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Yorodumi- PDB-8hcj: Structure of GH43 family enzyme, Xylan 1, 4 Beta- xylosidase from... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 8hcj | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Structure of GH43 family enzyme, Xylan 1, 4 Beta- xylosidase from pseudopedobacter saltans | ||||||
Components | Xylan 1,4-beta-xylosidase | ||||||
Keywords | HYDROLASE / GH43 family / Xylan / Xylosidase | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationxylan 1,4-beta-xylosidase / xylan 1,4-beta-xylosidase activity / xylan catabolic process / carbohydrate binding / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | Pseudopedobacter saltans DSM 12145 (bacteria) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.566 Å | ||||||
Authors | Vishwakarma, P. / Sachdeva, E. / Goyal, A. / Ethayathulla, A.S. / Das, U. / Kaur, P. | ||||||
| Funding support | India, 1items
| ||||||
Citation | Journal: Int.J.Biol.Macromol. / Year: 2024Title: Deciphering the structural and biochemical aspects of xylosidase from Pseudopedobacter saltans. Authors: Vishwakarma, P. / Sachdeva, E. / Thakur, A. / Ethayathulla, A.S. / Goyal, A. / Kaur, P. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 8hcj.cif.gz | 725.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb8hcj.ent.gz | 576.3 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 8hcj.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 8hcj_validation.pdf.gz | 6.5 MB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 8hcj_full_validation.pdf.gz | 6.5 MB | Display | |
| Data in XML | 8hcj_validation.xml.gz | 127 KB | Display | |
| Data in CIF | 8hcj_validation.cif.gz | 180.8 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hc/8hcj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hc/8hcj | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 4novS S: Starting model for refinement |
|---|---|
| Similar structure data | Similarity search - Function & homology F&H Search |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Auth asym-ID: D / Label asym-ID: A
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Pseudopedobacter saltans DSM 12145 (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
India, 1items
Citation
PDBj

