登録情報 データベース : PDB / ID : 8p61 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of O'nyong'nyong virus capsid protease (106-256) 要素Capsid protein 詳細 キーワード VIRUS / Capsid protease / Onyongnyong virus / Alphaviruses機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
togavirin / T=4 icosahedral viral capsid / symbiont-mediated suppression of host toll-like receptor signaling pathway / host cell cytoplasm / symbiont entry into host cell / serine-type endopeptidase activity / fusion of virus membrane with host endosome membrane / host cell nucleus / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane ... togavirin / T=4 icosahedral viral capsid / symbiont-mediated suppression of host toll-like receptor signaling pathway / host cell cytoplasm / symbiont entry into host cell / serine-type endopeptidase activity / fusion of virus membrane with host endosome membrane / host cell nucleus / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / structural molecule activity / virion membrane / proteolysis / RNA binding / membrane 類似検索 - 分子機能 Alphavirus E2 glycoprotein, domain B / Peptidase S3, togavirin / Alphavirus E2 glycoprotein / Alphavirus E3 spike glycoprotein / Alphavirus E1 glycoprotein / Alphavirus E2 glycoprotein, domain A / Alphavirus E2 glycoprotein, domain C / Alphavirus E2 glycoprotein / Alphavirus core protein / Alphavirus E3 glycoprotein ... Alphavirus E2 glycoprotein, domain B / Peptidase S3, togavirin / Alphavirus E2 glycoprotein / Alphavirus E3 spike glycoprotein / Alphavirus E1 glycoprotein / Alphavirus E2 glycoprotein, domain A / Alphavirus E2 glycoprotein, domain C / Alphavirus E2 glycoprotein / Alphavirus core protein / Alphavirus E3 glycoprotein / Alphavirus E1 glycoprotein / Alphavirus core protein (CP) domain profile. / Flavivirus/Alphavirus glycoprotein, immunoglobulin-like domain superfamily / Flavivirus glycoprotein, central and dimerisation domain superfamily / Flaviviral glycoprotein E, dimerisation domain / Immunoglobulin E-set / Peptidase S1, PA clan, chymotrypsin-like fold / Peptidase S1, PA clan 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 O'nyong-nyong virus strain Gulu (ウイルス)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.9 Å 詳細データ登録者 Plewka, J. / Chykunova, Y. / Wilk, P. / Sienczyk, M. / Dubin, G. / Pyrc, K. 資金援助 ポーランド, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Polish National Science Centre UMO-2017/27/B/NZ6/02488 ポーランド
引用ジャーナル : Int.J.Biol.Macromol. / 年 : 2024タイトル : Autoinhibition of suicidal capsid protease from O'nyong'nyong virus.著者 : Chykunova, Y. / Plewka, J. / Wilk, P. / Sienczyk, M. / Dubin, G. / Pyrc, K. 履歴 登録 2023年5月24日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2024年3月6日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 2.0 2024年5月15日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : atom_site / pdbx_poly_seq_scheme ... atom_site / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_planes / pdbx_validate_torsion / struct_conf / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif / struct_sheet_range Item : _atom_site.auth_seq_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num ... _atom_site.auth_seq_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_planes.auth_seq_id / _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id / _struct_conf.beg_auth_seq_id / _struct_conf.end_auth_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num / _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id / _struct_sheet_range.end_auth_seq_id