401	0.4468	0.1222	0.166	-0.2619	-0.3727	-0.4164	0.0734	0.3235	-0.4606	0.0692	0.0233	1.0783	-0.2662	0.7215	1.0506	0.6081	2.2696	22.0131	-18.1214	22.1525
21	-0.0119	0.0138	-0.0454	-0.0068	-0.0057	0.0355	0.0315	-0.901	-0.0407	-0.2135	0.3135	0.0007	-0.1805	-0.3265	0.0002	1.1046	-0.0796	0.2011	1.6675	0.2666	1.2066	20.0771	-18.5786	29.4148
22	2.2884	-0.4625	1.6797	1.412	-0.1942	1.6343	0.1041	-1.2613	0.2339	0.8161	0.7589	0.0605	-0.9062	0.653	1.9816	1.041	-0.3182	0.5745	1.0161	-0.1666	0.9305	36.2739	-10.0075	42.1033
23	0.5931	-0.86	0.0689	1.2942	-0.07	0.8003	0.2353	-0.3963	0.4481	0.0306	0.7034	0.2106	-0.5032	-0.5666	1.5223	0.4643	-0.2376	0.7517	1.1743	-0.3625	1.1453	36.5793	-6.5625	44.8663
24	1.3817	-1.0663	0.3978	3.2263	-0.8975	0.4797	-0.6774	-0.2075	-0.1512	0.631	0.5299	-0.1257	-1.3077	0.0522	-0.1061	1.0099	-0.4877	-0.2824	0.4899	0.0591	0.7206	-34.9106	-2.2115	49.8675
25	1.0226	-0.3975	-0.5085	1.0023	-0.5417	0.8935	0.2598	0.4236	-0.1717	-0.2208	-0.0408	0.1619	0.3509	-0.2092	0.2465	1.3687	-0.363	0.2359	1.4853	-0.3074	0.5085	-33.1998	-12.7018	23.2894
26	1.8005	-0.4151	-1.0577	0.3144	-0.0084	0.9482	-0.2146	-0.2928	-0.3611	0.071	0.0004	-0.3203	-0.1958	0.2789	-0.3956	1.1256	-0.5013	-0.121	0.6607	-0.0126	0.6078	-37.2843	-6.3719	30.8571
27	0.6649	-0.0917	0.0998	0.3064	-0.0912	0.0393	0.4676	0.1137	-0.1214	-0.8428	0.2027	0.3764	0.2688	0.0456	0.5414	1.09	-0.3199	-0.1493	0.9287	-0.0343	0.6556	-36.8783	-0.6359	37.2205
28	0.4538	0.0879	-0.176	0.2425	0.3199	0.8452	0.4108	0.2156	0.2967	-0.0713	0.6238	0.5314	-0.4512	-0.1869	3.0382	1.2354	-0.5884	-0.2243	0.8419	0.4977	0.8697	-32.6414	15.6057	42.8903
29	0.5132	-0.6527	-0.1092	1.5534	0.4592	0.1858	0.0852	0.2264	-0.0949	-0.778	0.069	1.0467	-0.1254	-0.2789	-0.0259	0.7062	-0.2274	-0.1048	0.6493	0.1206	0.5269	-30.4696	2.6151	42.3669
30	0.1778	0.0473	0.1389	0.4292	0.0733	0.1191	0.0938	-0.0255	0.2092	-0.1954	0.2197	0.3287	-0.0875	0.2478	0.3572	1.034	-0.5312	0.313	0.6142	0.0766	0.5646	-28.3182	11.6122	49.7694
31	0.0784	0.1412	0.2654	0.1878	0.3789	1.3581	-0.549	-0.0399	0.3051	0.0354	0.4509	0.3493	-0.6597	0.5946	-0.019	0.8578	0.0405	0.0059	0.4369	0.0591	0.6374	-36.9766	0.7114	50.2044
32	0.0137	0.0168	0.1471	0.0949	0.2383	0.5677	-0.622	0.1063	-0.1588	-0.33	0.3932	-0.0247	-0.9737	0.265	-0.0145	0.6573	-0.0291	0.0005	0.5352	0.0801	0.9135	-27.9926	-7.3082	54.6638
33	0.044	0.0136	0.0329	0.0039	0.0255	0.0828	-0.5532	0.0978	-0.4695	-0.1123	0.5821	-0.1603	0.1186	0.6963	-0.0007	1.4892	-0.1687	0.0927	1.2973	-0.3825	1.0529	-22.6813	-20.2409	39.8358
34	0.949	-0.8463	-0.3104	1.1123	0.4018	0.1181	-0.6483	0.2589	-0.543	-0.0568	0.3091	-0.4004	0.0637	0.811	-0.0746	0.4404	-0.3111	0.1957	0.6323	-0.267	0.7041	-31.7959	-19.8106	43.4825
35	0.686	0.3565	-0.1004	0.6596	-0.4559	1.0456	-0.4419	-0.0545	-0.559	0.0037	0.9746	-0.0506	1.1952	0.1611	0.2437	0.9681	0.1272	0.1157	0.5751	0.0451	0.7732	-14.984	11.0653	75.4085
36	0.6066	0.3271	-0.5035	1.085	-0.5562	0.5481	-0.8513	-0.6886	-0.0466	0.1005	-0.0842	0.5765	0.5204	0.4334	-1.533	1.2761	0.5422	-0.2795	0.9276	-0.0225	0.5663	-1.7183	-0.6961	78.0706
37	0.265	-0.3654	-0.6525	0.775	0.4883	2.2613	0.2429	0.0713	-0.2669	0.2169	0.4168	0.1508	-0.4593	0.8857	0.5398	1.1474	0.8414	0.1658	1.3002	0.1675	0.7164	9.1209	-1.2463	89.4575
38	1.7625	0.445	0.777	1.8582	2.2715	2.828	0.1281	-0.1419	-0.2255	0.3918	0.9155	-0.2858	0.4838	0.6531	1.2179	1.0836	0.2819	0.4411	1.0483	0.6371	1.2567	17.2725	7.1969	54.2276
39	0.0741	-0.0142	0.017	0.0372	-0.03	0.0049	0.7775	0.673	-0.1523	-0.5097	-0.123	0.1006	-0.2836	-0.3773	0.0028	1.9035	-0.0095	0.2466	0.8612	0.1727	1.0775	15.2441	12.9033	44.8136
40	1.1335	-0.412	0.6379	1.5963	-1.0061	0.7449	0.7048	0.3187	0.3296	-0.0014	0.4518	-0.1099	0.1767	0.0882	0.1642	1.7913	0.7659	0.4003	2.3338	-0.1798	0.9588	19.1036	9.5331	52.5991
41	0.3493	0.1702	0.057	0.4834	-0.2995	0.2069	-0.3357	-0.0217	0.0798	0.075	0.1834	0.1967	0.2772	0.1408	-0.1189	0.7936	0.3281	0.4707	1.2883	-0.4586	0.8883	17.278	13.6653	61.1933
