PDB-8ofv: Human adenovirus type 53 fiber-knob protein complexed with sialic acid

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8ofv

タイトル

Human adenovirus type 53 fiber-knob protein complexed with sialic acid

要素

Fiber protein

キーワード

VIRAL PROTEIN / Adenovirus / Fiber knob / Ad25

機能・相同性

機能・相同性情報

viral capsid / cell adhesion / symbiont entry into host cell / host cell nucleus / virion attachment to host cell
類似検索 - 分子機能

生物種

Human adenovirus 53 (ヒトアデノウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.77 Å

データ登録者

Rizkallah, P.J. / Parker, A.L. / Mundy, R.M. / Baker, A.T.

資金援助

英国, 2件

引用

ジャーナル: Npj Viruses / 年: 2023
タイトル: Broad sialic acid usage amongst species D human adenovirus.
著者: Mundy, R.M. / Baker, A.T. / Bates, E.A. / Cunliffe, T.G. / Teijeira-Crespo, A. / Moses, E. / Rizkallah, P.J. / Parker, A.L.

履歴

登録	2023年3月16日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年9月20日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月11日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD ..._citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.title
改定 1.2	2024年5月8日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ISSN / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb8ofv.ent.gz	767.1 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8ofv_validation.pdf.gz	1.2 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8ofv_full_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示
XML形式データ	8ofv_validation.xml.gz	104.2 KB	表示
CIF形式データ	8ofv_validation.cif.gz	142.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/of/8ofv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/of/8ofv	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	8ofpC 8ofqC 8ofrC 8ofsC 8oftC 8ofuC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#132 - 2010年12月アデノウイルス (Adenovirus) 類似性 (6) #113 - 2009年5月インフルエンザノイラミニダーゼ (Influenza Neuraminidase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Fiber protein

B: Fiber protein

C: Fiber protein

D: Fiber protein

E: Fiber protein

F: Fiber protein

G: Fiber protein

H: Fiber protein

I: Fiber protein

J: Fiber protein

K: Fiber protein

L: Fiber protein

ヘテロ分子

261 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Fiber protein

B: Fiber protein

C: Fiber protein

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
根拠: homology
65.6 kDa, 3 ポリマー
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2

D: Fiber protein

E: Fiber protein

F: Fiber protein

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
65 kDa, 3 ポリマー
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3

G: Fiber protein

H: Fiber protein

I: Fiber protein

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
65.4 kDa, 3 ポリマー
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4

J: Fiber protein

K: Fiber protein

L: Fiber protein

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
64.9 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	93.555, 60.406, 243.686
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 99.88, 90.00
Int Tables number	3
Space group name H-M	P121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSアンサンブル:

-
タンパク質 , 1種, 12分子 ABCDEFGHIJKL

#1: タンパク質	Fiber protein 分子量: 21325.182 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human adenovirus 53 (ヒトアデノウイルス) 遺伝子: L5 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: E5RWD1

-
糖 , 2種, 2分子

#5: 糖

ChemComp-SLB / N-acetyl-beta-neuraminic acid / N-acetylneuraminic acid / sialic acid / O-sialic acid / 5-N-ACETYL-BETA-D-NEURAMINIC ACID / BETA-SIALIC ACID / N-アセチル-β-ノイラミン酸

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 309.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₉NO₉ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

識別子	タイプ	プログラム
DNeup5Acb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-neuraminic acid	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-Neup5Ac	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
Neu5Ac	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#6: 糖

ChemComp-SIA / N-acetyl-alpha-neuraminic acid / N-acetylneuraminic acid / sialic acid / alpha-sialic acid / O-SIALIC ACID / N-アセチル-α-ノイラミン酸

タイプ: D-saccharide, alpha linking / 分子量: 309.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₉NO₉

識別子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-a-D-neuraminic acid	COMMON NAME	GMML 1.0
a-D-Neup5Ac	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
Neu5Ac	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 4種, 1582分子

