+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8t7u | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | ADP-bound Bcs1 (unsymmetrized) | ||||||
![]() | Mitochondrial chaperone BCS1 | ||||||
![]() | TRANSLOCASE / Heptamer / ADP-bound / AAA-ATPase | ||||||
機能・相同性 | ![]() mitochondrial protein-transporting ATPase activity / protein insertion into mitochondrial inner membrane from matrix / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / mitochondrial respiratory chain complex III assembly / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial inner membrane / ATP hydrolysis activity / mitochondrion / ATP binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.74 Å | ||||||
![]() | Zhan, J. / Xia, D. | ||||||
資金援助 | ![]()
| ||||||
![]() | ![]() タイトル: Conformations of Bcs1L undergoing ATP hydrolysis suggest a concerted translocation mechanism for folded iron-sulfur protein substrate. 著者: Jingyu Zhan / Allison Zeher / Rick Huang / Wai Kwan Tang / Lisa M Jenkins / Di Xia / ![]() 要旨: The human AAA-ATPase Bcs1L translocates the fully assembled Rieske iron-sulfur protein (ISP) precursor across the mitochondrial inner membrane, enabling respiratory Complex III assembly. Exactly how ...The human AAA-ATPase Bcs1L translocates the fully assembled Rieske iron-sulfur protein (ISP) precursor across the mitochondrial inner membrane, enabling respiratory Complex III assembly. Exactly how the folded substrate is bound to and released from Bcs1L has been unclear, and there has been ongoing debate as to whether subunits of Bcs1L act in sequence or in unison hydrolyzing ATP when moving the protein cargo. Here, we captured Bcs1L conformations by cryo-EM during active ATP hydrolysis in the presence or absence of ISP substrate. In contrast to the threading mechanism widely employed by AAA proteins in substrate translocation, subunits of Bcs1L alternate uniformly between ATP and ADP conformations without detectable intermediates that have different, co-existing nucleotide states, indicating that the subunits act in concert. We further show that the ISP can be trapped by Bcs1 when its subunits are all in the ADP-bound state, which we propose to be released in the apo form. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 585.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 408.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 41095MC ![]() 8t14C ![]() 8t5uC ![]() 8tbyC ![]() 8ti0C ![]() 8tp1C ![]() 8tplC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
|
---|---|
1 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 48289.887 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-ADP / 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
---|---|
EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-
試料調製
構成要素 | 名称: Heptameric Bcs1 in uniform ADP-bound state captured in active ATPase cycle in the presence of substrate ISP-ED, unsymmetrized タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
---|---|
分子量 | 値: 0.340 MDa / 実験値: YES |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
試料支持 | グリッドの材料: GOLD / グリッドのタイプ: UltrAuFoil |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
---|---|
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 700 nm |
試料ホルダ | 凍結剤: NITROGEN 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
撮影 | 電子線照射量: 54.4 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 撮影したグリッド数: 1 |
-
解析
EMソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CTF補正 | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性: C1 (非対称) | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.74 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 37681 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
精密化 | 交差検証法: NONE | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|