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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8hhh | ||||||
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タイトル | The bacterial divisome protein complex FtsB-FtsL-FtsQ | ||||||
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![]() | MEMBRANE PROTEIN / Bacterial cell division / divisome / FtsB / FtsL / FtsQ / FtsBLQ / FtsQLB / membrane protein complex / heterotrimer | ||||||
機能・相同性 | ![]() cell septum assembly / cell septum / FtsZ-dependent cytokinesis / cell division site / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Nguyen, V.H.T. / Chen, X. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of the heterotrimeric membrane protein complex FtsB-FtsL-FtsQ of the bacterial divisome. 著者: Nguyen, H.T.V. / Chen, X. / Parada, C. / Luo, A.C. / Shih, O. / Jeng, U.S. / Huang, C.Y. / Shih, Y.L. / Ma, C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 184.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 146 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 451.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 456.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8hhfC ![]() 8hhgSC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 31467.660 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: ftsQ, A9X72_20810, ACU57_16060, BGM66_003029, BN17_45151, BO068_001919, BON68_06480, BON72_08970, BON73_04910, BON74_02170, BON75_16740, BON76_15060, BON77_21520, BON80_15910, BON89_27020, ...遺伝子: ftsQ, A9X72_20810, ACU57_16060, BGM66_003029, BN17_45151, BO068_001919, BON68_06480, BON72_08970, BON73_04910, BON74_02170, BON75_16740, BON76_15060, BON77_21520, BON80_15910, BON89_27020, BON93_20085, BON94_26730, BvCmsHHP019_03716, C5Y87_12070, CCS08_22990, CR538_21045, CTR35_001627, DAH19_13315, DAH50_07465, DS732_05370, DTL43_06330, DXT70_08670, E2119_07785, E2134_11600, E4K51_06165, E5P23_04335, E5P31_03955, E5P32_08015, E5P35_00730, E5P36_04260, E5P39_13665, E5P40_07375, E5P41_14185, E5P42_01010, E5P43_09200, E5P44_09730, E5P45_08355, E5P46_13085, E5P47_04370, E5P48_12150, E5P49_11070, E5P50_01390, E5S36_10750, E5S51_07905, EI021_04715, EIZ93_07570, EL79_3779, EL80_3726, ELT20_04095, ELT41_01600, ELX85_12445, F2N20_00540, F2N31_00540, F9V24_01135, FJQ40_06395, FOI11_013215, FOI11_22465, FV293_03270, FWK02_17275, GJO56_09885, GKF89_02115, GNW61_10395, GP944_03500, GP965_07730, GP979_06755, GRW05_06695, HMV95_04965, HX136_20990, IH768_05560, J0541_002403, JNP96_04660, NCTC11126_03516, NCTC13216_02643, NCTC8008_03748, NCTC8500_04640, NCTC9037_04264, NCTC9045_04807, NCTC9117_05152, NCTC9706_01498, SAMEA3751407_02594, SAMEA3752557_00798 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 13397.883 Da / 分子数: 1 / Mutation: E56A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
#3: タンパク質 | 分子量: 13646.827 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 71.49 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8 / 詳細: 0.1 M Tris pH 8.0, 20-35% PEG400 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: RAYONIX MX300-HS / 検出器: CCD / 日付: 2020年12月22日 |
放射 | モノクロメーター: liquid-nitrogen-cooling Si double-crystal プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.3→90.33 Å / Num. obs: 14819 / % possible obs: 99.83 % / 冗長度: 3.7 % / Rmerge(I) obs: 0.07429 / Net I/σ(I): 9.25 |
反射 シェル | 解像度: 3.3→3.56 Å / Rmerge(I) obs: 0.6163 / Num. unique obs: 1476 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 8HHG 解像度: 3.3→34.69 Å / SU ML: 0.48 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 39 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 279.05 Å2 / Biso mean: 127.6639 Å2 / Biso min: 30 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: final / 解像度: 3.3→34.69 Å
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / % reflection obs: 100 %
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精密化 TLS | 手法: refined / Origin x: -17.5432 Å / Origin y: -4.0766 Å / Origin z: -16.0345 Å
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精密化 TLSグループ |
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