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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8jpy | |||||||||||||||
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タイトル | Solution NMR Structure of Zinc-fingers 1 and 2 (fragment 257-320) from human Insulinoma-associated protein 1(INSM1) | |||||||||||||||
![]() | Insulinoma-associated protein 1 | |||||||||||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / Transcription / Repressor | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() adrenal chromaffin cell differentiation / Regulation of gene expression in endocrine-committed (NEUROG3+) progenitor cells / pancreatic A cell differentiation / noradrenergic neuron development / type B pancreatic cell differentiation / transdifferentiation / norepinephrine biosynthetic process / regulation of cell cycle process / sympathetic ganglion development / type B pancreatic cell development ...adrenal chromaffin cell differentiation / Regulation of gene expression in endocrine-committed (NEUROG3+) progenitor cells / pancreatic A cell differentiation / noradrenergic neuron development / type B pancreatic cell differentiation / transdifferentiation / norepinephrine biosynthetic process / regulation of cell cycle process / sympathetic ganglion development / type B pancreatic cell development / positive regulation of neural precursor cell proliferation / regulation of protein-containing complex assembly / transcription repressor complex / cyclin binding / negative regulation of protein phosphorylation / positive regulation of cell differentiation / neuron differentiation / chromatin DNA binding / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / histone deacetylase binding / cell migration / regulation of gene expression / cell population proliferation / molecular adaptor activity / regulation of cell cycle / positive regulation of cell migration / cell cycle / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of cell population proliferation / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm / nucleus / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | |||||||||||||||
![]() | He, X.L. / Yang, Y.H. | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Solution NMR Structure of Zinc-fingers 1 and 2 (fragment 257-320) from human Insulinoma-associated protein 1(INSM1) 著者: He, X.L. / Yang, Y.H. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 401.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 335.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 534.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 717.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 47.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7287.485 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM ...内容: 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 0.69 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZF3 protein, 90% H2O/10% D2O Label: 13C-15N_sample / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 0.69 mM / 構成要素: ZF3 protein / Isotopic labeling: [U-100% 13C; U-100% 15N] |
試料状態 | イオン強度: 100 mM / Label: conditions_1 / pH: 6.5 / 圧: ambient Pa / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 3 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |