[日本語] English
万見
- PDB-8ssr: ZnFs 3-11 of CCCTC-binding factor (CTCF) Complexed with 35mer DNA... -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 8ssr
タイトルZnFs 3-11 of CCCTC-binding factor (CTCF) Complexed with 35mer DNA 35-20
要素
  • DNA (35-MER) Strand I
  • DNA (35-MER) Strand II
  • Transcriptional repressor CTCF
キーワードTRANSCRIPTION/DNA / PROTEIN-DNA COMPLEX / DNA BINDING PROTEIN / transcription factor / zinc fingers / insulator/chromatin architecture / transcription-dna complex / TRANSCRIPTION
機能・相同性
機能・相同性情報


chromatin loop anchoring activity / chromatin insulator sequence binding / regulation of centromeric sister chromatid cohesion / protein localization to chromosome, centromeric region / genomic imprinting / chromatin looping / cardiac muscle cell development / DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation / negative regulation of gene expression via chromosomal CpG island methylation / chromosome, centromeric region ...chromatin loop anchoring activity / chromatin insulator sequence binding / regulation of centromeric sister chromatid cohesion / protein localization to chromosome, centromeric region / genomic imprinting / chromatin looping / cardiac muscle cell development / DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation / negative regulation of gene expression via chromosomal CpG island methylation / chromosome, centromeric region / condensed chromosome / epigenetic regulation of gene expression / transcription coregulator binding / male germ cell nucleus / mitochondrion organization / chromosome segregation / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / Activation of anterior HOX genes in hindbrain development during early embryogenesis / sequence-specific double-stranded DNA binding / gene expression / sequence-specific DNA binding / in utero embryonic development / transcription cis-regulatory region binding / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of cell population proliferation / negative regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of gene expression / regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of DNA-templated transcription / nucleolus / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding / nucleoplasm / nucleus
類似検索 - 分子機能
: / : / C2H2 zinc finger / Zinc finger, C2H2 type / zinc finger / Zinc finger C2H2 type domain profile. / Zinc finger C2H2 superfamily / Zinc finger C2H2 type domain signature. / Zinc finger C2H2-type
類似検索 - ドメイン・相同性
DNA / DNA (> 10) / Transcriptional repressor CTCF
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.14 Å
データ登録者Horton, J.R. / Yang, J. / Cheng, X.
資金援助 米国, 2件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM049245-23 米国
Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT)RR160029 米国
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2023
タイトル: Structures of CTCF-DNA complexes including all 11 zinc fingers.
著者: Yang, J. / Horton, J.R. / Liu, B. / Corces, V.G. / Blumenthal, R.M. / Zhang, X. / Cheng, X.
履歴
登録2023年5月8日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02023年8月2日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年9月20日Group: Data collection / Database references
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / citation_author
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Transcriptional repressor CTCF
B: DNA (35-MER) Strand I
C: DNA (35-MER) Strand II
D: Transcriptional repressor CTCF
E: DNA (35-MER) Strand I
F: DNA (35-MER) Strand II
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)112,34325
ポリマ－111,1856
非ポリマー1,15819
水00
1
A: Transcriptional repressor CTCF
B: DNA (35-MER) Strand I
C: DNA (35-MER) Strand II
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)56,22714
ポリマ－55,5923
非ポリマー63511
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
2
D: Transcriptional repressor CTCF
E: DNA (35-MER) Strand I
F: DNA (35-MER) Strand II
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)56,11611
ポリマ－55,5923
非ポリマー5238
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)362.211, 68.090, 61.988
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 94.870, 90.000
Int Tables number5
Space group name H-MC121
Space group name HallC2y
Symmetry operation#1: x,y,z
#2: -x,y,-z
#3: x+1/2,y+1/2,z
#4: -x+1/2,y+1/2,-z

-
要素

#1: タンパク質 Transcriptional repressor CTCF / 11-zinc finger protein / CCCTC-binding factor / CTCFL paralog


分子量: 34055.461 Da / 分子数: 2 / 断片: Zinc finger domains 3-11 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CTCF / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / Variant (発現宿主): Codon Plus / 参照: UniProt: P49711
#2: DNA鎖 DNA (35-MER) Strand I


分子量: 10754.907 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)
#3: DNA鎖 DNA (35-MER) Strand II


分子量: 10781.948 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)
#4: 化合物
ChemComp-ZN / ZINC ION


分子量: 65.409 Da / 分子数: 17 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#5: 化合物 ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン


分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
研究の焦点であるリガンドがあるかN

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 3.43 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.09 %
結晶化温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 20-25%% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.0-6.5, 0.05-0.20M NaCl
PH範囲: 5.0-6.5

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年11月7日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 3.14→37.59 Å / Num. obs: 46861 / % possible obs: 95.7 % / 冗長度: 15.8 % / Biso Wilson estimate: 107.65 Å2 / CC1/2: 0.94 / Rpim(I) all: 0.061 / Net I/σ(I): 10.9
反射 シェル解像度: 3.14→3.26 Å / 冗長度: 7.1 % / Mean I/σ(I) obs: 1.1 / Num. unique obs: 3269 / CC1/2: 0.883 / Rpim(I) all: 0.338 / % possible all: 73.6

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.20.1_4487精密化
SERGUIデータ収集
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
PHENIX位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 3.14→37.59 Å / SU ML: 0.4676 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 38.3208
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2841 2353 5.05 %
Rwork0.2492 44203 -
obs0.2509 46556 90.56 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso mean: 203.25 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 3.14→37.59 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数4051 2856 19 0 6926
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.00277359
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.480710490
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.03141108
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0023858
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d24.59682981
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
3.14-3.210.3618590.37241087X-RAY DIFFRACTION37.52
3.21-3.280.37561060.37461880X-RAY DIFFRACTION64.67
3.28-3.350.35491110.37672075X-RAY DIFFRACTION74.23
3.35-3.440.40031300.37622469X-RAY DIFFRACTION84.03
3.44-3.530.37721350.36122545X-RAY DIFFRACTION90.6
3.53-3.630.34931450.342725X-RAY DIFFRACTION94.56
3.63-3.750.34811450.31542747X-RAY DIFFRACTION96.18
3.75-3.880.29721530.29962863X-RAY DIFFRACTION99.11
3.88-4.040.30881520.27412881X-RAY DIFFRACTION99.93
4.04-4.220.33581510.27242833X-RAY DIFFRACTION99.97
4.22-4.440.34911520.26312898X-RAY DIFFRACTION99.97
4.45-4.720.25991550.25432866X-RAY DIFFRACTION99.97
4.72-5.090.25671540.2452848X-RAY DIFFRACTION99.97
5.09-5.60.28331540.24562891X-RAY DIFFRACTION100
5.6-6.40.3231500.26092850X-RAY DIFFRACTION100
6.4-8.050.26711520.24592861X-RAY DIFFRACTION100
8.06-37.590.21831490.16832884X-RAY DIFFRACTION99.61
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
13.34305648087-2.251541761362.032869208512.846215736180.8517318681825.171747779221.580380322421.855320293830.0615185767443-5.1214169460.8155430032120.747919139815-0.915253102361.20720641089-1.968312839415.369712648560.203049125853-0.8517964373052.38959297686-0.06294110269392.04033911547-76.9158245457-8.41222342576-8.93858308945
21.03410074427-1.23029592608-2.773544380045.31931710612.816351528676.14061020243-0.09952656948960.263641736357-0.146164544138-0.185375117983-0.7072724505472.19778086378-1.24549803829-1.934949283160.4179040852470.933580382421-0.396905816371-0.4635835354842.341510328460.2198882332681.93078690447-79.1242719854-27.30405842175.04712656467
33.39590229264-1.96185637882-2.479195144255.7329730914-0.08303309569932.460459415540.409829508980.835941996070.0966229926029-2.194698312530.4234253414532.19481840739-1.242243409-0.245292763552-0.958769610941.67914290257-0.499572671021-0.1705910260321.352352631460.2416775252050.473185965927-54.8163843-26.66238594142.57394880622
41.28065727466-0.0703472095268-1.058660458055.10368583625-0.163065291696.54151392347-0.2262341777520.0994641500989-0.127959078554-0.04368390098440.230354002128-0.950157593947-2.24348751048-0.280468802225-0.006594625667171.11617838065-0.102565286071-0.2042109371741.261019114840.4368371470770.690780647224-55.5596931041-24.232042203232.2895697579
55.58718048457-3.505956602485.071961417092.18840297468-3.175383277144.70909439527-0.6377869517930.3404783794580.1907602159790.3986555360750.762251507663-1.65921911367-0.1356545689781.177522329790.2187842946410.8809779256290.098388455191-0.5642319902931.710756823480.2167994771711.45963649535-41.0831167993-31.290279239150.112295323
67.18816001024-5.55332949277-1.026483553694.35044271507-0.03987085917774.91077551470.62870754871.31502744425-1.45143976305-0.849040858038-0.3291453746540.274502333480.0971910556593-0.476019777405-0.2062793872361.01279850051-0.107755613954-0.4813272329061.30790065068-0.06635381503771.52641771405-13.3113620945-41.95145447950.1332793764
72.028545504361.96624774261-0.7654794823739.869062386592.478531949563.181199311753.861300133121.559006886971.476752508081.938035587770.309272706071-1.091269239460.272030744733-0.722515040539-4.321631723452.463725532930.133746252320.03703456578342.259883048710.440376349892.71497996948-4.18676056336-20.228320373150.2151428566
84.84567370945-3.113120130814.338557149492.86809565135-3.938527106095.14526823660.505349243232-0.348761762049-1.68689312583-1.608456329640.2522696292192.71168636387-1.73933303941-2.25556430131-0.4237312194353.067022273830.270934296689-1.587941698462.328354439780.1822629912172.23088005037-71.3215454288-23.83025906581.29365328901
99.128866374610.5247336446656.663392635850.651686261546-1.757915232024.72549739117-0.7671657923630.00399561086834-0.5921123518680.260271121330.463425157027-1.26356527646-0.7876527094860.6816535834070.5018979524471.275867751950.0703364143519-0.5316816942942.01323090665-0.03898728646361.5863502102-29.7441000955-33.024556605238.520951741
104.21212729267-3.271572845952.850647625538.267940206731.137312521564.95484680920.9312830883621.51562295613-0.872728615712-0.567567902565-0.4088852309350.4717030837020.1630349152071.00456310332-0.1652854568511.15497746241-0.278635771296-0.7778672741622.423656510090.343884752482.16148942657-17.7200460985-34.221544952651.0909727831
115.00005446156-0.5208484834691.989523969726.36140122456-0.2166506631225.13924779283-0.714175770584-0.136557392419-0.4583948307690.3650874548420.938743317216-0.557276746184-0.6634760274380.982413654298-0.04270945014011.21199472526-0.0698735305831-0.1210210178241.370799846060.02724818831480.570919051689-47.1432394737-31.551658079921.6377501642
122.814347608540.9255506101390.5021340604415.98291851854-2.924399120022.97933312942-1.02613089693-0.470438668738-0.773061089806-2.24818913378-0.7175676859330.032023185488-3.02303145376-1.565416862361.570110723193.311767616070.668325566258-1.251597358982.53910474813-0.1391867875412.2306854292-75.9017907269-21.3348106657-5.98721432918
130.759643589215-0.397158994354-0.03550649471540.258740859651-0.08370393555470.0955758648327-1.3636400291-0.5500155905010.7600118459864.992764298390.612992801604-0.711446829675-1.917343185430.847708030920.7040341415516.2469535121-1.02263215467-0.9379579389452.377833045880.407124341473.5973511565-20.3832635405-51.458721861780.0588484859
143.381259111122.57626512022-0.9057557113473.74761495923-4.416274317958.082186715371.40100019504-4.05430188599-0.6641357161721.90152418357-2.07989088862-0.568441066019-2.019620058112.663966517880.6583855745691.36899711456-0.662426146697-0.1623945548043.46909428581-0.1972809835091.99121948089-21.79530738-61.557739977463.3623567381
153.853212843926.021478102270.4342421654689.415128139270.6754648123286.01220363598-1.08091891331.24426446675-0.5351920427610.4456863266821.11541553458-0.3031443962050.4598871869921.161348499940.6428152982861.67222519732-0.570222261407-1.289641964730.1128077074150.9067493162843.93866646445-38.3915190859-76.276860673466.098030075
165.94242836598-2.716430818561.615062451255.90765028143-4.895870954153.88661351217-0.7640104518790.0583487983421-2.96778677972-1.263525209230.132878109175-1.128883621251.09749316426-0.00160436600333-0.33106323621.48398104502-0.38594374176-1.057968488190.9151396461720.5223888866211.02321192806-54.8170132342-52.55353595461.4771651657