#2: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 11 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 化合物	ChemComp-P4G / 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE / ジエチレングリコ-ルジエチルエ-テル分子量: 162.227 Da / 分子数: 11 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈O₃
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1542 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.65 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.6 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4 / 詳細: 0.1 M PCTP buffer, 25 % w/v PEG 1500

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I04-1 / 波長: 0.91188 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年12月14日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.91188 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.77→92.17 Å / Num. obs: 258349 / % possible obs: 98.7 % / 冗長度: 3.8 % / B_iso Wilson estimate: 17.4 Å² / CC_1/2: 0.685 / R_merge(I) obs: 0.168 / R_pim(I) all: 0.097 / R_rim(I) all: 0.195 / Net I/σ(I): 6
反射シェル	解像度: 1.77→1.8 Å / 冗長度: 3.9 % / R_merge(I) obs: 1.707 / Mean I/σ(I) obs: 0.6 / Num. unique obs: 12686 / CC_1/2: 0.327 / R_pim(I) all: 0.966 / R_rim(I) all: 1.967 / % possible all: 97.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0267	精密化
DIALS		データスケーリング
xia2		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.77→92.17 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.95 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.941 / SU B: 9.269 / SU ML: 0.134 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.13 / ESU R Free: 0.117 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.22826	12949	5 %	RANDOM
R_work	0.20838	-	-	-
obs	0.20937	245379	98.67 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 27.311 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.3 Å²	0 Å²	-0.7 Å²
2-	-	0.62 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.64 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 1.77→92.17 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17596	0	333	1542	19471