42	0.7709	-0.0422	-0.345	0.7627	0.0582	1.6328	0.1829	-0.1892	-0.0642	0.0764	0.6984	-0.3492	0.1869	0.4942	1.9426	1.9682	0.9533	0.726	1.4606	-0.0282	0.7798	19.6261	-5.953	80.2343
43	0.1222	-0.1441	-0.1674	0.1563	0.198	0.2505	0.0608	0.2222	-0.5091	-0.2664	-0.1298	-0.1458	-0.3004	0.0672	-0.2211	1.021	1.5176	0.5249	1.4423	0.3479	1.1329	20.3534	-6.3007	75.9689
44	0.3374	0.0301	0.1538	0.0284	0.0233	0.0815	-0.356	0.0235	-0.1713	-0.0812	-0.0496	0.1927	-0.1061	0.064	-0.2608	2.0737	0.7493	0.0937	2.1094	-0.6965	0.8374	30.8545	-1.5058	74.4051

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 36 through 55 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 56 through 93 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 94 through 122 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 123 through 150 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 151 through 196 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 197 through 212 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 213 through 245 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 246 through 291 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 292 through 311 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 312 through 369 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 237 through 279 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 280 through 301 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 302 through 314 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 315 through 337 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 338 through 351 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 352 through 363 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 364 through 403 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 404 through 423 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resid 424 through 443 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 238 through 295 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 296 through 314 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 315 through 388 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 389 through 443 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 36 through 71 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 72 through 93 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 94 through 122 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 123 through 150 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 151 through 175 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 176 through 196 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 197 through 212 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 213 through 245 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 246 through 291 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 292 through 311 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 312 through 369 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 236 through 314 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 315 through 372 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'E' and (resid 373 through 441 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 239 through 270 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 271 through 295 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'F' and (resid 302 through 315 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'F' and (resid 316 through 351 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'F' and (resid 352 through 379 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'F' and (resid 382 through 426 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'F' and (resid 427 through 443 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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