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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 8ozu | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Fucosidase crystal structure | ||||||
Components | Alpha-L-fucosidase | ||||||
Keywords | SUGAR BINDING PROTEIN / Fucosidase | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationalpha-L-fucosidase activity / fucose metabolic process / glycoside catabolic process / lysosome Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | Lacticaseibacillus casei (bacteria) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MAD / Resolution: 2.25 Å | ||||||
Authors | Gallego del Sol, F. / Marina, A. | ||||||
| Funding support | Spain, 1items
| ||||||
Citation | Journal: Int.J.Biol.Macromol. / Year: 2025Title: Unveiling the structural bases of alpha-L-fucosidase B activity through mutants boosting transfucosylation efficiency. Authors: Becerra, J.E. / Gallego Del Sol, F. / Rubio-Del-Campo, A. / Rodriguez-Diaz, J. / Monedero, V. / Marina, A. / Yebra, M.J. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 8ozu.cif.gz | 3.1 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb8ozu.ent.gz | 2 MB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 8ozu.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 8ozu_validation.pdf.gz | 505.6 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 8ozu_full_validation.pdf.gz | 542.9 KB | Display | |
| Data in XML | 8ozu_validation.xml.gz | 137 KB | Display | |
| Data in CIF | 8ozu_validation.cif.gz | 180 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oz/8ozu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oz/8ozu | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 9hy7C ![]() 9hyjC ![]() 9hyxC ![]() 9hz1C C: citing same article ( |
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| Similar structure data | Similarity search - Function & homology F&H Search |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Auth asym-ID: A / Label asym-ID: A
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Lacticaseibacillus casei (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
Spain, 1items
Citation



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