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.013	0.013	18741
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.015	17827
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.537	1.656	25383
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.321	1.58	41186
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	7.946	5	2295
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.565	24.078	841
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.65	15	3208
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.865	15	51
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.091	0.2	2541
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.009	0.02	22696
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.002	0.02	4302
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.687	0.68	9084
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.687	0.68	9083
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.268	1.013	11411
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	1.268	1.013	11412
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.739	0.825	9656
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	0.739	0.825	9657
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	1.134	1.151	13973
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	7.067	9.351	21431
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	7.018	8.697	21064
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	6165	0.1
1	2	B	6165	0.1
2	1	A	6127	0.09
2	2	C	6127	0.09
3	1	A	6276	0.08
3	2	D	6276	0.08
4	1	A	6140	0.1
4	2	E	6140	0.1
5	1	A	5737	0.11
5	2	F	5737	0.11
6	1	A	5961	0.09
6	2	G	5961	0.09
7	1	A	6258	0.08
7	2	H	6258	0.08
8	1	A	6121	0.1
8	2	I	6121	0.1
9	1	A	6401	0.07
9	2	J	6401	0.07
10	1	A	6189	0.09
10	2	K	6189	0.09
11	1	A	5706	0.11
11	2	L	5706	0.11
12	1	B	6322	0.09
12	2	C	6322	0.09
13	1	B	6260	0.1
13	2	D	6260	0.1
14	1	B	6525	0.07
14	2	E	6525	0.07
15	1	B	5756	0.11
15	2	F	5756	0.11
16	1	B	5881	0.1
16	2	G	5881	0.1
17	1	B	6387	0.08
17	2	H	6387	0.08
18	1	B	6448	0.08
18	2	I	6448	0.08
19	1	B	6163	0.1
19	2	J	6163	0.1
20	1	B	6450	0.06
20	2	K	6450	0.06
21	1	B	5687	0.11
21	2	L	5687	0.11
22	1	C	6264	0.09
22	2	D	6264	0.09
23	1	C	6323	0.09
23	2	E	6323	0.09
24	1	C	5819	0.09
24	2	F	5819	0.09
25	1	C	5901	0.1
25	2	G	5901	0.1
26	1	C	6390	0.08
26	2	H	6390	0.08
27	1	C	6322	0.08
27	2	I	6322	0.08
28	1	C	6140	0.09
28	2	J	6140	0.09
29	1	C	6337	0.07
29	2	K	6337	0.07
30	1	C	5731	0.09
30	2	L	5731	0.09
31	1	D	6141	0.09
31	2	E	6141	0.09
32	1	D	5666	0.1
32	2	F	5666	0.1
33	1	D	5834	0.1
33	2	G	5834	0.1
34	1	D	6230	0.08
34	2	H	6230	0.08
35	1	D	6106	0.09
35	2	I	6106	0.09
36	1	D	6164	0.08
36	2	J	6164	0.08
37	1	D	6222	0.08
37	2	K	6222	0.08
38	1	D	5566	0.11
38	2	L	5566	0.11
39	1	E	5691	0.11
39	2	F	5691	0.11
40	1	E	5824	0.1
40	2	G	5824	0.1
41	1	E	6319	0.08
41	2	H	6319	0.08
42	1	E	6451	0.06
42	2	I	6451	0.06
43	1	E	6084	0.1
43	2	J	6084	0.1
44	1	E	6382	0.06
44	2	K	6382	0.06
45	1	E	5614	0.11
45	2	L	5614	0.11
46	1	F	5785	0.09
46	2	G	5785	0.09
47	1	F	5767	0.1
47	2	H	5767	0.1
48	1	F	5697	0.11
48	2	I	5697	0.11
49	1	F	5756	0.1
49	2	J	5756	0.1
50	1	F	5762	0.1
50	2	K	5762	0.1
51	1	F	5716	0.09
51	2	L	5716	0.09
52	1	G	5854	0.1
52	2	H	5854	0.1
53	1	G	5762	0.11
53	2	I	5762	0.11
54	1	G	5902	0.09
54	2	J	5902	0.09
55	1	G	5824	0.1
55	2	K	5824	0.1
56	1	G	5686	0.11
56	2	L	5686	0.11
57	1	H	6345	0.08
57	2	I	6345	0.08
58	1	H	6242	0.08
58	2	J	6242	0.08
59	1	H	6373	0.07
59	2	K	6373	0.07
60	1	H	5698	0.1
60	2	L	5698	0.1
61	1	I	6226	0.09
61	2	J	6226	0.09
62	1	I	6477	0.06
62	2	K	6477	0.06
63	1	I	5737	0.1
63	2	L	5737	0.1
64	1	J	6143	0.09
64	2	K	6143	0.09
65	1	J	5690	0.11
65	2	L	5690	0.11
66	1	K	5646	0.1
66	2	L	5646	0.1

LS精密化シェル

解像度: 1.77→1.816 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.342	865	-
R_work	0.337	17767	-
obs	-	-	97.06 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.0488	0.5711	-0.1781	1.1074	0.1373	1.0977	0.0037	0.1634	-0.0827	-0.062	0.025	-0.0261	0.0445	0.1318	-0.0286	0.0331	0.0109	0.0769	0.0353	-0.0132	0.3144	15.977	18.127	14.255
2	1.0094	0.0651	-0.1401	1.5792	-0.1793	2.1626	0.0179	0.0077	0.1013	0.0145	-0.0319	0.0543	-0.0835	-0.1172	0.014	0.0146	0.0027	0.0595	0.008	-0.0141	0.3542	0.74	38.823	23.41
3	1.6985	-0.1449	0.5033	2.0828	0.0718	1.1628	-0.0088	-0.1365	0.0318	0.1778	-0.0173	-0.0601	0.0071	0.1293	0.0261	0.067	0.0091	0.0632	0.0762	-0.0232	0.2811	23.931	32.388	35.948
4	1.3986	-0.187	-0.3378	1.1621	0.3502	1.6645	0.0274	0.008	0.015	0.0695	-0.0108	-0.1436	-0.126	0.3488	-0.0166	0.2396	-0.0352	0.0935	0.1017	0.0076	0.324	44.917	46.229	85.308
5	1.1432	-0.1114	0.3525	1.6147	-0.0301	1.3666	0.0597	-0.032	-0.1092	0.003	-0.0549	0.0655	0.1163	-0.0519	-0.0048	0.2546	-0.0144	0.1164	0.0214	-0.0047	0.3038	27.572	25.619	89.175
6	0.7029	0.2546	-0.1235	2.4969	-0.5409	2.418	0.0266	0.1579	-0.0548	-0.0898	-0.018	0.0411	0.1595	0.0796	-0.0086	0.22	0.0366	0.0671	0.1159	-0.0431	0.3054	34.307	32.777	64.23
7	1.4361	-0.5407	-0.609	3.2759	0.0706	1.4711	-0.087	-0.2563	-0.0927	0.2889	0.0548	0.1734	0.0525	-0.2105	0.0322	0.1479	0.0213	0.1067	0.1627	0.0365	0.3197	-36.525	13.345	43.252
8	2.5685	0.3484	-0.1695	1.4289	-0.3676	1.0549	-0.0027	0.1606	0.0138	-0.096	0.0065	0.0991	-0.0542	-0.2009	-0.0037	0.0396	0.0168	0.0816	0.0496	-0.0052	0.3232	-34.486	26.938	19.591
9	1.1626	0.0012	0.2659	1.7665	-0.0235	1.6297	0.035	-0.0066	-0.1418	0.091	-0.0267	0.0285	0.0982	0.0826	-0.0083	0.0476	0.0047	0.1093	0.005	0.006	0.3528	-17.668	6.535	25.376
10	1.1907	-0.4518	-0.4688	1.1085	0.2032	1.9711	-0.0227	-0.1814	-0.0987	0.0816	0.0391	0.0862	0.0803	-0.118	-0.0164	0.2426	-0.0195	0.1073	0.0838	0.022	0.3507	4.676	37.148	116.282
11	1.2431	-0.053	0.1933	1.5208	0.3598	2.0589	0.0416	0.0584	0.0932	-0.0296	-0.0308	0.034	-0.1354	0.0298	-0.0108	0.2408	-0.0039	0.1226	0.0261	0.0117	0.3598	12.924	57.549	100.208
12	2.1311	0.4333	0.0071	3.0289	-0.2591	1.1118	0.0047	0.0382	0.1097	-0.141	0.0317	0.355	-0.0317	-0.3885	-0.0364	0.2527	0.035	0.0823	0.2492	0.0224	0.4523	-12.935	50.72	100.6
13	2.9332	-0.4666	-5.6957	0.4002	1.1337	11.2297	0.0793	-0.0635	-0.1272	-0.0002	-0.3284	0.0198	-0.2053	-0.112	0.2492	0.3647	-0.0021	-0.0331	0.3692	0.0026	0.3209	26.937	50.242	76.338
14	11.7029	-5.9418	-1.1273	11.3195	2.242	11.5199	0.4898	0.0941	0.0748	-0.1846	-0.3401	-0.0019	-0.0221	0.1113	-0.1497	0.3474	-0.0113	-0.0072	0.3108	0.009	0.3086	0.7	33.253	97.095

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	182 - 366
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	178 - 366
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	179 - 366
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	180 - 366
5	X-RAY DIFFRACTION	5	E	178 - 366
6	X-RAY DIFFRACTION	6	F	183 - 366
7	X-RAY DIFFRACTION	7	G	183 - 366
8	X-RAY DIFFRACTION	8	H	179 - 366
9	X-RAY DIFFRACTION	9	I	178 - 366
10	X-RAY DIFFRACTION	10	J	182 - 366
11	X-RAY DIFFRACTION	11	K	180 - 366
12	X-RAY DIFFRACTION	12	L	183 - 366
13	X-RAY DIFFRACTION	13	F	404
14	X-RAY DIFFRACTION	14	L	404

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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