171.483198012282.2556065914-2.363998568837.82455586023-6.144285165415.701161091461.405302284640.68787548451-0.983076597716-2.389176951550.6085229913054.127517684451.67832715442-1.27201732705-1.098560693031.67013427543-0.401578114643-0.9290287693111.066328914130.2677657132881.71737526426-64.5811247837-47.735598330653.7325103209
184.2989470446-3.04571117727-1.218075813312.874650731150.8004278902965.339764538010.1927623999971.375439328781.32059471562-0.3104024086120.270340349736-1.17397441303-0.317122803997-0.374486230669-0.3659190718891.98171083345-0.590980176147-0.8153264500471.974567784360.5982701680422.49341831133-72.44968014-46.822753327425.8734321981
195.7365240841-3.345720323483.734051788883.708667976820.6622056058737.27712504542-1.083949074380.553258068378-1.687387794250.2387324621431.449305946-0.431534963074-0.6071899712742.72657242882-0.8301160083062.05554676129-0.469479734634-0.8640862437372.15826038771-0.04089530855412.23402650571-86.8257395244-68.685426773621.2289756438
205.28673050954-1.598227127881.699612641498.060166355221.645003412341.126104541-0.979843592099-0.983958357183-0.264077346363-0.2816045391052.03603630315-0.750557292413-2.10307008248-1.51934329436-1.283682175313.495941675460.2748495275560.03445839278152.82470295630.6106156147092.28772518167-19.8992345484-67.209680144181.8752560777
217.625488733250.5344347952175.171417313862.94504927928-0.5211937264127.211805635-0.7188130118440.7857515937630.683913976546-0.4993738428860.1899924724230.401367910276-0.0825304676696-0.8324241918810.3169001427851.72190230007-0.391685798114-0.2889701794821.50149042782-0.1107496485181.46549055982-61.353904273-59.565971731143.5492027867
227.37785689703-0.2139214421236.139639800274.157020035530.6357286044367.69629959316-0.95536038892.911512896090.774314234297-0.112399266141-0.746857167131-1.08494080951.500027926360.1061869026851.664024926332.47661224742-0.858495205369-0.6954203088972.755603962790.1434861989391.81461044871-79.8335123777-55.47410172927.1338349211
233.62239105114-0.634805623857-3.791704831536.32195003868-2.979959408817.23221304174-0.597852576625-0.36704822625-1.231371740050.1737218496340.360531887649-0.157784778782-1.790367079620.5539775997220.1152269345671.51390118153-0.152861577191-0.7318906360941.118109428330.139306585731.88185615311-42.967517086-62.887016661959.7787680976
245.733530455951.80753172904-7.264016948990.566681400186-2.298563604329.21330595492-2.30673233418-2.34632597203-2.12125588194-0.224615983106-2.42914105086-2.14943433222-3.8103892343-1.627974498694.730603851393.23471295289-0.153926212228-0.8269573083436.142331633820.7425217028423.11444406005-11.7699066245-72.11409223584.2971157894
精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
11chain 'A' and (resid 319 through 344 )AA319 - 3441 - 26
22chain 'A' and (resid 345 through 390 )AA345 - 39027 - 72
33chain 'A' and (resid 391 through 429 )AA391 - 42973 - 111
44chain 'A' and (resid 430 through 478 )AA430 - 478112 - 160
55chain 'A' and (resid 479 through 506 )AA479 - 506161 - 188
66chain 'A' and (resid 507 through 566 )AA507 - 566189 - 248
77chain 'A' and (resid 567 through 578 )AA567 - 578249 - 260
88chain 'B' and (resid 1 through 15 )BK1 - 15
99chain 'B' and (resid 16 through 35 )BK16 - 35
1010chain 'C' and (resid 1 through 10 )CL1 - 10
1111chain 'C' and (resid 11 through 25 )CL11 - 25
1212chain 'C' and (resid 26 through 35 )CL26 - 35
1313chain 'D' and (resid 349 through 373 )DM349 - 3731 - 25
1414chain 'D' and (resid 374 through 402 )DM374 - 40226 - 54
1515chain 'D' and (resid 403 through 429 )DM403 - 42955 - 81
1616chain 'D' and (resid 430 through 478 )DM430 - 47882 - 130
1717chain 'D' and (resid 479 through 491 )DM479 - 491131 - 143
1818chain 'D' and (resid 492 through 545 )DM492 - 545144 - 197
1919chain 'D' and (resid 546 through 578 )DM546 - 578198 - 230
2020chain 'E' and (resid 1 through 10 )EV1 - 10
2121chain 'E' and (resid 11 through 35 )EV11 - 35
2222chain 'F' and (resid 1 through 10 )FW1 - 10
2323chain 'F' and (resid 11 through 30 )FW11 - 30
2424chain 'F' and (resid 31 through 35 )FW31 - 35

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る