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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8j0g | ||||||
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タイトル | GK monomer complexes with glutamate and ATP | ||||||
![]() | Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase B | ||||||
![]() | PLANT PROTEIN / L-proline biosynthesis / filamentous enzyme | ||||||
機能・相同性 | ![]() glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase activity / glutamate 5-kinase / glutamate 5-kinase activity / pollen development / embryo development ending in seed dormancy / L-proline biosynthetic process / proline biosynthetic process / plasmodesma / chloroplast ...glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase activity / glutamate 5-kinase / glutamate 5-kinase activity / pollen development / embryo development ending in seed dormancy / L-proline biosynthetic process / proline biosynthetic process / plasmodesma / chloroplast / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.7 Å | ||||||
![]() | Zhang, T. / Guo, C.J. / Liu, J.L. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: GK monomer complexes with glutamate and ATP 著者: Zhang, T. / Guo, C.J. / Liu, J.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 105.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 60.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 35902MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 78977.320 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: P5CSB, P5CS2, At3g55610, F1I16_20 / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P54888, glutamate 5-kinase, glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase #2: 化合物 | ChemComp-MG / | #3: 化合物 | ChemComp-GGL / | #4: 化合物 | ChemComp-ATP / | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: FILAMENT / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Arabidopsis thaliana P5CSB incubated with all substrates. タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2500 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1500 nm |
撮影 | 電子線照射量: 60 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: NONE |
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3次元再構成 | 解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 124110 / 対称性のタイプ: POINT |